MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008268	CAT	2	6	1084902	1084907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008268	TCG	2	6	1084919	1084924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_008268	TGCG	2	8	1084929	1084936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_008268	GGA	2	6	1086352	1086357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008268	CAC	2	6	1086358	1086363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_008268	CGT	2	6	1087127	1087132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_008268	CT	3	6	1095174	1095179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_008268	GAA	2	6	1095224	1095229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008268	CCG	2	6	1096415	1096420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_008268	CCT	2	6	1098395	1098400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_008268	GCA	2	6	1099761	1099766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008268	TCGTG	2	10	1099788	1099797	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_008268	CGGG	2	8	1103966	1103973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_008268	GGC	2	6	1104759	1104764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008268	GCC	2	6	1105366	1105371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_008268	TGT	2	6	1105384	1105389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008268	CCA	2	6	1106986	1106991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_008268	CGG	2	6	1106994	1106999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_008268	CTC	2	6	1107020	1107025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_008268	GC	3	6	1108943	1108948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_008268	CGC	2	6	1108962	1108967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_008268	CG	3	6	1108985	1108990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_008268	GACG	2	8	1109010	1109017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_008268	CGC	2	6	1110968	1110973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_008268	CGC	2	6	1111000	1111005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_008268	GAT	2	6	1111036	1111041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008268	CGG	2	6	1111042	1111047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008268	CGC	2	6	1111057	1111062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_008268	CCGC	2	8	1111638	1111645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3030	NC_008268	TTC	2	6	1118346	1118351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_008268	GAC	2	6	1121987	1121992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008268	TTA	2	6	1124356	1124361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008268	CCGC	2	8	1124363	1124370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3034	NC_008268	CGC	2	6	1126546	1126551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_008268	CCG	2	6	1134191	1134196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_008268	GAA	2	6	1134212	1134217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008268	CT	3	6	1138103	1138108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_008268	CGG	2	6	1138165	1138170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008268	CG	3	6	1141338	1141343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_008268	ACGA	2	8	1143074	1143081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_008268	CG	3	6	1143145	1143150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_008268	GTTC	2	8	1143689	1143696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_008268	CCCG	2	8	1145180	1145187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3044	NC_008268	GAC	2	6	1148401	1148406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_008268	CCT	2	6	1148414	1148419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_008268	CAC	2	6	1148424	1148429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_008268	ACC	2	6	1148436	1148441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_008268	GCCG	2	8	1148518	1148525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_008268	TTC	2	6	1148526	1148531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008268	TCG	2	6	1148557	1148562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008268	GCC	2	6	1148605	1148610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_008268	GCTG	2	8	1148900	1148907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_008268	CG	3	6	1148917	1148922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_008268	AGCA	2	8	1149807	1149814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_008268	GCC	2	6	1150248	1150253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3057	NC_008268	CCTT	2	8	1150997	1151004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_008268	GCG	2	6	1151008	1151013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3060	NC_008268	CGG	2	6	1151835	1151840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008268	TCG	2	6	1151841	1151846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_008268	GT	3	6	1153806	1153811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3065	NC_008268	GC	3	6	1153935	1153940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_008268	CCG	2	6	1154645	1154650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_008268	GCC	2	6	1154666	1154671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_008268	CCA	2	6	1154684	1154689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_008268	GCC	2	6	1154701	1154706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_008268	CGT	2	6	1154725	1154730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_008268	CG	3	6	1154790	1154795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3078	NC_008268	TGG	2	6	1169277	1169282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_008268	CGGAG	2	10	1169416	1169425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3082	NC_008268	GGGT	2	8	1169445	1169452	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_008268	TGG	2	6	1176887	1176892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008268	GC	3	6	1176917	1176922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_008268	CGC	2	6	1176971	1176976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3099	NC_008268	TCG	2	6	1177033	1177038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_008268	ATGCG	2	10	1179726	1179735	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_008268	CGA	2	6	1179741	1179746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3104	NC_008268	CGGT	2	8	1182754	1182761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_008268	GC	3	6	1182798	1182803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3108	NC_008268	TCCC	2	8	1188977	1188984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3109	NC_008268	TTCG	2	8	1189000	1189007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_008268	GGGT	2	8	1189023	1189030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008268	AC	3	6	1189041	1189046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3113	NC_008268	CG	3	6	1190155	1190160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_008268	GCG	3	9	1191627	1191635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_008268	GA	3	6	1191653	1191658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008268	CGAG	2	8	1191670	1191677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_008268	GCC	2	6	1191708	1191713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3119	NC_008268	C	6	6	1191750	1191755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3120	NC_008268	CGA	2	6	1191760	1191765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_008268	TCG	2	6	1192277	1192282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_008268	TGT	2	6	1192320	1192325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008268	CA	3	6	1192336	1192341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_008268	CGG	2	6	1192378	1192383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_008268	CCG	2	6	1192788	1192793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_008268	ACC	2	6	1192841	1192846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_008268	CTT	2	6	1192847	1192852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_008268	CCGGG	2	10	1192868	1192877	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3129	NC_008268	CCGC	2	8	1194777	1194784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3130	NC_008268	GGC	2	6	1195708	1195713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_008268	CGG	2	6	1195715	1195720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_008268	CGA	2	6	1195722	1195727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_008268	GAC	2	6	1195828	1195833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3163	NC_008268	GGTT	2	8	1199710	1199717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_008268	GCG	2	6	1263071	1263076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_008268	GC	3	6	1263142	1263147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_008268	CGG	2	6	1263196	1263201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_008268	CTG	2	6	1263250	1263255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3255	NC_008268	C	6	6	1263310	1263315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3256	NC_008268	GCG	2	6	1263324	1263329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_008268	AC	3	6	1263368	1263373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_008268	CGG	2	6	1263384	1263389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_008268	CTGAA	2	10	1263922	1263931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3260	NC_008268	GGC	2	6	1264761	1264766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3389	NC_008268	CGG	2	6	1348518	1348523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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