MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008268	TCC	2	6	381564	381569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_008268	GACT	2	8	381577	381584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_008268	CG	3	6	381616	381621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008268	CCGTC	2	10	381632	381641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1005	NC_008268	GCC	2	6	381740	381745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_008268	CCA	2	6	381755	381760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_008268	CGGA	3	12	381764	381775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_008268	G	6	6	381825	381830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008268	C	6	6	381833	381838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_008268	TGAG	2	8	381839	381846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008268	G	6	6	383148	383153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008268	CG	3	6	383734	383739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_008268	GA	3	6	383749	383754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008268	CGG	2	6	383784	383789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008268	GCC	2	6	383795	383800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_008268	ACG	2	6	383899	383904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008268	CCAA	2	8	383926	383933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_008268	CAG	3	9	384006	384014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008268	AGC	3	9	384872	384880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008268	ACA	2	6	384899	384904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_008268	TTC	2	6	387683	387688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008268	CGC	2	6	387768	387773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_008268	CGC	2	6	387811	387816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_008268	CAT	2	6	387842	387847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008268	CGC	2	6	388496	388501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_008268	AGCA	2	8	388507	388514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_008268	CCG	2	6	389307	389312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_008268	CCG	2	6	389315	389320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008268	GCG	2	6	389915	389920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008268	GCC	2	6	389925	389930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_008268	GGA	2	6	389943	389948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008268	CTCG	2	8	389950	389957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_008268	CGG	2	6	389959	389964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008268	ACC	2	6	389997	390002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_008268	GCCG	2	8	390012	390019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_008268	CTTTCC	2	12	391329	391340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_008268	GCG	2	6	391375	391380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008268	GGC	2	6	391398	391403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008268	CCA	2	6	391410	391415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_008268	CACCC	2	10	391524	391533	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1041	NC_008268	CCG	2	6	391652	391657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_008268	CCGC	2	8	391664	391671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_008268	CG	3	6	391705	391710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_008268	AAT	2	6	393197	393202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008268	ACAG	2	8	394665	394672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_008268	GGA	2	6	394673	394678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008268	CCA	2	6	396688	396693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_008268	AAT	2	6	396703	396708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008268	GCC	2	6	396749	396754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_008268	TCG	2	6	398304	398309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008268	TAAT	2	8	398329	398336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008268	CA	3	6	398370	398375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008268	CAC	2	6	400095	400100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_008268	CCA	2	6	400217	400222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_008268	CCG	2	6	400678	400683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_008268	CGA	2	6	400690	400695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008268	CCCG	2	8	400697	400704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_008268	GTCAC	2	10	400719	400728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_008268	GCGCC	2	10	400758	400767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1060	NC_008268	CT	3	6	404453	404458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_008268	CCGA	2	8	404486	404493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_008268	CGG	2	6	405037	405042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008268	CGC	2	6	405062	405067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_008268	TCCG	2	8	405080	405087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008268	CTG	2	6	405555	405560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_008268	GTC	2	6	406748	406753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008268	CTT	2	6	406756	406761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_008268	AGT	2	6	406771	406776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008268	ACGA	2	8	406810	406817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008268	GC	4	8	406846	406853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008268	CA	3	6	406873	406878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_008268	G	6	6	406888	406893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008268	CTC	2	6	408062	408067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_008268	GAGATC	2	12	411128	411139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1075	NC_008268	GCCG	2	8	411146	411153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_008268	GAA	2	6	411230	411235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008268	CTGA	2	8	413421	413428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_008268	GTG	2	6	413468	413473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_008268	G	6	6	415136	415141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008268	TCA	2	6	420552	420557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_008268	GCG	2	6	420622	420627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008268	CGC	2	6	420635	420640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1089	NC_008268	GTT	2	6	423994	423999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008268	GGC	2	6	424342	424347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008268	GACA	2	8	424844	424851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_008268	GCA	2	6	424905	424910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008268	GAG	2	6	424955	424960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_008268	CGT	2	6	425737	425742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008268	GTG	2	6	425745	425750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008268	CGC	3	9	425785	425793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008268	GAT	2	6	425795	425800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008268	CGA	2	6	425818	425823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008268	TCG	2	6	425841	425846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_008268	AGCC	2	8	425871	425878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_008268	CGA	2	6	425881	425886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008268	GTCT	2	8	425894	425901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_008268	CGGG	2	8	426547	426554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_008268	GGC	2	6	426563	426568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008268	CTC	2	6	427649	427654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_008268	CG	3	6	427695	427700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_008268	GAA	2	6	427717	427722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008268	C	6	6	427807	427812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_008268	CCT	2	6	427924	427929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_008268	TCG	2	6	427968	427973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008268	CGC	2	6	428003	428008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_008268	CGC	2	6	428013	428018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_008268	TCG	2	6	428305	428310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_008268	TCGC	2	8	428320	428327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008268	ACA	2	6	428346	428351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008268	ATGA	2	8	428406	428413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008268	CCCG	2	8	431068	431075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1121	NC_008268	CAC	3	9	431084	431092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_008268	ACC	2	6	431752	431757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_008268	TAC	2	6	433774	433779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008268	ACC	2	6	433783	433788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_008268	TGC	3	9	433813	433821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008268	ACC	2	6	434411	434416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_008268	CAA	2	6	434429	434434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008268	CGG	2	6	434509	434514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_008268	CGGC	2	8	434529	434536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_008268	ACC	2	6	434651	434656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_008268	ACA	2	6	434669	434674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008268	ACGG	2	8	435264	435271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_008268	TCGG	2	8	435274	435281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_008268	CGC	2	6	435312	435317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_008268	CCT	2	6	436458	436463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_008268	GAC	2	6	436491	436496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_008268	AGG	2	6	436548	436553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_008268	TGCG	2	8	462834	462841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1269	NC_008268	CCT	2	6	539016	539021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1441	NC_008268	GCG	2	6	584769	584774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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