MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008268	G	6	6	2993620	2993625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008268	CCG	2	6	2993674	2993679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_008268	CCG	2	6	2993682	2993687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_008268	TGC	3	9	2993721	2993729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_008268	CGG	2	6	2993757	2993762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_008268	CCA	3	9	2993785	2993793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_008268	CTC	2	6	2993828	2993833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_008268	CGC	2	6	2993885	2993890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_008268	CGG	3	9	2993916	2993924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_008268	TGA	2	6	2993934	2993939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008268	A	6	6	2993979	2993984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_008268	GGA	2	6	2993992	2993997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008268	CGC	2	6	2995743	2995748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_008268	TCGG	2	8	2995749	2995756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_008268	GGT	2	6	2996083	2996088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008268	CAC	2	6	2996095	2996100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_008268	GTCG	2	8	2996154	2996161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_008268	CCT	2	6	2997674	2997679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_008268	GGA	2	6	2997768	2997773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008268	GAG	2	6	2999044	2999049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008268	ATCG	2	8	3001726	3001733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_008268	CCCG	2	8	3002491	3002498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6023	NC_008268	GCA	2	6	3002512	3002517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_008268	GGA	2	6	3002520	3002525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008268	AAT	2	6	3003503	3003508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008268	ACCG	2	8	3004176	3004183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_008268	CGC	2	6	3004253	3004258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_008268	CCCA	2	8	3004266	3004273	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6029	NC_008268	TTC	2	6	3004288	3004293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_008268	CAC	2	6	3004310	3004315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_008268	CGT	2	6	3008990	3008995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_008268	CGA	2	6	3009026	3009031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_008268	GCG	2	6	3009034	3009039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_008268	TCC	2	6	3009042	3009047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_008268	CCG	2	6	3009055	3009060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_008268	TGC	2	6	3009109	3009114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_008268	TGA	2	6	3009163	3009168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008268	GGT	2	6	3009201	3009206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_008268	CG	3	6	3009273	3009278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_008268	TCACC	2	10	3009303	3009312	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6041	NC_008268	CTCA	2	8	3009325	3009332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_008268	CA	3	6	3015609	3015614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_008268	CCT	2	6	3016436	3016441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_008268	TGTGG	2	10	3016448	3016457	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008268	TCT	2	6	3019265	3019270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_008268	TAA	2	6	3019293	3019298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008268	TCGG	2	8	3019307	3019314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_008268	TCC	2	6	3019349	3019354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_008268	GCG	2	6	3019366	3019371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_008268	CGA	2	6	3019376	3019381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_008268	ACCG	2	8	3019390	3019397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_008268	TGA	2	6	3026743	3026748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008268	CCG	2	6	3026762	3026767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_008268	GGAC	2	8	3026847	3026854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_008268	ACCG	2	8	3026865	3026872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_008268	CTA	2	6	3026877	3026882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008268	CGC	2	6	3026917	3026922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_008268	ACTG	2	8	3026941	3026948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_008268	CGG	3	9	3026959	3026967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_008268	CGA	2	6	3026986	3026991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_008268	CCG	2	6	3027162	3027167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_008268	CCGC	2	8	3027184	3027191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6063	NC_008268	GTG	2	6	3027203	3027208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_008268	CGA	2	6	3027244	3027249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_008268	CTCGCA	2	12	3030263	3030274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_008268	CGC	2	6	3030344	3030349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_008268	CAG	2	6	3030359	3030364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_008268	CCA	2	6	3032291	3032296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_008268	TC	3	6	3032307	3032312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_008268	CG	3	6	3033563	3033568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_008268	CGTT	2	8	3033584	3033591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_008268	CT	3	6	3034758	3034763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_008268	CGGCC	2	10	3034771	3034780	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6074	NC_008268	CG	3	6	3034784	3034789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_008268	AT	3	6	3035873	3035878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008268	CCG	2	6	3035898	3035903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_008268	CCGCG	2	10	3035916	3035925	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6079	NC_008268	GCCG	2	8	3035959	3035966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_008268	GCA	2	6	3035976	3035981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_008268	TCG	2	6	3036008	3036013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6084	NC_008268	CTG	2	6	3037436	3037441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6086	NC_008268	GGA	2	6	3037769	3037774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6090	NC_008268	GGT	2	6	3039432	3039437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_008268	ATC	2	6	3039473	3039478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_008268	GAG	2	6	3039491	3039496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_008268	TCC	2	6	3040863	3040868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_008268	GGT	2	6	3040870	3040875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_008268	TGG	2	6	3040878	3040883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_008268	CTC	2	6	3043546	3043551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_008268	ACT	2	6	3043603	3043608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_008268	CCGA	2	8	3043680	3043687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_008268	GGA	2	6	3043696	3043701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_008268	CTC	2	6	3044853	3044858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6106	NC_008268	TG	3	6	3045680	3045685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_008268	CACAT	2	10	3045694	3045703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6108	NC_008268	GATC	2	8	3045744	3045751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_008268	CCAGA	2	10	3045909	3045918	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6110	NC_008268	GAG	2	6	3045928	3045933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008268	GCC	2	6	3048164	3048169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_008268	CAT	2	6	3048175	3048180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_008268	TG	3	6	3048186	3048191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_008268	ATC	2	6	3052248	3052253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_008268	CAT	2	6	3052296	3052301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6117	NC_008268	CGT	2	6	3053874	3053879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_008268	GCCC	2	8	3053892	3053899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6119	NC_008268	GGGC	2	8	3053913	3053920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_008268	CGT	2	6	3053939	3053944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_008268	TGC	2	6	3053975	3053980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6124	NC_008268	TCG	2	6	3054457	3054462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_008268	CGA	2	6	3054582	3054587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_008268	GTCG	2	8	3054588	3054595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_008268	GCT	2	6	3054613	3054618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_008268	CCG	2	6	3056042	3056047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_008268	CCG	2	6	3056145	3056150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_008268	CA	3	6	3056251	3056256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_008268	GAAC	2	8	3056274	3056281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6132	NC_008268	AGATCG	2	12	3056300	3056311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6133	NC_008268	CCAG	2	8	3056361	3056368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6134	NC_008268	TCG	2	6	3056414	3056419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_008268	CGATC	2	10	3056450	3056459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6136	NC_008268	CGA	2	6	3056466	3056471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_008268	CTG	2	6	3056494	3056499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_008268	CAC	2	6	3056502	3056507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6139	NC_008268	AAC	2	6	3056533	3056538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_008268	CAT	2	6	3056541	3056546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6141	NC_008268	GC	3	6	3056597	3056602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_008268	ACG	2	6	3056603	3056608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6150	NC_008268	GCT	2	6	3057090	3057095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6151	NC_008268	CGA	2	6	3057150	3057155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6155	NC_008268	TCG	2	6	3057275	3057280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6158	NC_008268	CGA	2	6	3057411	3057416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6161	NC_008268	CTTCG	2	10	3057633	3057642	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6162	NC_008268	ACG	2	6	3057658	3057663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6165	NC_008268	TGC	2	6	3058120	3058125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6171	NC_008268	GTG	2	6	3058779	3058784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6200	NC_008268	GTGA	2	8	3080290	3080297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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