MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008268	TCCG	2	8	2407505	2407512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_008268	TGG	2	6	2407674	2407679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008268	GCG	2	6	2408160	2408165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008268	CA	3	6	2409836	2409841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_008268	GGT	2	6	2409842	2409847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008268	GCA	2	6	2409854	2409859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008268	CGG	2	6	2409877	2409882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_008268	CGA	2	6	2409886	2409891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008268	GAG	2	6	2409898	2409903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008268	GCC	2	6	2415216	2415221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_008268	CTT	2	6	2417059	2417064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_008268	C	6	6	2417065	2417070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5013	NC_008268	GAA	2	6	2417087	2417092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008268	GGA	2	6	2417126	2417131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008268	GT	3	6	2420738	2420743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008268	AATC	2	8	2420769	2420776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_008268	GTC	2	6	2420786	2420791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008268	GTG	2	6	2422151	2422156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008268	GAG	2	6	2423677	2423682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008268	CTC	2	6	2428884	2428889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_008268	CAC	2	6	2428915	2428920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_008268	GTCAC	2	10	2428926	2428935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_008268	TCC	2	6	2431343	2431348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_008268	ACGA	2	8	2431395	2431402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_008268	CGG	2	6	2431430	2431435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_008268	ACC	2	6	2431450	2431455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_008268	GACC	2	8	2434751	2434758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_008268	TAG	2	6	2438893	2438898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008268	GAGG	2	8	2438945	2438952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008268	CAG	2	6	2438955	2438960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_008268	CAC	2	6	2439557	2439562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_008268	CGG	2	6	2439623	2439628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_008268	TAA	2	6	2439630	2439635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008268	TC	3	6	2443236	2443241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_008268	CGC	2	6	2443306	2443311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_008268	CA	3	6	2443317	2443322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_008268	CG	3	6	2443367	2443372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_008268	GGAGC	2	10	2443379	2443388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_008268	CG	3	6	2443408	2443413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_008268	GCGT	2	8	2444147	2444154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_008268	AGCCCG	2	12	2444233	2444244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_008268	GTC	2	6	2453817	2453822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_008268	CGC	2	6	2453850	2453855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_008268	GGA	2	6	2453859	2453864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008268	GGA	2	6	2454171	2454176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_008268	CCT	2	6	2455751	2455756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_008268	CGG	2	6	2455816	2455821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_008268	CG	4	8	2457401	2457408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_008268	CTG	2	6	2457455	2457460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008268	GCG	2	6	2457467	2457472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008268	CAGG	2	8	2463588	2463595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_008268	CAGT	2	8	2467129	2467136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5053	NC_008268	ACG	2	6	2467137	2467142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008268	ACCG	2	8	2467151	2467158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_008268	CTCG	2	8	2467163	2467170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_008268	GTC	2	6	2467177	2467182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008268	CGC	2	6	2467864	2467869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_008268	CTG	2	6	2467874	2467879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_008268	AG	3	6	2467939	2467944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008268	ACC	2	6	2467951	2467956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_008268	CTC	2	6	2471409	2471414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_008268	GTC	2	6	2473876	2473881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_008268	GCTT	2	8	2475121	2475128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_008268	GCG	2	6	2475140	2475145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_008268	TG	3	6	2475846	2475851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_008268	CTG	2	6	2475862	2475867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008268	GGGT	2	8	2475872	2475879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008268	TGT	2	6	2475882	2475887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008268	GGA	2	6	2475979	2475984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008268	GAC	2	6	2476066	2476071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_008268	GCA	2	6	2476096	2476101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_008268	CGC	2	6	2476154	2476159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_008268	GCC	2	6	2476184	2476189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_008268	ATCCG	2	10	2476208	2476217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5075	NC_008268	GCG	2	6	2476238	2476243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_008268	TGGT	2	8	2476315	2476322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008268	CGA	2	6	2476455	2476460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_008268	TCG	2	6	2476496	2476501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_008268	GTC	2	6	2476522	2476527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_008268	GCCGAG	2	12	2476541	2476552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_008268	TTC	2	6	2476567	2476572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_008268	GGT	2	6	2476608	2476613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008268	GCC	2	6	2476642	2476647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_008268	GT	3	6	2476727	2476732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008268	TGC	2	6	2476847	2476852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008268	AC	3	6	2478642	2478647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_008268	AGC	2	6	2482911	2482916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_008268	GTT	2	6	2483021	2483026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008268	TCC	2	6	2483032	2483037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_008268	AGG	2	6	2483071	2483076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008268	AAC	2	6	2484341	2484346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_008268	TCG	2	6	2484384	2484389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_008268	GTC	2	6	2485550	2485555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_008268	TCG	2	6	2486422	2486427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008268	GATG	2	8	2486450	2486457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008268	GC	3	6	2487673	2487678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_008268	CGT	2	6	2489271	2489276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_008268	GA	3	6	2490307	2490312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008268	CTC	2	6	2490326	2490331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_008268	C	6	6	2490349	2490354	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5101	NC_008268	AAGTCG	2	12	2490363	2490374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5102	NC_008268	TAC	2	6	2492502	2492507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_008268	CG	3	6	2492521	2492526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_008268	GT	3	6	2492532	2492537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008268	CGG	2	6	2492563	2492568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_008268	CTGCG	2	10	2493319	2493328	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5107	NC_008268	CTC	2	6	2494794	2494799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_008268	TGG	2	6	2494992	2494997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008268	GCG	2	6	2495007	2495012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008268	CGC	2	6	2496212	2496217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_008268	TG	3	6	2500217	2500222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008268	GAC	2	6	2500233	2500238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_008268	GGTT	2	8	2500326	2500333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008268	CA	3	6	2501568	2501573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_008268	GGGT	2	8	2501871	2501878	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008268	GGTG	2	8	2503940	2503947	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008268	ACT	2	6	2504011	2504016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_008268	GC	3	6	2504019	2504024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_008268	TGG	2	6	2504073	2504078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_008268	GATCC	2	10	2505417	2505426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5121	NC_008268	CGG	2	6	2505567	2505572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008268	ACG	2	6	2505576	2505581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_008268	CGC	2	6	2508127	2508132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_008268	TCA	2	6	2509205	2509210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_008268	GAA	2	6	2512427	2512432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008268	GTC	2	6	2512457	2512462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_008268	AGT	2	6	2512498	2512503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008268	ACC	2	6	2512540	2512545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_008268	CTT	2	6	2512563	2512568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_008268	CA	3	6	2512581	2512586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_008268	GTT	2	6	2512593	2512598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_008268	GGA	2	6	2515014	2515019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_008268	TTC	2	6	2516936	2516941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_008268	AAG	2	6	2621730	2621735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_008268	CGG	2	6	2621793	2621798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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