MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008268	GT	3	6	2041682	2041687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_008268	CA	3	6	2041698	2041703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_008268	CG	3	6	2041743	2041748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_008268	CA	3	6	2041769	2041774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_008268	CGG	2	6	2041815	2041820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008268	TCG	2	6	2043777	2043782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_008268	GC	3	6	2043787	2043792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_008268	CGC	3	9	2049370	2049378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_008268	GTC	2	6	2054059	2054064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_008268	GCGG	2	8	2055752	2055759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_008268	CAA	2	6	2059756	2059761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008268	ACG	2	6	2061999	2062004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_008268	CCGA	2	8	2062048	2062055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_008268	CCG	2	6	2064043	2064048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_008268	CCG	2	6	2064973	2064978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_008268	ACC	2	6	2066636	2066641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_008268	ACG	2	6	2066658	2066663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_008268	GGC	2	6	2066667	2066672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_008268	CGAA	2	8	2066708	2066715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_008268	CG	3	6	2069806	2069811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_008268	GTA	2	6	2071539	2071544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_008268	CGGCGA	2	12	2073338	2073349	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_008268	CGAG	2	8	2075211	2075218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_008268	GCG	2	6	2075228	2075233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008268	AG	3	6	2077109	2077114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008268	TGGGG	2	10	2077115	2077124	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008268	TCG	2	6	2077128	2077133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008268	CGCC	2	8	2081185	2081192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4529	NC_008268	CCG	2	6	2084800	2084805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_008268	CGAA	2	8	2084839	2084846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_008268	AGG	2	6	2084905	2084910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_008268	CAGC	2	8	2084911	2084918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_008268	ATC	2	6	2085037	2085042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008268	GCG	2	6	2085043	2085048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008268	CGT	2	6	2085071	2085076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008268	CGC	2	6	2085101	2085106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_008268	CCCA	2	8	2087395	2087402	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4538	NC_008268	CAC	2	6	2088348	2088353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_008268	ACG	2	6	2088365	2088370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_008268	GTC	2	6	2088375	2088380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_008268	CGC	3	9	2088402	2088410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_008268	TCT	2	6	2089123	2089128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008268	TCGG	2	8	2089137	2089144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_008268	TGGGT	2	10	2099173	2099182	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008268	AAC	2	6	2099269	2099274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008268	GC	3	6	2099311	2099316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_008268	AGC	2	6	2099420	2099425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_008268	TCCT	2	8	2099836	2099843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_008268	CGGG	2	8	2099871	2099878	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_008268	CCT	2	6	2100473	2100478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_008268	CCG	2	6	2100518	2100523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_008268	CA	3	6	2100535	2100540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_008268	TCC	2	6	2100644	2100649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_008268	GCC	2	6	2100657	2100662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_008268	ACT	2	6	2100746	2100751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_008268	TCA	2	6	2100861	2100866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_008268	AT	3	6	2100905	2100910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008268	AGCT	2	8	2100912	2100919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_008268	TG	3	6	2102598	2102603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_008268	TCT	2	6	2103331	2103336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008268	GT	4	8	2103356	2103363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008268	AGT	2	6	2103388	2103393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008268	GGCC	2	8	2103405	2103412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_008268	CGG	2	6	2103431	2103436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_008268	CGG	2	6	2103457	2103462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_008268	GCC	2	6	2103464	2103469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_008268	GATC	2	8	2103470	2103477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_008268	GT	3	6	2103945	2103950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_008268	GCC	2	6	2104783	2104788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_008268	TCAC	2	8	2104869	2104876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_008268	GCT	2	6	2105435	2105440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_008268	GACC	2	8	2105507	2105514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_008268	CG	3	6	2105534	2105539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_008268	GCCG	2	8	2105548	2105555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_008268	GC	3	6	2105573	2105578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_008268	CTT	2	6	2106887	2106892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_008268	TCGC	2	8	2107137	2107144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_008268	GC	3	6	2107153	2107158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_008268	ACGA	2	8	2107299	2107306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4580	NC_008268	TG	4	8	2107341	2107348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008268	GAG	2	6	2107440	2107445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_008268	AGA	2	6	2107482	2107487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_008268	AACG	2	8	2107492	2107499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_008268	C	6	6	2107501	2107506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4585	NC_008268	CGG	2	6	2107572	2107577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_008268	CCGG	2	8	2107582	2107589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_008268	CGG	2	6	2107594	2107599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_008268	CACG	2	8	2108169	2108176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_008268	GGC	2	6	2108177	2108182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_008268	CCTT	2	8	2109058	2109065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_008268	GAC	2	6	2109148	2109153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_008268	GTC	2	6	2110255	2110260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_008268	GGC	2	6	2110290	2110295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_008268	CGC	2	6	2110343	2110348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_008268	GAC	2	6	2113802	2113807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_008268	CAG	2	6	2115015	2115020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_008268	CG	3	6	2115039	2115044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_008268	GTCC	2	8	2117151	2117158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_008268	CGAT	2	8	2117813	2117820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_008268	GGCAC	2	10	2118713	2118722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4601	NC_008268	GC	3	6	2118730	2118735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_008268	GC	4	8	2120937	2120944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_008268	CCA	2	6	2120951	2120956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_008268	CCGG	2	8	2124145	2124152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_008268	CGG	2	6	2124172	2124177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_008268	CGC	2	6	2124192	2124197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_008268	TCG	2	6	2124244	2124249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_008268	TCG	2	6	2124328	2124333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_008268	GCG	2	6	2126799	2126804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_008268	CGA	2	6	2126824	2126829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_008268	AAG	2	6	2126830	2126835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_008268	CG	3	6	2128690	2128695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_008268	TGT	2	6	2128720	2128725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_008268	TGGGG	2	10	2128789	2128798	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_008268	GAA	2	6	2131664	2131669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008268	GAGC	2	8	2131671	2131678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_008268	GGA	2	6	2134243	2134248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_008268	CGG	2	6	2134268	2134273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_008268	GCGA	2	8	2134292	2134299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_008268	CGAAAC	2	12	2134343	2134354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_008268	GCC	2	6	2136645	2136650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_008268	GC	3	6	2138537	2138542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_008268	CGGC	2	8	2138584	2138591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_008268	CGT	4	12	2138593	2138604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_008268	GCG	2	6	2138614	2138619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_008268	TGG	2	6	2138665	2138670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_008268	CGG	2	6	2138692	2138697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_008268	CCA	2	6	2138698	2138703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_008268	CCGGC	2	10	2138831	2138840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4630	NC_008268	TGC	2	6	2138869	2138874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4632	NC_008268	ACG	2	6	2138886	2138891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4763	NC_008268	ACC	2	6	2201072	2201077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4764	NC_008268	GC	3	6	2201909	2201914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4765	NC_008268	CGC	2	6	2204469	2204474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4770	NC_008268	AACG	2	8	2211609	2211616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4784	NC_008268	CCTGT	2	10	2221480	2221489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4889	NC_008268	GGA	2	6	2313573	2313578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4933	NC_008268	GCG	2	6	2380174	2380179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4997	NC_008268	CCG	2	6	2401880	2401885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4998	NC_008268	GCCG	2	8	2402944	2402951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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