MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	GACC	2	8	319	326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008209	CCAT	2	8	985	992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008209	CCAT	2	8	1467	1474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008209	CGCC	2	8	5643	5650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008209	CAGA	2	8	12651	12658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008209	ATAA	2	8	12726	12733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008209	CACC	2	8	16916	16923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008209	GGTG	2	8	16951	16958	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008209	TGTT	2	8	25412	25419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008209	CCCA	2	8	27639	27646	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_008209	CAGC	2	8	31876	31883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008209	ATCA	2	8	38771	38778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008209	GCCC	2	8	39693	39700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008209	TCCG	2	8	42525	42532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008209	TGCC	2	8	46059	46066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008209	CCTG	2	8	53886	53893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008209	GCAG	2	8	65726	65733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008209	CCCA	2	8	69729	69736	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_008209	GCCA	2	8	69799	69806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008209	GATC	2	8	73359	73366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008209	GCTG	2	8	76708	76715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008209	TATT	2	8	82600	82607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008209	GTGA	2	8	82622	82629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008209	ATCA	2	8	91055	91062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008209	CCCG	2	8	95764	95771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_008209	CCGC	2	8	106330	106337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_008209	GGTG	2	8	125387	125394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008209	AATT	2	8	148739	148746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008209	AGTG	2	8	153889	153896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008209	TTTC	2	8	154043	154050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008209	AGGC	2	8	154107	154114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008209	GTCA	2	8	154893	154900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008209	GGCG	2	8	157733	157740	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008209	TCTT	2	8	157808	157815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008209	TCAG	2	8	157978	157985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008209	CTAG	2	8	158215	158222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008209	ACTG	2	8	159085	159092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008209	TGGA	2	8	159133	159140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008209	ATCA	2	8	161266	161273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008209	AACC	2	8	162155	162162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008209	CAAA	2	8	169713	169720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008209	CGGA	2	8	176518	176525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008209	CAAT	2	8	185431	185438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008209	TAGG	2	8	186375	186382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008209	CCGC	2	8	189376	189383	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_008209	ACAG	2	8	190048	190055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008209	CAAG	2	8	198162	198169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008209	ACGA	2	8	207617	207624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008209	TGTT	2	8	224863	224870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008209	CGTA	2	8	224886	224893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008209	GGGC	2	8	230033	230040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008209	GCAT	2	8	251819	251826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008209	TTGG	2	8	258670	258677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008209	CGCC	2	8	259676	259683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008209	GACA	2	8	259712	259719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008209	ATAC	2	8	259735	259742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008209	ATCA	2	8	269408	269415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008209	CGCC	2	8	272335	272342	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008209	CAGC	2	8	288511	288518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008209	TCGT	2	8	290857	290864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008209	CCCT	2	8	291683	291690	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_008209	GCCT	2	8	298969	298976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008209	AAGG	2	8	309723	309730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008209	GGCG	2	8	327256	327263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008209	ACCA	2	8	330745	330752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008209	GTGC	2	8	335193	335200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008209	ATCC	2	8	335331	335338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008209	CGTT	2	8	337511	337518	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008209	CTTG	2	8	338550	338557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008209	CGGC	2	8	338676	338683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008209	ACTG	2	8	342146	342153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008209	GTTC	2	8	342968	342975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008209	AAGC	2	8	356036	356043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008209	GCAG	2	8	356149	356156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008209	TCAG	2	8	360331	360338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008209	TTTG	2	8	364479	364486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008209	GCGA	2	8	365276	365283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008209	TTCT	2	8	366721	366728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008209	GGCC	2	8	371594	371601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008209	GGCC	2	8	371607	371614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008209	GGGC	2	8	372818	372825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008209	TGCT	2	8	375807	375814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008209	ATCT	2	8	390169	390176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008209	GTTT	2	8	391618	391625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008209	TCAA	2	8	426586	426593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008209	TAAA	2	8	427073	427080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008209	AAAT	2	8	430659	430666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008209	TGTT	2	8	432042	432049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008209	GCAG	2	8	433914	433921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008209	GACG	2	8	437040	437047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008209	ATGA	2	8	448033	448040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008209	CAGG	2	8	454469	454476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008209	TCCT	2	8	465326	465333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008209	TGCA	2	8	470099	470106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008209	CAGG	2	8	470251	470258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008209	TCCC	2	8	475571	475578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_008209	CAGG	2	8	477847	477854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008209	CGGG	2	8	477937	477944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008209	TATC	2	8	481691	481698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008209	TGCG	2	8	482300	482307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008209	CTGG	2	8	486039	486046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008209	CAAC	2	8	492480	492487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008209	AATC	2	8	517502	517509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008209	CATG	2	8	519416	519423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008209	GCTG	2	8	528464	528471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008209	CAGG	2	8	535476	535483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008209	GGAA	2	8	536887	536894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008209	GGCG	2	8	543651	543658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008209	CCAT	2	8	545212	545219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008209	CGAC	2	8	549493	549500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008209	TCCA	2	8	549687	549694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008209	CGGG	2	8	552928	552935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008209	AACC	2	8	560011	560018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008209	TTCA	2	8	560349	560356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008209	TTTC	2	8	560701	560708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008209	AAAC	2	8	560744	560751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008209	CAGG	2	8	560797	560804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008209	GCGA	2	8	566770	566777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008209	GGTT	2	8	570820	570827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008209	GGCA	2	8	579772	579779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008209	GCCT	2	8	588145	588152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008209	CTGT	3	12	588225	588236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008209	GCTC	2	8	588354	588361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008209	CTTG	2	8	588484	588491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008209	CATC	2	8	611121	611128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008209	GTTC	2	8	615892	615899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008209	GAAT	2	8	616009	616016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008209	CAAA	2	8	618850	618857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008209	GATG	2	8	621185	621192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008209	CCGC	2	8	623515	623522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_008209	GTCG	2	8	625488	625495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008209	GCGG	2	8	632560	632567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008209	TTCT	2	8	679324	679331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008209	AGGG	2	8	684133	684140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008209	GGCG	2	8	689972	689979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008209	GAGC	2	8	692480	692487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008209	TATG	2	8	692786	692793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008209	CTGC	2	8	696131	696138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008209	CGTA	2	8	696276	696283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008209	GGGC	2	8	700066	700073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008209	CGGG	2	8	702875	702882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008209	AGTA	2	8	703180	703187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008209	GAAC	2	8	703269	703276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008209	GTGA	2	8	703614	703621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008209	AGGC	2	8	704620	704627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008209	ATCA	2	8	704737	704744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008209	AACA	2	8	705222	705229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008209	AACG	2	8	705336	705343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008209	TCTT	2	8	705522	705529	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008209	GCGA	2	8	705829	705836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008209	TCTG	2	8	705957	705964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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