MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 4470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	TAG	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008209	GAA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008209	ATG	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008209	ACG	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008209	CAC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008209	GAT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008209	ACA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008209	GCC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008209	CCG	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008209	GGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008209	GCA	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008209	CCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008209	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008209	CGC	2	6	1208	1213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008209	CCA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008209	TCA	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008209	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008209	TAT	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008209	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008209	GCA	2	6	7460	7465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008209	AGT	2	6	12771	12776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008209	CAC	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008209	CTG	2	6	13853	13858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008209	TAG	2	6	29701	29706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008209	TCC	2	6	31914	31919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008209	CGC	2	6	38784	38789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008209	CGC	2	6	41513	41518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008209	ACA	2	6	44843	44848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008209	GCA	2	6	46649	46654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008209	AAG	2	6	46719	46724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008209	GCC	2	6	53843	53848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008209	GCC	2	6	53928	53933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008209	TCT	2	6	55953	55958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008209	ATG	2	6	65525	65530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008209	TAC	2	6	65589	65594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008209	TAT	2	6	65600	65605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008209	GCC	2	6	67634	67639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008209	TAT	2	6	67800	67805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008209	TGA	2	6	67854	67859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008209	CTG	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008209	AAG	2	6	67929	67934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008209	GGT	2	6	67960	67965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008209	TCG	2	6	68036	68041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008209	GCG	2	6	68209	68214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008209	CGT	2	6	69738	69743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008209	ATG	2	6	69749	69754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008209	AAC	2	6	70836	70841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008209	CGA	2	6	73002	73007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008209	AAC	2	6	73160	73165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008209	TTC	2	6	73203	73208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008209	TGT	2	6	73233	73238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008209	TCG	2	6	73376	73381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008209	GCA	2	6	73399	73404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008209	GGC	2	6	73613	73618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008209	GCA	2	6	73626	73631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008209	TCG	2	6	73642	73647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008209	TGA	2	6	73685	73690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008209	GTC	2	6	78470	78475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008209	CCA	2	6	86623	86628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008209	GAC	2	6	86636	86641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008209	TGC	2	6	89217	89222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008209	ATG	2	6	91174	91179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008209	GGC	2	6	91199	91204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008209	GTC	2	6	96737	96742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008209	CTG	2	6	97084	97089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008209	CGG	2	6	97101	97106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008209	AAC	2	6	98324	98329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008209	GGA	2	6	98948	98953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008209	AAG	2	6	103050	103055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008209	GCC	2	6	103191	103196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008209	GCC	2	6	106387	106392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008209	TCC	2	6	106726	106731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008209	CGC	2	6	106747	106752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008209	CTG	2	6	108641	108646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008209	CGG	2	6	110254	110259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008209	CAT	3	9	110260	110268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008209	GCT	2	6	110292	110297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008209	GCG	2	6	110366	110371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008209	CAA	2	6	114600	114605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008209	ATA	2	6	117098	117103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008209	CAT	2	6	125342	125347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008209	ACC	2	6	125350	125355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008209	GCG	2	6	125822	125827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008209	CGC	2	6	125874	125879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008209	TTC	2	6	129508	129513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008209	CGG	2	6	131023	131028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008209	TCC	2	6	131842	131847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008209	GTC	2	6	141980	141985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008209	TGC	2	6	142096	142101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008209	CAT	2	6	148388	148393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008209	GCT	2	6	148655	148660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008209	CGA	2	6	148720	148725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008209	GGC	2	6	153949	153954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008209	CTG	2	6	154075	154080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008209	TGG	2	6	154147	154152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008209	TCC	2	6	154197	154202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008209	GGC	2	6	154622	154627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008209	CTT	2	6	154737	154742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008209	TCA	2	6	154846	154851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008209	CTT	2	6	154863	154868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008209	GGC	2	6	154994	154999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008209	GAG	2	6	156650	156655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008209	CGT	2	6	157577	157582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008209	TGT	2	6	157597	157602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008209	CTC	2	6	157792	157797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008209	AAC	2	6	157957	157962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008209	ATG	2	6	158049	158054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008209	CCT	2	6	158183	158188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008209	CTT	2	6	158234	158239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008209	CTC	2	6	158279	158284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008209	CAA	2	6	158378	158383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008209	AGT	2	6	158408	158413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008209	TCA	2	6	158475	158480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008209	CAC	2	6	158537	158542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008209	CGT	2	6	158647	158652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008209	TCT	2	6	158661	158666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008209	GTC	2	6	158717	158722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008209	GAC	2	6	158980	158985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008209	CTC	2	6	158999	159004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008209	CGA	2	6	159062	159067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008209	ATT	2	6	159141	159146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008209	TCT	2	6	159185	159190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008209	GCA	2	6	159195	159200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008209	CAT	2	6	159339	159344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008209	ATA	2	6	159363	159368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008209	GGC	2	6	159474	159479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008209	CGG	2	6	159482	159487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008209	AAG	2	6	162145	162150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008209	AAC	2	6	162168	162173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008209	GAA	2	6	162189	162194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008209	GGC	2	6	168466	168471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008209	GCC	2	6	168480	168485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008209	CTC	2	6	170442	170447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008209	CAA	2	6	170491	170496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008209	GCC	2	6	171941	171946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008209	AGT	2	6	172097	172102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008209	CAA	2	6	172115	172120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008209	GAC	2	6	173372	173377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_008209	TGC	2	6	177721	177726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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