MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 7635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008209	GAG	2	6	2208452	2208457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008209	CAT	2	6	2210349	2210354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008209	GGA	2	6	2210362	2210367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008209	GGC	2	6	2211440	2211445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008209	GCC	3	9	2211963	2211971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_008209	GCC	2	6	2211983	2211988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_008209	GATCC	2	10	2212056	2212065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4008	NC_008209	CAT	2	6	2212101	2212106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008209	GGGC	2	8	2212151	2212158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_008209	GCCTG	2	10	2212229	2212238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4011	NC_008209	GGC	2	6	2212282	2212287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008209	GCT	2	6	2212361	2212366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008209	TCG	2	6	2212390	2212395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008209	GCA	2	6	2212553	2212558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008209	GCC	2	6	2212590	2212595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_008209	GCA	2	6	2212615	2212620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008209	GGC	2	6	2212658	2212663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_008209	TGA	2	6	2212741	2212746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008209	ATGCCT	2	12	2212861	2212872	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_008209	TGC	2	6	2212885	2212890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008209	ATT	2	6	2212950	2212955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008209	CAT	2	6	2212959	2212964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008209	GCA	2	6	2212977	2212982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008209	GGC	2	6	2213272	2213277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_008209	GGA	2	6	2215909	2215914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008209	ATA	2	6	2218338	2218343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008209	GGT	2	6	2218387	2218392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008209	GCT	2	6	2218429	2218434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_008209	TCC	2	6	2218439	2218444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_008209	CGCGAC	2	12	2218448	2218459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_008209	TGG	2	6	2218478	2218483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008209	GC	3	6	2218517	2218522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_008209	GAG	2	6	2218532	2218537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008209	ATC	2	6	2218601	2218606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_008209	GGC	2	6	2218613	2218618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_008209	GA	3	6	2218650	2218655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008209	CGCT	2	8	2218676	2218683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_008209	CG	3	6	2218734	2218739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_008209	CGC	2	6	2218767	2218772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008209	CAA	2	6	2218813	2218818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008209	CCA	2	6	2218863	2218868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_008209	TGGA	2	8	2218913	2218920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008209	GTC	2	6	2218952	2218957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008209	GCT	2	6	2218960	2218965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_008209	TGG	2	6	2219106	2219111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008209	CG	3	6	2219118	2219123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_008209	TGG	2	6	2219131	2219136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008209	CG	3	6	2219143	2219148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_008209	TGC	2	6	2219209	2219214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008209	CTG	2	6	2219277	2219282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008209	CG	3	6	2219359	2219364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_008209	GGC	2	6	2219390	2219395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008209	CTG	2	6	2219460	2219465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_008209	GGGA	2	8	2221161	2221168	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008209	ATT	2	6	2222304	2222309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008209	AG	3	6	2222324	2222329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008209	TATTTT	2	12	2222382	2222393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008209	A	6	6	2222839	2222844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008209	A	6	6	2222848	2222853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008209	GCCGG	2	10	2222861	2222870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4061	NC_008209	GC	3	6	2229040	2229045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_008209	GCA	2	6	2229070	2229075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008209	CG	3	6	2229093	2229098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_008209	CCAT	2	8	2229108	2229115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_008209	CTC	2	6	2231096	2231101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_008209	GGC	2	6	2231125	2231130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008209	ATG	2	6	2231260	2231265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008209	ATGG	2	8	2231278	2231285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008209	AAT	2	6	2231431	2231436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008209	C	6	6	2232493	2232498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4071	NC_008209	T	6	6	2232509	2232514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008209	ATG	2	6	2232516	2232521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008209	GGC	2	6	2234639	2234644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_008209	CCCG	2	8	2235878	2235885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4075	NC_008209	GC	3	6	2238159	2238164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_008209	CGC	2	6	2238178	2238183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_008209	TG	3	6	2238229	2238234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008209	TCAG	2	8	2238313	2238320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_008209	CGG	2	6	2238321	2238326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008209	GATC	2	8	2239194	2239201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_008209	AGGC	2	8	2239242	2239249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_008209	TGC	2	6	2239294	2239299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008209	AGC	2	6	2243564	2243569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_008209	GCT	2	6	2243573	2243578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_008209	GAA	2	6	2243581	2243586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008209	GCA	2	6	2246742	2246747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008209	AATA	2	8	2247993	2248000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008209	TTA	2	6	2248042	2248047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008209	GTT	2	6	2250375	2250380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008209	AGGCA	2	10	2250437	2250446	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_008209	GCA	2	6	2250491	2250496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008209	TGCC	2	8	2250621	2250628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_008209	CGC	2	6	2252021	2252026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_008209	GCG	2	6	2252597	2252602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008209	CAA	2	6	2252646	2252651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_008209	GGGT	2	8	2253292	2253299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008209	TG	3	6	2253311	2253316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008209	CAGC	2	8	2253371	2253378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_008209	CAG	2	6	2253383	2253388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_008209	CGC	2	6	2253430	2253435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_008209	AGC	2	6	2254055	2254060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008209	GCG	2	6	2254065	2254070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008209	CTGCG	2	10	2255707	2255716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4104	NC_008209	CG	4	8	2255742	2255749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_008209	C	6	6	2255787	2255792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4106	NC_008209	TTC	2	6	2256437	2256442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_008209	TA	3	6	2257635	2257640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008209	TAT	2	6	2257655	2257660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008209	GCA	2	6	2257707	2257712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008209	GC	3	6	2257734	2257739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_008209	ACAG	2	8	2257742	2257749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_008209	G	6	6	2261922	2261927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008209	GCC	2	6	2261938	2261943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008209	T	6	6	2263132	2263137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008209	CAA	2	6	2263138	2263143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_008209	ATT	2	6	2263151	2263156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008209	TCGG	2	8	2263176	2263183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_008209	CGT	2	6	2264316	2264321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008209	CCA	2	6	2265049	2265054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_008209	CCGCGT	2	12	2265067	2265078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_008209	GC	4	8	2265230	2265237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_008209	CCG	2	6	2265288	2265293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_008209	TTGC	2	8	2265317	2265324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_008209	TCG	2	6	2265339	2265344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008209	GTC	2	6	2265356	2265361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008209	CGGCG	2	10	2265364	2265373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4127	NC_008209	CAT	2	6	2265388	2265393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008209	GC	3	6	2265433	2265438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_008209	TGA	2	6	2265523	2265528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008209	TGAT	2	8	2265558	2265565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008209	GCC	2	6	2265584	2265589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_008209	AATC	2	8	2265628	2265635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_008209	GT	3	6	2265720	2265725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008209	GGT	2	6	2265818	2265823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008209	TGC	2	6	2265848	2265853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_008209	CCGGG	2	10	2267049	2267058	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4138	NC_008209	TGC	2	6	2269410	2269415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_008209	GGA	2	6	2269455	2269460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4141	NC_008209	GGA	2	6	2269542	2269547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_008209	TGG	2	6	2273159	2273164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_008209	CTGT	2	8	2278151	2278158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4152	NC_008209	GC	3	6	2278368	2278373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_008209	AGA	2	6	2283489	2283494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4156	NC_008209	GAG	2	6	2288244	2288249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_008209	TGA	2	6	2292403	2292408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_008209	CTT	2	6	2292553	2292558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4172	NC_008209	CGCCAT	2	12	2292898	2292909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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4174	NC_008209	TG	3	6	2293051	2293056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_008209	TTG	2	6	2293057	2293062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4182	NC_008209	CTG	2	6	2301539	2301544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4188	NC_008209	A	6	6	2305706	2305711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4189	NC_008209	TGA	2	6	2305733	2305738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4191	NC_008209	CATTT	2	10	2306597	2306606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4192	NC_008209	TCA	2	6	2313608	2313613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4201	NC_008209	GC	3	6	2319511	2319516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4202	NC_008209	C	6	6	2320191	2320196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4220	NC_008209	GGA	2	6	2333592	2333597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_008209	TCCT	2	8	2334076	2334083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4231	NC_008209	AG	3	6	2334086	2334091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_008209	CGGG	2	8	2336021	2336028	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4233	NC_008209	ATC	2	6	2336067	2336072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4235	NC_008209	TTC	2	6	2336409	2336414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4237	NC_008209	TTTTG	2	10	2336571	2336580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4245	NC_008209	CGG	2	6	2342140	2342145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_008209	GGA	2	6	2342187	2342192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_008209	TGA	2	6	2342289	2342294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_008209	T	7	7	2342710	2342716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_008209	GTTG	2	8	2342800	2342807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_008209	GACCC	2	10	2342810	2342819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4252	NC_008209	GC	3	6	2342822	2342827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_008209	AGC	2	6	2342898	2342903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_008209	AT	3	6	2343699	2343704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_008209	GCG	2	6	2343762	2343767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_008209	TGC	2	6	2343959	2343964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_008209	GC	3	6	2344003	2344008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_008209	GCT	2	6	2344027	2344032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_008209	GC	3	6	2344147	2344152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_008209	GAA	2	6	2344186	2344191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_008209	TTG	2	6	2344399	2344404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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