MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 7635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008209	CGG	2	6	2388935	2388940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_008209	TGCC	2	8	2388943	2388950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_008209	GC	3	6	2389001	2389006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_008209	TCG	2	6	2389069	2389074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_008209	TCGC	2	8	2389090	2389097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_008209	TCTGA	2	10	2389113	2389122	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_008209	TG	3	6	2389179	2389184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_008209	GTC	2	6	2389191	2389196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_008209	AGG	2	6	2389199	2389204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008209	AGC	2	6	2389240	2389245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_008209	CGC	2	6	2389249	2389254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_008209	GC	3	6	2392059	2392064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_008209	GTT	2	6	2392870	2392875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_008209	A	6	6	2396410	2396415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_008209	CG	3	6	2396915	2396920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_008209	CGG	3	9	2396922	2396930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_008209	GC	3	6	2397535	2397540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_008209	T	6	6	2397567	2397572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_008209	GTT	2	6	2397595	2397600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008209	CCGC	2	8	2397734	2397741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4521	NC_008209	ACA	2	6	2397840	2397845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_008209	GGC	2	6	2397862	2397867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_008209	TGT	2	6	2397906	2397911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_008209	CGCAGG	2	12	2397921	2397932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008209	ACT	2	6	2397959	2397964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_008209	T	6	6	2400604	2400609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008209	GGAAG	2	10	2400611	2400620	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4529	NC_008209	CAA	2	6	2400659	2400664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008209	AGA	2	6	2400694	2400699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008209	TCA	2	6	2400700	2400705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_008209	ACCCA	2	10	2400844	2400853	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4533	NC_008209	T	6	6	2401333	2401338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_008209	AAT	2	6	2401344	2401349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008209	AC	3	6	2401415	2401420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_008209	ACA	2	6	2401520	2401525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_008209	CCT	2	6	2401526	2401531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4539	NC_008209	T	6	6	2401666	2401671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_008209	AAC	2	6	2401703	2401708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_008209	ATG	2	6	2401790	2401795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4543	NC_008209	CGTC	2	8	2401904	2401911	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_008209	T	6	6	2401955	2401960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008209	GA	3	6	2401994	2401999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_008209	GTC	2	6	2402022	2402027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_008209	GGCGC	2	10	2402050	2402059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4548	NC_008209	CGAG	2	8	2402108	2402115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_008209	GCA	2	6	2402151	2402156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_008209	CGG	2	6	2402309	2402314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_008209	TG	3	6	2402333	2402338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_008209	CAT	2	6	2402340	2402345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_008209	CG	3	6	2402347	2402352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_008209	TCT	2	6	2402385	2402390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_008209	A	8	8	2402503	2402510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008209	C	6	6	2402527	2402532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4557	NC_008209	CAGT	2	8	2402611	2402618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_008209	TGCA	2	8	2402639	2402646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_008209	CGC	2	6	2402680	2402685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4562	NC_008209	CAGT	2	8	2407135	2407142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_008209	GT	3	6	2407141	2407146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008209	AG	3	6	2407149	2407154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008209	ACC	2	6	2407162	2407167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_008209	CA	4	8	2409284	2409291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_008209	GAT	2	6	2409293	2409298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008209	GAGC	2	8	2411256	2411263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_008209	T	6	6	2411280	2411285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_008209	ACGCT	2	10	2412288	2412297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4571	NC_008209	AGCGT	2	10	2412317	2412326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4572	NC_008209	CAG	2	6	2412351	2412356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4575	NC_008209	GTG	2	6	2413700	2413705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_008209	GTG	2	6	2413789	2413794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008209	CG	3	6	2413839	2413844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4588	NC_008209	CGT	2	6	2419867	2419872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_008209	CGAC	2	8	2419884	2419891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_008209	GCTGT	2	10	2419892	2419901	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4598	NC_008209	GCC	2	6	2427770	2427775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_008209	GGA	2	6	2427778	2427783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_008209	ATG	2	6	2427792	2427797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_008209	GCG	2	6	2429132	2429137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008209	AAC	2	6	2429617	2429622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_008209	CAT	2	6	2432883	2432888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_008209	GTTCA	2	10	2439226	2439235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4605	NC_008209	TGC	2	6	2439292	2439297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4610	NC_008209	CCGGG	2	10	2440659	2440668	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4611	NC_008209	CTG	2	6	2441322	2441327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_008209	GCA	2	6	2441342	2441347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_008209	CT	3	6	2441536	2441541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_008209	GT	3	6	2441548	2441553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_008209	C	6	6	2441567	2441572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4616	NC_008209	GC	3	6	2441574	2441579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_008209	CGT	2	6	2441580	2441585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_008209	GC	3	6	2441588	2441593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_008209	ATC	2	6	2444421	2444426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4625	NC_008209	ATT	2	6	2447412	2447417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_008209	ACCT	2	8	2447418	2447425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_008209	CTG	2	6	2447527	2447532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_008209	TGT	2	6	2447541	2447546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_008209	CG	3	6	2447565	2447570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4900	NC_008209	GCG	2	6	2590104	2590109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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