MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 4552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	AAC	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008148	GAT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008148	GCG	2	6	1691	1696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008148	TTA	5	15	1786	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008148	AAT	3	9	1824	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008148	GAG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008148	CGC	2	6	9055	9060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008148	CCT	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008148	ACA	2	6	10877	10882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008148	GCC	2	6	11351	11356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008148	CGC	2	6	11362	11367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008148	GCC	2	6	11445	11450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008148	TAA	2	6	11456	11461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008148	GCG	2	6	11470	11475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008148	CGG	2	6	11585	11590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008148	CCT	2	6	11771	11776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008148	TCT	2	6	11779	11784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008148	GTG	2	6	11912	11917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008148	GAC	2	6	15249	15254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008148	GTA	2	6	16736	16741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008148	GAG	2	6	16826	16831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008148	GAA	2	6	16844	16849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008148	CAG	3	9	16859	16867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008148	CGG	2	6	16893	16898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008148	GCG	3	9	16920	16928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008148	ACG	2	6	16950	16955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008148	CTC	3	9	16957	16965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008148	CAT	2	6	16993	16998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008148	CGC	2	6	17003	17008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008148	CCG	2	6	17009	17014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008148	CCT	2	6	21252	21257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008148	GCA	2	6	30760	30765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008148	GAG	2	6	31823	31828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008148	CAG	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008148	CTC	2	6	33263	33268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008148	CTT	2	6	33911	33916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008148	GTG	2	6	33918	33923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008148	GAT	2	6	33934	33939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008148	TAG	2	6	33941	33946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008148	GCT	2	6	33993	33998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008148	CAG	2	6	42258	42263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008148	CGC	2	6	42993	42998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008148	GAC	2	6	43020	43025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008148	GAG	2	6	46127	46132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008148	TGG	2	6	48304	48309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008148	GCG	2	6	48312	48317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008148	GCC	2	6	55717	55722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008148	GGT	2	6	56315	56320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008148	AGC	2	6	56330	56335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008148	CAA	2	6	56352	56357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008148	GCT	2	6	57583	57588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008148	AGG	2	6	57604	57609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008148	GGC	2	6	58618	58623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008148	ATC	2	6	60418	60423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008148	CTC	2	6	65349	65354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008148	CTC	2	6	65388	65393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008148	GAG	2	6	65475	65480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008148	GAG	2	6	66299	66304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008148	CGG	2	6	74807	74812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008148	GCG	2	6	74896	74901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008148	CGC	2	6	74907	74912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008148	TGC	3	9	74977	74985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008148	GCG	2	6	75068	75073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008148	TCG	2	6	75081	75086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008148	GCC	2	6	75169	75174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008148	CGC	2	6	75231	75236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008148	CTC	3	9	77129	77137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008148	GCC	2	6	78403	78408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008148	AGG	2	6	78439	78444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008148	AGG	2	6	79807	79812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008148	TTC	2	6	82963	82968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008148	GAG	2	6	82970	82975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008148	CTC	2	6	84494	84499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008148	CGG	2	6	84520	84525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008148	CAG	2	6	84566	84571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008148	CCT	2	6	86692	86697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008148	CCG	2	6	86786	86791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008148	GAG	2	6	86887	86892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008148	GAG	2	6	89157	89162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008148	CAT	2	6	90352	90357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008148	ACC	2	6	90371	90376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008148	TCG	2	6	90411	90416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008148	TTG	2	6	90440	90445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008148	GTC	2	6	90498	90503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008148	GCA	2	6	90576	90581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008148	TGG	2	6	90783	90788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008148	CCG	2	6	90851	90856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008148	CGC	2	6	90879	90884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008148	TGG	2	6	90889	90894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008148	GTC	2	6	90909	90914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008148	CGT	2	6	90947	90952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008148	AGG	2	6	90973	90978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008148	CTC	2	6	90997	91002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008148	TGA	2	6	91100	91105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008148	AGT	2	6	91214	91219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008148	CTT	2	6	91293	91298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008148	AGA	2	6	91316	91321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008148	GCC	2	6	91853	91858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008148	CTC	2	6	95429	95434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008148	CCA	2	6	95466	95471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008148	GCC	3	9	95477	95485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008148	AGG	2	6	95552	95557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008148	GAT	2	6	95588	95593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008148	GGA	2	6	95604	95609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008148	GCG	2	6	95715	95720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008148	TGG	2	6	95771	95776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008148	CGC	2	6	95780	95785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008148	TCC	2	6	95799	95804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008148	GAT	2	6	99963	99968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008148	TCT	2	6	99997	100002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008148	GAG	2	6	100159	100164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008148	TGG	2	6	100169	100174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008148	AGG	2	6	100194	100199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008148	GAG	2	6	100227	100232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008148	GCG	2	6	100247	100252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008148	GGA	2	6	100268	100273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008148	GCT	2	6	100316	100321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008148	GAG	3	9	100341	100349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008148	GCA	2	6	103887	103892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008148	CTG	2	6	103923	103928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008148	CGC	2	6	104001	104006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008148	CCG	2	6	104176	104181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008148	CGG	2	6	104212	104217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008148	GAG	2	6	104229	104234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008148	GAA	2	6	104310	104315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008148	CCT	2	6	106894	106899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008148	CCT	2	6	106933	106938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008148	GTA	2	6	107015	107020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008148	GAG	2	6	107024	107029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008148	CGG	2	6	107080	107085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008148	CCA	2	6	107092	107097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008148	CGG	2	6	107114	107119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008148	CCT	2	6	107158	107163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008148	CAG	2	6	107228	107233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008148	GCG	2	6	107282	107287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008148	GAG	2	6	107327	107332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008148	GGC	2	6	107348	107353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008148	GTT	2	6	107354	107359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008148	AGA	2	6	107476	107481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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