MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008148	CAC	2	6	1977682	1977687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_008148	TAC	2	6	1977738	1977743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008148	TTG	2	6	1977782	1977787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008148	AGG	2	6	1977860	1977865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008148	GCCCG	2	10	1981623	1981632	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4006	NC_008148	TCC	2	6	1984968	1984973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_008148	GCA	2	6	1985015	1985020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008148	GGC	2	6	1985032	1985037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008148	AGG	2	6	1985054	1985059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008148	GC	3	6	1985068	1985073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_008148	G	6	6	1985077	1985082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008148	GCAGGC	2	12	1985112	1985123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008148	CGC	3	9	1989172	1989180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_008148	GA	3	6	1989196	1989201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008148	CCGC	2	8	1989202	1989209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4016	NC_008148	GCA	2	6	1990957	1990962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008148	G	6	6	1990973	1990978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008148	CCT	2	6	1991263	1991268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_008148	TCGG	2	8	1991282	1991289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_008148	GGGA	2	8	1991304	1991311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008148	CGG	2	6	1991313	1991318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_008148	GCC	2	6	1991981	1991986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_008148	TCC	2	6	1996694	1996699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_008148	GGA	2	6	2002060	2002065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008148	GC	3	6	2002581	2002586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_008148	GC	3	6	2002596	2002601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_008148	CGC	2	6	2002605	2002610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_008148	ACC	2	6	2002629	2002634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_008148	CCGG	2	8	2002671	2002678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_008148	CCA	2	6	2002680	2002685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_008148	CGG	2	6	2002730	2002735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008148	CCG	2	6	2005938	2005943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_008148	GGC	2	6	2005985	2005990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_008148	GAA	2	6	2006010	2006015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008148	CG	3	6	2007687	2007692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_008148	ACGCCC	2	12	2007695	2007706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_008148	TA	3	6	2007712	2007717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008148	C	6	6	2007738	2007743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4039	NC_008148	CGTC	2	8	2008867	2008874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_008148	CTT	2	6	2008934	2008939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008148	GGGTC	2	10	2008942	2008951	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4042	NC_008148	CGG	2	6	2010757	2010762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_008148	TCC	2	6	2013479	2013484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_008148	CTC	2	6	2017821	2017826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_008148	CAG	2	6	2017833	2017838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_008148	CCTCC	2	10	2017884	2017893	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4047	NC_008148	CCA	2	6	2017901	2017906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_008148	GCG	2	6	2017944	2017949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008148	GCC	2	6	2017961	2017966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_008148	GGC	2	6	2017968	2017973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008148	CGT	2	6	2017976	2017981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_008148	CGC	2	6	2017982	2017987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_008148	GCC	2	6	2017989	2017994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008148	GC	3	6	2018046	2018051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_008148	TCC	2	6	2020182	2020187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_008148	CTC	2	6	2024255	2024260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_008148	CCG	2	6	2024305	2024310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_008148	GCC	2	6	2024314	2024319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_008148	TCC	2	6	2024359	2024364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_008148	CTC	2	6	2024373	2024378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_008148	GGC	2	6	2024631	2024636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008148	CGG	2	6	2026672	2026677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008148	TC	3	6	2027694	2027699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_008148	GC	3	6	2028460	2028465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_008148	CGG	2	6	2028509	2028514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_008148	CGG	2	6	2028516	2028521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008148	CAG	2	6	2028526	2028531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008148	CG	3	6	2028544	2028549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_008148	CGG	2	6	2028570	2028575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008148	AGG	2	6	2028576	2028581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008148	CGC	2	6	2028590	2028595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_008148	GCG	2	6	2029585	2029590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_008148	G	6	6	2029590	2029595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008148	CCT	2	6	2030564	2030569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_008148	GA	3	6	2030588	2030593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008148	ACC	2	6	2030601	2030606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_008148	GCG	2	6	2031601	2031606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008148	CCG	2	6	2033505	2033510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008148	AGGC	2	8	2035651	2035658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_008148	GGA	2	6	2035663	2035668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008148	TCC	3	9	2037206	2037214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_008148	GCCC	2	8	2037234	2037241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4083	NC_008148	C	6	6	2037239	2037244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4084	NC_008148	AGA	2	6	2037260	2037265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008148	TAC	2	6	2037267	2037272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_008148	GCGG	2	8	2038295	2038302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_008148	GCG	2	6	2038322	2038327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_008148	CG	3	6	2041594	2041599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_008148	TTC	2	6	2041617	2041622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_008148	CG	3	6	2041633	2041638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_008148	C	6	6	2041639	2041644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4092	NC_008148	GAC	2	6	2041646	2041651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_008148	CTCG	2	8	2041681	2041688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_008148	GGA	2	6	2041734	2041739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008148	CTG	2	6	2041743	2041748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_008148	ACC	2	6	2041766	2041771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_008148	GCC	2	6	2041779	2041784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_008148	CGG	2	6	2041786	2041791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008148	GTG	2	6	2041794	2041799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008148	TA	3	6	2041800	2041805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008148	AG	3	6	2043509	2043514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008148	CGG	2	6	2043523	2043528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008148	GCC	2	6	2043534	2043539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_008148	GC	3	6	2043545	2043550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_008148	C	6	6	2043565	2043570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4106	NC_008148	CG	4	8	2043583	2043590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_008148	GTT	2	6	2043617	2043622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_008148	AAGGA	2	10	2045169	2045178	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008148	AGG	2	6	2045503	2045508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008148	AGC	2	6	2048205	2048210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_008148	GCT	2	6	2048291	2048296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_008148	GCC	2	6	2048306	2048311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008148	CGG	2	6	2048834	2048839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_008148	GCC	2	6	2048845	2048850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_008148	TTCC	2	8	2050829	2050836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_008148	CAA	2	6	2050849	2050854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008148	GCT	2	6	2053447	2053452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008148	CCT	2	6	2054567	2054572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_008148	CTC	2	6	2054588	2054593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_008148	GAC	2	6	2058255	2058260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008148	CCG	2	6	2058269	2058274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_008148	GAA	2	6	2058295	2058300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_008148	GCA	2	6	2058311	2058316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008148	GCC	2	6	2058326	2058331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_008148	CTT	2	6	2058333	2058338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_008148	CCT	2	6	2058370	2058375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_008148	GCCCCG	2	12	2058395	2058406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_008148	CAC	2	6	2059719	2059724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4131	NC_008148	ATT	2	6	2059788	2059793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_008148	AG	4	8	2091554	2091561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_008148	GCCG	2	8	2094113	2094120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_008148	TGCT	2	8	2094142	2094149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4380	NC_008148	TCCTC	2	10	2156853	2156862	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4399	NC_008148	CT	3	6	2181957	2181962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4400	NC_008148	CG	3	6	2181982	2181987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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