MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008148	CGG	2	6	234995	235000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008148	ATC	2	6	236792	236797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008148	AGGCG	2	10	237531	237540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
504	NC_008148	CTC	2	6	237547	237552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_008148	GTC	2	6	238952	238957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008148	AGG	2	6	238961	238966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008148	GTTT	2	8	239682	239689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008148	GA	3	6	241044	241049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008148	CTC	2	6	242148	242153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_008148	CTC	2	6	243716	243721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_008148	CGG	2	6	243780	243785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008148	GTG	2	6	243788	243793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008148	TGG	2	6	243801	243806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008148	GAG	2	6	243813	243818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008148	CTA	2	6	243822	243827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008148	CGG	2	6	243835	243840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008148	GGC	2	6	243919	243924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008148	TTC	2	6	243944	243949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008148	TTC	2	6	243958	243963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008148	GCT	2	6	244011	244016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008148	CAT	2	6	244017	244022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008148	CGC	2	6	244062	244067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_008148	GGC	2	6	244077	244082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008148	GCT	2	6	244089	244094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008148	CTG	2	6	244099	244104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008148	GGGGCT	2	12	244116	244127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_008148	GGGGC	2	10	244139	244148	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
528	NC_008148	CGC	2	6	244170	244175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_008148	AGG	2	6	244183	244188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008148	CGG	2	6	244223	244228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008148	CTG	2	6	244234	244239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_008148	GCT	2	6	244266	244271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008148	TCC	2	6	244291	244296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008148	TCT	2	6	244319	244324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008148	TGG	2	6	244334	244339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008148	CCG	2	6	244386	244391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_008148	CT	3	6	244425	244430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_008148	TGC	2	6	244436	244441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008148	TGC	3	9	244457	244465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_008148	ACC	2	6	244513	244518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_008148	CTG	2	6	244567	244572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008148	GCC	2	6	244649	244654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_008148	GCG	2	6	244672	244677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008148	GCT	2	6	244709	244714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008148	CGG	2	6	244721	244726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008148	TCG	2	6	244735	244740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008148	GCG	2	6	244837	244842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008148	CGG	2	6	244843	244848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008148	GCG	2	6	244864	244869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008148	CGG	2	6	244874	244879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008148	GCC	2	6	244899	244904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_008148	CTGGG	2	10	244911	244920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
553	NC_008148	TGC	3	9	244984	244992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008148	GAG	3	9	245007	245015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008148	G	7	7	245052	245058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008148	TCC	3	9	247781	247789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_008148	GT	3	6	247845	247850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008148	AGG	2	6	247886	247891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008148	GCC	2	6	254564	254569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008148	CGG	2	6	255395	255400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_008148	GGC	2	6	256223	256228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008148	TC	3	6	259349	259354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_008148	TC	3	6	259371	259376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008148	GCC	2	6	259405	259410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_008148	CGG	2	6	259428	259433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008148	CTT	2	6	259447	259452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008148	GAG	2	6	259491	259496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008148	AGGG	2	8	261175	261182	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008148	TC	3	6	262246	262251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_008148	CGA	2	6	262274	262279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008148	TAGG	2	8	262297	262304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008148	TAGG	2	8	262363	262370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008148	TAGG	2	8	262428	262435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008148	TTG	2	6	262464	262469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008148	TAGG	2	8	262495	262502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008148	GT	3	6	262544	262549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008148	TAGG	2	8	262562	262569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008148	C	6	6	262584	262589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
579	NC_008148	C	6	6	262601	262606	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
580	NC_008148	TAGG	2	8	262629	262636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008148	TAGG	2	8	262697	262704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008148	TAGG	2	8	262763	262770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008148	CGC	2	6	262799	262804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_008148	CCG	2	6	262808	262813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008148	TAGG	2	8	262828	262835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008148	CCT	2	6	262843	262848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008148	TAGG	2	8	262893	262900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008148	TAGG	2	8	262960	262967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008148	ACA	2	6	263000	263005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008148	TAGG	2	8	263027	263034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008148	TAGG	2	8	263092	263099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008148	TAGG	2	8	263157	263164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008148	GA	4	8	263201	263208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008148	TAGG	2	8	263224	263231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008148	TTC	2	6	263270	263275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008148	TCCC	2	8	263281	263288	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
597	NC_008148	TGT	2	6	263352	263357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008148	CTC	2	6	274064	274069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_008148	TTTAC	2	10	281602	281611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_008148	GAT	2	6	281635	281640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008148	GGA	2	6	281655	281660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008148	CGG	2	6	282458	282463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008148	G	6	6	282506	282511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008148	CCG	2	6	284279	284284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_008148	CGGG	2	8	284297	284304	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
606	NC_008148	CTC	2	6	284346	284351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_008148	ACC	2	6	284359	284364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_008148	TCG	2	6	284389	284394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008148	GGT	2	6	284445	284450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008148	TCT	2	6	284495	284500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008148	TGG	2	6	285534	285539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008148	ATT	2	6	285556	285561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008148	GGC	2	6	285577	285582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008148	CCA	2	6	285594	285599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_008148	ACG	2	6	285622	285627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008148	GGC	2	6	286421	286426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008148	GAG	2	6	286454	286459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008148	AG	3	6	287223	287228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008148	GA	3	6	287234	287239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008148	CAG	2	6	289909	289914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008148	CT	3	6	289927	289932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_008148	GGA	2	6	289936	289941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008148	G	6	6	290267	290272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008148	CCCGG	2	10	290279	290288	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
625	NC_008148	GCG	2	6	290294	290299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008148	CTG	2	6	290323	290328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008148	GGAGCG	2	12	290352	290363	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_008148	GCG	2	6	290414	290419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_008148	CGC	2	6	290424	290429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_008148	GAG	2	6	290457	290462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008148	CTC	2	6	292214	292219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_008148	CCG	2	6	292220	292225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_008148	CT	3	6	292233	292238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_008148	CCG	2	6	292272	292277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_008148	GTG	2	6	292283	292288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_008148	GAG	2	6	292328	292333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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