MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	CGG	2	6	2894	2899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008044	TAA	2	6	5241	5246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008044	TGC	2	6	10570	10575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008044	AAG	2	6	14225	14230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008044	TGG	2	6	15961	15966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008044	GTC	2	6	15993	15998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008044	CCG	2	6	18011	18016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008044	GCG	2	6	26017	26022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008044	AAG	2	6	26052	26057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008044	GTC	2	6	26072	26077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008044	TCT	2	6	26708	26713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008044	GCG	2	6	27451	27456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008044	TTG	2	6	27524	27529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008044	GGA	2	6	27624	27629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008044	TGT	2	6	34431	34436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008044	CTG	2	6	34437	34442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008044	CGC	2	6	34552	34557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008044	TTG	2	6	34559	34564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008044	CTG	2	6	42408	42413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008044	CAC	2	6	42414	42419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008044	ATC	2	6	42441	42446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008044	GTA	2	6	42475	42480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008044	TTG	2	6	45458	45463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008044	GCC	2	6	45476	45481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008044	ACT	2	6	50246	50251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008044	CAA	2	6	50273	50278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008044	CTG	2	6	50302	50307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008044	CAT	2	6	50351	50356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008044	TGA	2	6	50362	50367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008044	GAG	2	6	50435	50440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008044	CTT	2	6	50462	50467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008044	TGC	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008044	TCC	2	6	54736	54741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008044	CAG	2	6	56147	56152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008044	CCG	2	6	57025	57030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008044	CGG	2	6	57055	57060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008044	TTG	2	6	57104	57109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008044	GCG	2	6	57132	57137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008044	GCG	2	6	58178	58183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008044	TGT	2	6	60309	60314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008044	TGC	2	6	60335	60340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008044	CCG	2	6	60347	60352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008044	GTG	2	6	60358	60363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008044	TCA	2	6	66986	66991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008044	TGC	2	6	67610	67615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008044	GAA	2	6	67800	67805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008044	TGC	2	6	69857	69862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008044	GAG	2	6	69976	69981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008044	GCG	2	6	70016	70021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008044	TTA	2	6	70939	70944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008044	GGA	2	6	70970	70975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008044	ATC	2	6	72167	72172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008044	GCG	2	6	72214	72219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008044	CAC	2	6	72734	72739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008044	GTC	2	6	73795	73800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008044	GCG	2	6	74905	74910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008044	AGT	2	6	76360	76365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008044	CAA	2	6	76371	76376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008044	GCC	2	6	76382	76387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008044	GGC	2	6	76394	76399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008044	GCG	2	6	77935	77940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008044	GTC	2	6	78822	78827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008044	GGC	2	6	83227	83232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008044	GCC	2	6	83239	83244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008044	CAG	2	6	83313	83318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008044	CGC	2	6	83347	83352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008044	GCA	2	6	83353	83358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008044	ATG	2	6	84879	84884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008044	TGC	2	6	84906	84911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008044	CGC	2	6	84933	84938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008044	GCG	2	6	84997	85002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008044	GTC	2	6	85320	85325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008044	CTG	2	6	85458	85463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008044	TGC	2	6	87269	87274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008044	AGC	2	6	87288	87293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008044	GCC	2	6	89621	89626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008044	CAG	2	6	89644	89649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008044	AGG	2	6	89653	89658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008044	CTT	2	6	90608	90613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008044	TGA	2	6	92330	92335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008044	TCG	2	6	92373	92378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008044	TCC	2	6	92415	92420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008044	CCT	2	6	96318	96323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008044	GCG	2	6	96363	96368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008044	CAG	2	6	97036	97041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008044	GTC	2	6	97068	97073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008044	GGA	2	6	97096	97101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008044	GCG	2	6	99941	99946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008044	TGG	2	6	99981	99986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008044	AAT	2	6	103548	103553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008044	AGG	2	6	112211	112216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008044	GTT	2	6	113776	113781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008044	TGT	2	6	116552	116557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008044	CCG	2	6	116558	116563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008044	GCA	2	6	116579	116584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008044	GGT	2	6	119276	119281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008044	ATC	2	6	119339	119344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008044	GAG	2	6	119435	119440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008044	GAG	2	6	119453	119458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008044	GAC	2	6	121459	121464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008044	TGC	2	6	121478	121483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008044	TTC	2	6	122356	122361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008044	AGG	2	6	122381	122386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008044	TCC	2	6	123388	123393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008044	AAG	2	6	124223	124228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008044	GGC	2	6	125346	125351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008044	AGG	2	6	125355	125360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008044	GGA	2	6	125396	125401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008044	GGC	2	6	126753	126758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008044	GAC	2	6	127660	127665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008044	GCC	2	6	128908	128913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008044	GCG	2	6	128934	128939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008044	CGG	2	6	131754	131759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008044	TGT	2	6	131870	131875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008044	GCA	2	6	131899	131904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008044	GTT	2	6	133012	133017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008044	GGC	2	6	133142	133147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008044	GCG	2	6	133207	133212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008044	CAT	2	6	133293	133298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008044	GCG	2	6	133453	133458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008044	TGG	2	6	133517	133522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008044	ATG	2	6	133592	133597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008044	CGC	2	6	136659	136664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008044	GCG	2	6	136737	136742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008044	GCC	2	6	137762	137767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008044	GAA	2	6	137807	137812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008044	GGC	2	6	140576	140581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008044	CGA	2	6	140601	140606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008044	TGG	2	6	142506	142511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008044	TTG	2	6	144662	144667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008044	GAT	2	6	144750	144755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008044	AAT	2	6	144821	144826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008044	AGC	2	6	144937	144942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008044	GCT	2	6	144947	144952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008044	GGC	2	6	144992	144997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008044	GCG	2	6	145038	145043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008044	TGG	2	6	145175	145180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008044	GAT	2	6	145224	145229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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