MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008044	ACT	2	6	1845951	1845956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_008044	CTT	2	6	1845984	1845989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008044	G	6	6	1846009	1846014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008044	GC	4	8	1846043	1846050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_008044	GAAA	2	8	1846442	1846449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008044	TCG	2	6	1846464	1846469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_008044	GGA	2	6	1846504	1846509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008044	CGG	2	6	1846570	1846575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008044	C	7	7	1846594	1846600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4010	NC_008044	GCAG	2	8	1846641	1846648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_008044	GGA	2	6	1846678	1846683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008044	TAA	2	6	1846687	1846692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008044	CAC	2	6	1846766	1846771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_008044	CGC	2	6	1846782	1846787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_008044	GTG	2	6	1846809	1846814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008044	CGA	2	6	1846920	1846925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008044	CG	3	6	1847466	1847471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_008044	AG	3	6	1847529	1847534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008044	A	6	6	1847572	1847577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008044	GATG	2	8	1847584	1847591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008044	CGC	2	6	1847623	1847628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_008044	CGT	2	6	1851575	1851580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008044	C	7	7	1851584	1851590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4024	NC_008044	GC	4	8	1851600	1851607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_008044	AGG	2	6	1851659	1851664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008044	CGCA	2	8	1852632	1852639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4030	NC_008044	CGC	2	6	1853640	1853645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_008044	GCC	2	6	1853663	1853668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_008044	CGC	2	6	1853819	1853824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_008044	CG	3	6	1853843	1853848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_008044	A	7	7	1854398	1854404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008044	TCT	2	6	1855292	1855297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4038	NC_008044	CTC	2	6	1857779	1857784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_008044	CGC	2	6	1857789	1857794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008044	CCAGA	2	10	1857797	1857806	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4041	NC_008044	TGA	2	6	1857847	1857852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008044	TCC	2	6	1858366	1858371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_008044	CTG	2	6	1860589	1860594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008044	GGC	2	6	1860600	1860605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4046	NC_008044	GAG	2	6	1862923	1862928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008044	GC	4	8	1863029	1863036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_008044	GACAG	2	10	1863134	1863143	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_008044	ATC	2	6	1863208	1863213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008044	CAA	2	6	1868381	1868386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008044	GC	3	6	1868479	1868484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_008044	TCT	2	6	1870569	1870574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008044	CCG	2	6	1870587	1870592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008044	CCCG	2	8	1870599	1870606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4055	NC_008044	CG	3	6	1871405	1871410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_008044	AC	3	6	1871415	1871420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_008044	AG	3	6	1871562	1871567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008044	CG	3	6	1873197	1873202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_008044	GCT	2	6	1873207	1873212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_008044	CG	3	6	1877096	1877101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_008044	CAG	2	6	1877185	1877190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008044	GCG	2	6	1877211	1877216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008044	CG	3	6	1877215	1877220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_008044	ATC	2	6	1877236	1877241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_008044	TGA	2	6	1877245	1877250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008044	ACG	2	6	1877255	1877260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4074	NC_008044	TAA	2	6	1879581	1879586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_008044	G	6	6	1882553	1882558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_008044	CA	3	6	1883445	1883450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_008044	GC	3	6	1883719	1883724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_008044	CGGCG	2	10	1883760	1883769	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_008044	CCG	2	6	1883770	1883775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_008044	TCT	2	6	1884456	1884461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008044	GCCT	2	8	1884509	1884516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_008044	GC	3	6	1884573	1884578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_008044	GA	3	6	1886153	1886158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008044	CG	3	6	1886166	1886171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4109	NC_008044	CCCCG	2	10	1887561	1887570	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4110	NC_008044	C	6	6	1887598	1887603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4111	NC_008044	GCG	2	6	1888610	1888615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4113	NC_008044	GC	3	6	1888664	1888669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_008044	GC	3	6	1888680	1888685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_008044	CGCGC	2	10	1890404	1890413	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4116	NC_008044	GCA	2	6	1890455	1890460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4126	NC_008044	GCAT	2	8	1895672	1895679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_008044	TCC	2	6	1895693	1895698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_008044	GC	3	6	1895699	1895704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_008044	GC	4	8	1895760	1895767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_008044	ACA	2	6	1895778	1895783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4133	NC_008044	T	6	6	1897658	1897663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008044	T	6	6	1897723	1897728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008044	GGC	2	6	1897759	1897764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4400	NC_008044	GC	3	6	1988432	1988437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4401	NC_008044	GCG	2	6	1988453	1988458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_008044	GGC	2	6	1988566	1988571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4485	NC_008044	T	6	6	2016779	2016784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_008044	GCA	2	6	2016807	2016812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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