MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008044	GAAC	2	8	1376612	1376619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_008044	CCA	2	6	1380743	1380748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_008044	CAG	2	6	1380812	1380817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_008044	GC	3	6	1380827	1380832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_008044	TGC	2	6	1382902	1382907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_008044	ATC	2	6	1382909	1382914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_008044	GCGAGC	2	12	1382915	1382926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_008044	CTCG	2	8	1385148	1385155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_008044	TCA	2	6	1396862	1396867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_008044	TA	3	6	1396883	1396888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008044	AAC	2	6	1396892	1396897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008044	CGG	2	6	1396907	1396912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008044	CA	3	6	1396917	1396922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_008044	GC	3	6	1397878	1397883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_008044	TTTC	2	8	1398039	1398046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_008044	TTGCA	2	10	1398061	1398070	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_008044	GC	3	6	1398346	1398351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_008044	CG	3	6	1398378	1398383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_008044	AAT	2	6	1398498	1398503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008044	CCCCG	2	10	1399206	1399215	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3021	NC_008044	CTG	2	6	1399219	1399224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008044	CCA	2	6	1400314	1400319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_008044	AAC	2	6	1402145	1402150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008044	TTG	2	6	1402250	1402255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008044	AGG	2	6	1402284	1402289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008044	CCG	2	6	1403728	1403733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_008044	CGG	2	6	1403801	1403806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008044	CT	3	6	1403871	1403876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_008044	TTCAC	2	10	1404738	1404747	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_008044	AG	3	6	1404755	1404760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008044	GCTT	2	8	1404790	1404797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_008044	CAT	2	6	1404835	1404840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008044	GCG	2	6	1405555	1405560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3035	NC_008044	CAG	2	6	1405674	1405679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_008044	TTTA	2	8	1405731	1405738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008044	CAA	2	6	1405779	1405784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008044	TAGA	2	8	1406462	1406469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008044	GGC	2	6	1406477	1406482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_008044	TGC	2	6	1406542	1406547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008044	GAG	2	6	1406641	1406646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008044	GCG	2	6	1406760	1406765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008044	CGA	2	6	1408753	1408758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_008044	CG	3	6	1408772	1408777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3046	NC_008044	GCG	2	6	1408880	1408885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008044	GCA	2	6	1408891	1408896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008044	GCA	2	6	1408902	1408907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_008044	CTG	2	6	1408924	1408929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008044	GCA	2	6	1408964	1408969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008044	AGG	2	6	1409105	1409110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008044	GAT	2	6	1409495	1409500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008044	TA	3	6	1409556	1409561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008044	TC	3	6	1409572	1409577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_008044	AT	3	6	1409581	1409586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008044	GA	3	6	1409635	1409640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008044	TGC	2	6	1409641	1409646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_008044	AGA	2	6	1409647	1409652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008044	TGC	2	6	1409685	1409690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_008044	GCG	2	6	1409702	1409707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008044	GCCA	2	8	1409745	1409752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_008044	GCC	2	6	1409778	1409783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_008044	GTTA	2	8	1409790	1409797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008044	TGA	2	6	1409802	1409807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008044	GAT	2	6	1409827	1409832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008044	T	7	7	1412111	1412117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008044	AAG	2	6	1412123	1412128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008044	T	6	6	1412250	1412255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008044	AC	3	6	1412434	1412439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_008044	CTG	2	6	1412551	1412556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008044	GATC	2	8	1412604	1412611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_008044	ATG	2	6	1412648	1412653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008044	T	7	7	1412676	1412682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008044	TCA	2	6	1412728	1412733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_008044	AACC	2	8	1414386	1414393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_008044	AAATC	2	10	1414423	1414432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3083	NC_008044	TGC	2	6	1414570	1414575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_008044	GACC	2	8	1414609	1414616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_008044	GAT	2	6	1414680	1414685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008044	TC	3	6	1414729	1414734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3088	NC_008044	T	6	6	1415907	1415912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008044	GCG	2	6	1415962	1415967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_008044	TCT	2	6	1416090	1416095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3092	NC_008044	AGC	3	9	1416247	1416255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008044	GAC	2	6	1416266	1416271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3095	NC_008044	TTGCGT	2	12	1416348	1416359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3098	NC_008044	AAAT	2	8	1417985	1417992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008044	TGC	2	6	1418018	1418023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_008044	GCT	2	6	1418037	1418042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_008044	AT	3	6	1418085	1418090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008044	CGC	2	6	1420885	1420890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3105	NC_008044	TTGCG	2	10	1424923	1424932	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3106	NC_008044	GC	3	6	1429445	1429450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_008044	CG	3	6	1429471	1429476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_008044	CTTTC	2	10	1430281	1430290	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3109	NC_008044	TGC	2	6	1430304	1430309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_008044	TCGGA	2	10	1430330	1430339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3111	NC_008044	GCT	2	6	1430373	1430378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_008044	CAC	2	6	1430393	1430398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_008044	A	7	7	1430404	1430410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008044	T	8	8	1432449	1432456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_008044	CAG	2	6	1432900	1432905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_008044	CG	3	6	1435867	1435872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_008044	GCC	2	6	1435898	1435903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_008044	TGG	2	6	1435996	1436001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008044	TAG	2	6	1440818	1440823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008044	GC	3	6	1441400	1441405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_008044	TGCC	2	8	1441406	1441413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_008044	TGC	3	9	1441445	1441453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_008044	CAAA	2	8	1442621	1442628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_008044	TGA	2	6	1443256	1443261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_008044	CAA	2	6	1444245	1444250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_008044	TTA	2	6	1448301	1448306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_008044	CGC	2	6	1451419	1451424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_008044	CTT	2	6	1455165	1455170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_008044	CAC	2	6	1455175	1455180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3136	NC_008044	T	6	6	1458808	1458813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3163	NC_008044	TTCTT	2	10	1472369	1472378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3241	NC_008044	AGGAC	2	10	1521172	1521181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3244	NC_008044	AAG	2	6	1521761	1521766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_008044	CTT	2	6	1528483	1528488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_008044	TG	3	6	1528489	1528494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_008044	TA	3	6	1528507	1528512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_008044	TCC	2	6	1531577	1531582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3258	NC_008044	TCTTT	2	10	1531587	1531596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3259	NC_008044	GGA	2	6	1531734	1531739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_008044	CG	3	6	1532034	1532039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3261	NC_008044	CCT	2	6	1532925	1532930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3263	NC_008044	GCC	2	6	1533911	1533916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3397	NC_008044	GC	3	6	1590774	1590779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3398	NC_008044	GC	3	6	1590794	1590799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3399	NC_008044	GAT	2	6	1590948	1590953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3430	NC_008044	AGA	2	6	1605811	1605816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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