MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008044	CG	3	6	444372	444377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_008044	GCA	2	6	444398	444403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008044	CCT	2	6	445463	445468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_008044	TGC	2	6	445643	445648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008044	CGA	2	6	448011	448016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008044	TTG	2	6	448051	448056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008044	CG	3	6	448126	448131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_008044	GTTGC	2	10	448137	448146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_008044	GC	3	6	448227	448232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_008044	GA	3	6	448246	448251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008044	AGC	2	6	448313	448318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008044	TGG	2	6	448324	448329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008044	GGGT	2	8	448348	448355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008044	CG	3	6	448399	448404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_008044	TGC	2	6	448577	448582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008044	ATTG	2	8	451241	451248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008044	AGTGG	2	10	451260	451269	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008044	CGTG	2	8	451931	451938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_008044	TG	3	6	451978	451983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008044	TGT	2	6	451986	451991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008044	GGT	2	6	451998	452003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008044	GGA	2	6	452007	452012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008044	GCT	2	6	452048	452053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008044	CCG	2	6	452072	452077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_008044	TG	3	6	452083	452088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008044	T	8	8	452156	452163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008044	CCG	2	6	452166	452171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_008044	CTT	2	6	452177	452182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008044	CAT	2	6	453104	453109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008044	TGT	2	6	455178	455183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008044	GGC	2	6	455213	455218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008044	AT	3	6	455235	455240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008044	CGGT	2	8	455249	455256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_008044	CAGA	2	8	456562	456569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_008044	GGA	2	6	456582	456587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008044	CAC	2	6	458511	458516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_008044	ATG	2	6	458522	458527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008044	CT	3	6	458546	458551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_008044	CGG	2	6	458625	458630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008044	GAG	2	6	458632	458637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008044	ATG	2	6	458659	458664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008044	CTC	2	6	458668	458673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_008044	TCA	2	6	458689	458694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_008044	GAG	2	6	458697	458702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008044	GCT	2	6	459005	459010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008044	AG	3	6	459018	459023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008044	CAAA	2	8	459031	459038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_008044	AGA	2	6	459051	459056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008044	GCC	2	6	459059	459064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_008044	GGC	2	6	459075	459080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008044	TGC	2	6	459111	459116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008044	TCG	2	6	460180	460185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008044	AG	3	6	460228	460233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008044	GCATCG	2	12	465213	465224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008044	TTTGG	2	10	466526	466535	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008044	GAC	2	6	466546	466551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008044	TGT	2	6	467849	467854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008044	GCC	2	6	471203	471208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_008044	AGC	2	6	471240	471245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008044	GA	3	6	471996	472001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008044	ATT	2	6	473268	473273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008044	G	9	9	475137	475145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008044	ATTG	2	8	476413	476420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008044	TC	3	6	476444	476449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008044	T	6	6	476451	476456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008044	T	6	6	476485	476490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008044	TAA	2	6	476511	476516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008044	AT	3	6	476569	476574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008044	GTT	2	6	476577	476582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008044	GC	4	8	477013	477020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008044	TTCC	2	8	477098	477105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_008044	CGT	2	6	477107	477112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008044	CGC	2	6	477141	477146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_008044	GCG	2	6	477152	477157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008044	ATGGG	2	10	479719	479728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008044	GTG	2	6	479773	479778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008044	CG	3	6	479835	479840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_008044	CAGA	2	8	483141	483148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_008044	TCG	2	6	485288	485293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008044	GCG	2	6	486628	486633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008044	ACATGC	2	12	486680	486691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008044	CAG	2	6	492140	492145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_008044	ACTG	2	8	493287	493294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_008044	GC	4	8	494250	494257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_008044	CCGC	2	8	495109	495116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_008044	A	6	6	496975	496980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008044	A	6	6	497035	497040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008044	TGT	2	6	499396	499401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008044	TCG	2	6	499402	499407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008044	GCAT	2	8	499475	499482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_008044	GAC	2	6	499512	499517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008044	TTG	2	6	499551	499556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008044	C	7	7	499579	499585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1094	NC_008044	GAG	2	6	499705	499710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008044	GGCG	2	8	499725	499732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_008044	G	6	6	499743	499748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008044	AGGG	2	8	499818	499825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008044	AGG	2	6	499854	499859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008044	TGC	2	6	501162	501167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008044	GCGG	2	8	501850	501857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_008044	ATGGA	2	10	501898	501907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008044	TGG	2	6	503273	503278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008044	GGT	2	6	503299	503304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008044	CTA	2	6	503318	503323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008044	ACG	2	6	503346	503351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008044	CGC	2	6	503371	503376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_008044	GTC	2	6	503439	503444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008044	CCTGA	2	10	504789	504798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1109	NC_008044	AGA	2	6	504829	504834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008044	CTT	2	6	504850	504855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008044	TTG	2	6	504992	504997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008044	GA	3	6	505011	505016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008044	GCT	2	6	506462	506467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008044	TCT	2	6	506495	506500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_008044	CT	3	6	507429	507434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_008044	AGCCA	2	10	507526	507535	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_008044	CT	3	6	507538	507543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008044	C	6	6	507548	507553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_008044	T	6	6	507614	507619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008044	GCC	2	6	507635	507640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_008044	GAC	2	6	510322	510327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008044	GCG	2	6	510334	510339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_008044	A	6	6	510364	510369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008044	GTT	2	6	511823	511828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008044	GC	3	6	511855	511860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008044	T	6	6	511901	511906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008044	ACG	2	6	514656	514661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008044	CGC	2	6	515341	515346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_008044	GATG	2	8	515363	515370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008044	CCA	2	6	515396	515401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_008044	A	6	6	515536	515541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008044	TCT	2	6	518835	518840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008044	CCG	2	6	518852	518857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_008044	GCG	2	6	525132	525137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_008044	TGG	2	6	525175	525180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008044	ATG	2	6	525181	525186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008044	TG	3	6	525196	525201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_008044	TGA	2	6	586344	586349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_008044	AAGT	2	8	588228	588235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_008044	GAA	2	6	588260	588265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_008044	TAAA	2	8	588273	588280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_008044	AAC	2	6	588281	588286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_008044	TG	3	6	588295	588300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1280	NC_008044	CTA	2	6	588340	588345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1282	NC_008044	CTC	2	6	588936	588941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1286	NC_008044	AACG	2	8	592354	592361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1287	NC_008044	TGCC	2	8	592421	592428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1288	NC_008044	CAG	2	6	592437	592442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_008044	CAG	2	6	593665	593670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1302	NC_008044	TCT	2	6	600475	600480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1303	NC_008044	CGG	2	6	600547	600552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1310	NC_008044	TGGC	2	8	600706	600713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1335	NC_008044	TGG	2	6	609512	609517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_008044	ATG	2	6	637582	637587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1391	NC_008044	CTGCAT	2	12	643510	643521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1394	NC_008044	GTG	2	6	643615	643620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1395	NC_008044	CTC	2	6	643632	643637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1396	NC_008044	TGG	2	6	643694	643699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1398	NC_008044	G	6	6	645348	645353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_008044	TGC	2	6	645357	645362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1400	NC_008044	CT	3	6	645373	645378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1401	NC_008044	GC	4	8	645462	645469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1402	NC_008044	GCTTGA	2	12	645471	645482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1403	NC_008044	CAT	2	6	645508	645513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_008044	CCTGA	2	10	647506	647515	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1405	NC_008044	GGGC	2	8	647537	647544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1406	NC_008044	G	6	6	647566	647571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_008044	GC	3	6	649080	649085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_008044	GCC	2	6	649126	649131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_008044	GTCGG	2	10	649186	649195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1410	NC_008044	CGGGGG	2	12	649253	649264	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1411	NC_008044	A	8	8	649290	649297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_008044	ATA	2	6	650104	650109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_008044	CGG	2	6	650405	650410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_008044	GGC	2	6	650413	650418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_008044	A	7	7	650477	650483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_008044	GCC	2	6	654221	654226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1425	NC_008044	CG	3	6	654378	654383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1455	NC_008044	G	6	6	664745	664750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_008044	GCC	2	6	681464	681469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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