MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008044	GCC	2	6	218134	218139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_008044	GGAC	2	8	218168	218175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_008044	TGTT	2	8	218208	218215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008044	CCGCCC	2	12	218223	218234	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
505	NC_008044	GACC	2	8	218249	218256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_008044	CTC	2	6	220006	220011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_008044	T	6	6	220052	220057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008044	GTTAT	2	10	220762	220771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008044	GC	3	6	220796	220801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_008044	TGCGC	2	10	220834	220843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
511	NC_008044	TGC	2	6	220938	220943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008044	C	6	6	220998	221003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_008044	TTC	2	6	221031	221036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008044	CG	3	6	222532	222537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_008044	ATG	3	9	222592	222600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008044	TGA	2	6	222619	222624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008044	CCCG	2	8	223519	223526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
518	NC_008044	CG	4	8	223575	223582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_008044	CG	4	8	223592	223599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_008044	CTTTT	2	10	225034	225043	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_008044	CGTCG	2	10	225065	225074	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_008044	CAGGCG	2	12	225085	225096	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008044	TC	3	6	225502	225507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008044	CCA	2	6	225552	225557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_008044	AAG	2	6	225609	225614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008044	GC	3	6	227568	227573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_008044	GGT	2	6	227597	227602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008044	GACA	2	8	227645	227652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_008044	GCC	2	6	228571	228576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_008044	GCG	2	6	228593	228598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008044	T	6	6	230968	230973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008044	AGC	2	6	230989	230994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008044	GCC	2	6	231075	231080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008044	ACA	2	6	231642	231647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008044	A	6	6	231647	231652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008044	AT	3	6	232349	232354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008044	GCC	2	6	232392	232397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_008044	GGGC	2	8	233195	233202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_008044	GT	3	6	234353	234358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008044	G	6	6	235533	235538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008044	CTC	2	6	235539	235544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008044	GCA	2	6	235832	235837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008044	GGGC	2	8	235845	235852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
544	NC_008044	GA	3	6	235865	235870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008044	CTGG	2	8	235902	235909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_008044	CGC	2	6	235942	235947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_008044	TGT	2	6	235959	235964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008044	G	7	7	235976	235982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008044	CGC	2	6	235990	235995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008044	CG	3	6	237463	237468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_008044	CAG	2	6	237489	237494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008044	GGA	2	6	237495	237500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008044	TGCC	2	8	238382	238389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008044	GAC	2	6	238425	238430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_008044	CAGCG	2	10	238440	238449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
556	NC_008044	CGTG	2	8	239071	239078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_008044	AGG	2	6	239144	239149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008044	GAAG	2	8	240290	240297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008044	GCGG	2	8	241355	241362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008044	GCC	2	6	241392	241397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008044	ACG	2	6	241407	241412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008044	AGC	2	6	241439	241444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008044	CCT	2	6	241481	241486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_008044	AG	4	8	241495	241502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008044	GCC	2	6	241729	241734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_008044	TCG	2	6	241736	241741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008044	GCG	2	6	241807	241812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008044	TTG	2	6	241829	241834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008044	AAG	2	6	241889	241894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008044	CCG	2	6	242527	242532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_008044	GCC	2	6	243793	243798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_008044	ACGCA	2	10	243871	243880	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
573	NC_008044	GC	3	6	243894	243899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_008044	GGC	2	6	245085	245090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008044	T	7	7	245105	245111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008044	CG	3	6	245122	245127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_008044	CTGA	2	8	245139	245146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_008044	CGG	2	6	245162	245167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008044	GCGCC	2	10	246122	246131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
580	NC_008044	CCG	2	6	246179	246184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_008044	TCG	2	6	246225	246230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008044	TGG	2	6	246257	246262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008044	CCT	2	6	246290	246295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_008044	CCG	2	6	246375	246380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008044	GA	3	6	246432	246437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008044	AC	3	6	247008	247013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_008044	CGG	2	6	247666	247671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008044	TTGT	2	8	247677	247684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008044	C	6	6	251875	251880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_008044	CG	4	8	256203	256210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_008044	GC	3	6	256246	256251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_008044	GGC	2	6	256252	256257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008044	GGCG	2	8	256288	256295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
594	NC_008044	GC	3	6	257143	257148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_008044	CG	3	6	258869	258874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_008044	CG	3	6	258887	258892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_008044	T	6	6	258960	258965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008044	GCT	2	6	259043	259048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008044	GAT	2	6	259049	259054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008044	CGC	2	6	259057	259062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_008044	GCC	3	9	262136	262144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008044	CTCC	2	8	262149	262156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
603	NC_008044	AGG	2	6	262167	262172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008044	AG	3	6	263392	263397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008044	T	6	6	263418	263423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008044	GGCG	2	8	264046	264053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
607	NC_008044	GCT	2	6	264112	264117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008044	GC	4	8	264124	264131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_008044	AAT	2	6	264177	264182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008044	GAC	2	6	264197	264202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008044	GCG	2	6	264203	264208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008044	AGT	2	6	264258	264263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008044	CAA	2	6	264268	264273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008044	AGA	2	6	264362	264367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008044	CGAGAG	2	12	264384	264395	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
616	NC_008044	CAT	2	6	264399	264404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008044	CCA	2	6	264754	264759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_008044	TGA	2	6	264894	264899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008044	CTC	2	6	264909	264914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_008044	G	6	6	266950	266955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008044	ACCG	2	8	267026	267033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_008044	CTG	2	6	267034	267039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_008044	TGG	2	6	267052	267057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008044	CGG	2	6	267123	267128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008044	GCT	2	6	267609	267614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008044	GGC	3	9	268360	268368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008044	GCT	2	6	268690	268695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008044	ATA	2	6	268892	268897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008044	C	6	6	271614	271619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
630	NC_008044	G	6	6	271634	271639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008044	T	6	6	271641	271646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008044	CGT	2	6	271827	271832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008044	AGG	2	6	271835	271840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008044	TGC	2	6	272213	272218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008044	AG	3	6	272232	272237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008044	GC	3	6	272993	272998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_008044	GCGTTT	2	12	273019	273030	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
638	NC_008044	GC	3	6	273086	273091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_008044	AG	3	6	273100	273105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008044	CG	3	6	273732	273737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_008044	T	6	6	273798	273803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008044	GCT	2	6	274845	274850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_008044	CCA	2	6	275733	275738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_008044	AAGGA	2	10	275758	275767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
649	NC_008044	GA	3	6	277885	277890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
650	NC_008044	TGG	2	6	279270	279275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
651	NC_008044	GAT	2	6	279280	279285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_008044	CAT	2	6	279356	279361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_008044	T	6	6	280191	280196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_008044	GC	3	6	280209	280214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
655	NC_008044	GTT	2	6	280256	280261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_008044	CAA	2	6	280267	280272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_008044	ACA	2	6	280313	280318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_008044	CG	3	6	280581	280586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
659	NC_008044	TCC	3	9	280616	280624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
660	NC_008044	TTG	2	6	280675	280680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_008044	GAG	2	6	280704	280709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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664	NC_008044	CGG	2	6	280875	280880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_008044	CGC	2	6	280881	280886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
666	NC_008044	CAG	2	6	280906	280911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_008044	GGC	2	6	280936	280941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_008044	TTG	2	6	280972	280977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
669	NC_008044	TCCGC	2	10	280981	280990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
670	NC_008044	CTG	2	6	281014	281019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_008044	GCG	2	6	281617	281622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_008044	TCA	2	6	281642	281647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_008044	GCG	2	6	281687	281692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_008044	AAG	2	6	281700	281705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
675	NC_008044	TGTTT	2	10	283721	283730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
676	NC_008044	GCAGG	2	10	283736	283745	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
677	NC_008044	AG	3	6	283762	283767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
678	NC_008044	GC	3	6	283768	283773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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685	NC_008044	GTC	2	6	287993	287998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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710	NC_008044	CG	3	6	300107	300112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
711	NC_008044	A	6	6	300140	300145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
712	NC_008044	ACGT	2	8	300204	300211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
713	NC_008044	TGA	2	6	300212	300217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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722	NC_008044	GAG	2	6	305523	305528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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754	NC_008044	GCG	2	6	317853	317858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_008044	CGGG	2	8	317900	317907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
756	NC_008044	CCG	2	6	317936	317941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
757	NC_008044	GCCC	2	8	317946	317953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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762	NC_008044	CCT	2	6	318692	318697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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764	NC_008044	CG	3	6	318770	318775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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769	NC_008044	TCA	2	6	318950	318955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_008044	GC	3	6	318971	318976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
771	NC_008044	GGA	2	6	319002	319007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_008044	GGGT	2	8	319043	319050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
773	NC_008044	TCC	2	6	322645	322650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_008044	TGC	2	6	322669	322674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_008044	GCG	2	6	322682	322687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_008044	A	6	6	322704	322709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_008044	TCC	2	6	322823	322828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
778	NC_008044	C	8	8	322843	322850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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793	NC_008044	C	6	6	324776	324781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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954	NC_008044	CCG	2	6	414913	414918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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982	NC_008044	GC	3	6	434877	434882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1000	NC_008044	A	6	6	444362	444367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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