MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008044	CG	3	6	2455163	2455168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_008044	TTG	2	6	2456179	2456184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008044	GC	3	6	2456225	2456230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_008044	TCTT	2	8	2456242	2456249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_008044	A	7	7	2456260	2456266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008044	GAC	2	6	2457769	2457774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_008044	GTC	2	6	2457792	2457797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_008044	TTTTC	2	10	2457798	2457807	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5509	NC_008044	ATT	2	6	2457841	2457846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008044	ATTT	2	8	2457961	2457968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008044	CAC	2	6	2458021	2458026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_008044	CAA	2	6	2458060	2458065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_008044	GGCGA	2	10	2458066	2458075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5514	NC_008044	C	6	6	2459245	2459250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5515	NC_008044	TTC	2	6	2459277	2459282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_008044	GC	3	6	2462062	2462067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_008044	CCCG	2	8	2462069	2462076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5518	NC_008044	TCG	2	6	2462077	2462082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_008044	TCC	2	6	2462100	2462105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_008044	CG	3	6	2462129	2462134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_008044	AC	4	8	2462151	2462158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_008044	CGCCCC	2	12	2463726	2463737	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
5523	NC_008044	GCTCA	2	10	2463798	2463807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5524	NC_008044	CTTT	2	8	2464833	2464840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_008044	GA	3	6	2464972	2464977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008044	CCG	2	6	2464997	2465002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_008044	AGG	2	6	2465026	2465031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_008044	GGA	2	6	2465321	2465326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008044	GAC	2	6	2465534	2465539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_008044	TAAA	2	8	2466532	2466539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008044	CCT	2	6	2466583	2466588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_008044	TAA	2	6	2466621	2466626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008044	CGGAC	2	10	2468796	2468805	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5534	NC_008044	GC	3	6	2468826	2468831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_008044	GTT	2	6	2468875	2468880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008044	T	6	6	2468911	2468916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008044	CAA	2	6	2473728	2473733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008044	GCAGA	2	10	2474349	2474358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5539	NC_008044	GCA	2	6	2474366	2474371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_008044	CCCTG	2	10	2475741	2475750	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5541	NC_008044	TGC	2	6	2475798	2475803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_008044	CCG	2	6	2477291	2477296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_008044	TATC	2	8	2478227	2478234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_008044	AAAC	2	8	2480392	2480399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_008044	CTG	2	6	2481087	2481092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_008044	CGAA	2	8	2481882	2481889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_008044	GGTTCA	2	12	2481892	2481903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5548	NC_008044	A	7	7	2481964	2481970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008044	CGA	2	6	2483971	2483976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_008044	GCCAC	2	10	2486718	2486727	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5551	NC_008044	CTGC	2	8	2490438	2490445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_008044	CGT	2	6	2490463	2490468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_008044	GCA	2	6	2491657	2491662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_008044	GC	3	6	2491704	2491709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_008044	CGC	2	6	2491744	2491749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_008044	GATC	2	8	2491794	2491801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_008044	CG	3	6	2494167	2494172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_008044	T	7	7	2494284	2494290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008044	CA	3	6	2494693	2494698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_008044	CGC	2	6	2494713	2494718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_008044	ACTC	2	8	2495147	2495154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_008044	CCA	2	6	2495166	2495171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_008044	ATT	2	6	2495176	2495181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008044	GCC	2	6	2495240	2495245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_008044	CG	4	8	2496155	2496162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_008044	TG	3	6	2496187	2496192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008044	GCCGC	2	10	2496214	2496223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5568	NC_008044	GC	3	6	2497552	2497557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_008044	TG	3	6	2497564	2497569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008044	GC	4	8	2499826	2499833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_008044	GC	3	6	2499852	2499857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_008044	CCT	2	6	2499904	2499909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_008044	TTG	2	6	2500686	2500691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008044	CG	5	10	2500735	2500744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_008044	GCCT	2	8	2502539	2502546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_008044	TCA	2	6	2502556	2502561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_008044	CCT	2	6	2503275	2503280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_008044	CGCAGT	2	12	2503371	2503382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_008044	GCA	2	6	2503773	2503778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_008044	AC	3	6	2503804	2503809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_008044	GC	3	6	2504673	2504678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_008044	CCT	2	6	2504698	2504703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_008044	CAG	2	6	2504716	2504721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_008044	CG	3	6	2504774	2504779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_008044	CGCC	2	8	2504797	2504804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5586	NC_008044	AGC	2	6	2508171	2508176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_008044	GC	3	6	2508195	2508200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_008044	AGCG	2	8	2508261	2508268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_008044	AAC	2	6	2508286	2508291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_008044	ATT	2	6	2508303	2508308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008044	AGACG	2	10	2508335	2508344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5592	NC_008044	ACCGA	2	10	2508371	2508380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5593	NC_008044	A	6	6	2511374	2511379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008044	TTG	2	6	2512002	2512007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008044	CGCT	2	8	2512055	2512062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_008044	CTG	2	6	2512066	2512071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_008044	CCGGC	2	10	2512120	2512129	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5598	NC_008044	TTG	2	6	2512160	2512165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008044	TTG	2	6	2512218	2512223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008044	GCA	2	6	2512262	2512267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_008044	TGG	2	6	2512352	2512357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008044	CGTG	2	8	2512364	2512371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_008044	CATTG	2	10	2512433	2512442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5604	NC_008044	AAG	2	6	2512445	2512450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008044	TTG	2	6	2512472	2512477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008044	CCA	2	6	2512479	2512484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_008044	C	6	6	2512594	2512599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5608	NC_008044	AG	3	6	2512601	2512606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008044	G	6	6	2512606	2512611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008044	CCT	2	6	2515509	2515514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_008044	CAC	2	6	2515603	2515608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_008044	GCCT	2	8	2517160	2517167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_008044	CGG	2	6	2517305	2517310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_008044	CT	3	6	2517326	2517331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_008044	AGT	2	6	2517336	2517341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_008044	TGC	2	6	2517440	2517445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_008044	AGC	2	6	2517456	2517461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_008044	TAG	2	6	2517509	2517514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008044	CTCC	2	8	2517531	2517538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5620	NC_008044	ATT	2	6	2517565	2517570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008044	CGCCA	2	10	2518620	2518629	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5622	NC_008044	CGG	2	6	2518662	2518667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_008044	TCAT	2	8	2518703	2518710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5624	NC_008044	GCCA	2	8	2518730	2518737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_008044	CCGCC	2	10	2518748	2518757	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5626	NC_008044	CAGC	2	8	2525622	2525629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_008044	TCCG	2	8	2525645	2525652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_008044	CT	3	6	2526470	2526475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_008044	CTT	2	6	2526491	2526496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_008044	AGC	2	6	2528045	2528050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_008044	GC	3	6	2528168	2528173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_008044	ACC	2	6	2546602	2546607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_008044	CG	3	6	2546609	2546614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_008044	ACCCC	2	10	2546647	2546656	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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