MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	A	6	6	24470	24475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008043	G	7	7	39546	39552	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008043	C	8	8	39586	39593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_008043	C	7	7	43493	43499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_008043	A	6	6	44052	44057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008043	G	6	6	44451	44456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008043	T	6	6	54277	54282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008043	G	6	6	56005	56010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008043	C	6	6	56337	56342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_008043	T	6	6	57280	57285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008043	T	6	6	57339	57344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008043	C	7	7	61252	61258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_008043	T	7	7	61323	61329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008043	A	6	6	62671	62676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008043	T	6	6	67579	67584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008043	A	6	6	78037	78042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008043	T	6	6	80316	80321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008043	G	6	6	96391	96396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008043	T	6	6	99392	99397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008043	A	8	8	102962	102969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008043	T	8	8	102994	103001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008043	T	6	6	106316	106321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008043	C	6	6	114950	114955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_008043	A	6	6	146621	146626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008043	C	7	7	150547	150553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_008043	A	6	6	150563	150568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008043	A	8	8	155021	155028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008043	C	6	6	156168	156173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_008043	A	6	6	168103	168108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008043	T	7	7	172125	172131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008043	T	7	7	173153	173159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008043	G	6	6	173664	173669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008043	C	6	6	175497	175502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_008043	C	6	6	177374	177379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_008043	T	6	6	177541	177546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008043	A	7	7	179254	179260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008043	A	6	6	189510	189515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008043	C	6	6	197770	197775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_008043	T	6	6	198684	198689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008043	G	8	8	237770	237777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008043	A	6	6	240547	240552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008043	G	6	6	249515	249520	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008043	G	6	6	250935	250940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008043	C	8	8	251567	251574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_008043	A	6	6	255124	255129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008043	T	6	6	277558	277563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008043	T	6	6	281223	281228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008043	T	6	6	281347	281352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008043	A	6	6	291900	291905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008043	A	6	6	292210	292215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008043	G	6	6	309828	309833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008043	C	6	6	327541	327546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_008043	C	6	6	335660	335665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_008043	T	8	8	387028	387035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008043	T	6	6	404092	404097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008043	A	6	6	427281	427286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008043	A	6	6	428607	428612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008043	T	7	7	433264	433270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008043	G	8	8	433271	433278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008043	A	6	6	445298	445303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008043	G	6	6	456568	456573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008043	A	6	6	466914	466919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008043	G	8	8	480653	480660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008043	G	6	6	498838	498843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008043	G	7	7	501435	501441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008043	T	6	6	502401	502406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008043	T	7	7	505477	505483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008043	A	6	6	507191	507196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008043	G	6	6	507358	507363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008043	G	6	6	509234	509239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008043	C	6	6	511067	511072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_008043	A	7	7	511577	511583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008043	C	6	6	515828	515833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_008043	G	10	10	526466	526475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008043	C	6	6	540487	540492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_008043	G	6	6	553776	553781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008043	C	7	7	566354	566360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_008043	G	7	7	569416	569422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008043	G	7	7	582121	582127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008043	G	8	8	587175	587182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008043	C	8	8	596463	596470	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_008043	T	8	8	606046	606053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008043	G	6	6	613453	613458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008043	C	6	6	613469	613474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_008043	A	6	6	621729	621734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008043	A	6	6	623442	623447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008043	G	6	6	623609	623614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008043	G	6	6	625486	625491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008043	C	6	6	627319	627324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_008043	A	7	7	627829	627835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008043	G	6	6	632378	632383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008043	C	6	6	632394	632399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_008043	C	6	6	635656	635661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_008043	T	7	7	644514	644520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008043	T	6	6	645188	645193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008043	T	6	6	664850	664855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008043	T	6	6	680419	680424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008043	T	6	6	684279	684284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008043	G	7	7	685890	685896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008043	A	6	6	700803	700808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008043	A	6	6	724340	724345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008043	T	6	6	734224	734229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008043	G	6	6	781071	781076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008043	G	6	6	786250	786255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008043	A	6	6	805571	805576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008043	C	7	7	806201	806207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_008043	A	6	6	815479	815484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008043	G	6	6	816662	816667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008043	A	6	6	816710	816715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.