MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 335

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	TC	4	8	5302	5309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008043	GT	3	6	5339	5344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008043	GC	3	6	7815	7820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008043	GC	3	6	12350	12355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008043	CG	3	6	12430	12435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008043	CG	3	6	12706	12711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008043	CT	3	6	19217	19222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008043	AG	3	6	24411	24416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008043	TA	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008043	CG	3	6	24935	24940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008043	CT	3	6	28524	28529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008043	TG	3	6	29732	29737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008043	CG	3	6	32361	32366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008043	GC	3	6	33920	33925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008043	AG	3	6	38738	38743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008043	GC	3	6	41245	41250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008043	TG	3	6	41267	41272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008043	AC	3	6	43442	43447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008043	GC	3	6	44089	44094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008043	CT	3	6	44410	44415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008043	GC	3	6	46012	46017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008043	GC	3	6	51925	51930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008043	GC	3	6	51995	52000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008043	CG	3	6	56432	56437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008043	GC	3	6	56439	56444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008043	GC	3	6	60522	60527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008043	CG	3	6	60557	60562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008043	GC	3	6	61260	61265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008043	CT	3	6	63703	63708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008043	CG	3	6	71816	71821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008043	TC	3	6	74317	74322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008043	AG	3	6	80297	80302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008043	AT	3	6	81543	81548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008043	GC	3	6	81640	81645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008043	GC	3	6	81730	81735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008043	CA	3	6	84548	84553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008043	CT	3	6	84569	84574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008043	GC	3	6	91213	91218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008043	GC	3	6	94849	94854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008043	GC	3	6	97926	97931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008043	AG	3	6	99399	99404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008043	CG	3	6	102970	102975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008043	CG	3	6	102988	102993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008043	AT	3	6	111304	111309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008043	TC	4	8	111334	111341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008043	CG	4	8	111497	111504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008043	GC	3	6	111647	111652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008043	CG	3	6	128801	128806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008043	CG	3	6	135129	135134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008043	TC	3	6	136932	136937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008043	CG	3	6	139053	139058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008043	GC	3	6	143013	143018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008043	GA	3	6	144340	144345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008043	GC	3	6	144428	144433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008043	GC	4	8	144629	144636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008043	CA	3	6	144765	144770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008043	CG	3	6	145338	145343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008043	GC	3	6	147670	147675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008043	CA	3	6	149585	149590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008043	CG	3	6	150605	150610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008043	GA	3	6	151132	151137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008043	CG	3	6	158318	158323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008043	CA	3	6	160920	160925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008043	CT	3	6	161099	161104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008043	AG	3	6	173164	173169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008043	CG	3	6	174150	174155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008043	TC	3	6	174756	174761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008043	TC	3	6	175017	175022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008043	TC	3	6	175064	175069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008043	GT	3	6	175409	175414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008043	TC	3	6	176776	176781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008043	CG	3	6	176842	176847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008043	GT	3	6	177433	177438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008043	GT	3	6	177580	177585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008043	TC	3	6	177794	177799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008043	GT	3	6	177949	177954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008043	CT	3	6	178143	178148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008043	CG	3	6	178228	178233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008043	TC	3	6	179133	179138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008043	GC	4	8	186767	186774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008043	CT	3	6	186801	186806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008043	GC	3	6	189341	189346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008043	CG	3	6	189357	189362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008043	CG	3	6	189724	189729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008043	GA	3	6	191153	191158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008043	AC	3	6	193066	193071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008043	CG	3	6	197816	197821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008043	AC	3	6	202946	202951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008043	GC	3	6	202973	202978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008043	CG	3	6	203042	203047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008043	GA	4	8	203128	203135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008043	TC	3	6	205572	205577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008043	GC	3	6	207232	207237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008043	CT	3	6	207303	207308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008043	AC	3	6	208022	208027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008043	GC	3	6	211329	211334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008043	CG	3	6	211350	211355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008043	GC	3	6	216847	216852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008043	CA	3	6	220508	220513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008043	AG	3	6	220695	220700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008043	GC	3	6	227665	227670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008043	TG	4	8	230646	230653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008043	CG	5	10	230688	230697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008043	TC	3	6	230730	230735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008043	CT	3	6	234181	234186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008043	GC	4	8	235212	235219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008043	GC	3	6	237760	237765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008043	GC	3	6	237811	237816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008043	CG	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008043	CG	3	6	251704	251709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008043	GC	3	6	251725	251730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008043	CT	3	6	252294	252299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008043	GC	3	6	252574	252579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008043	CA	4	8	262409	262416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008043	CA	3	6	262491	262496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008043	GC	3	6	265299	265304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008043	GC	4	8	265326	265333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008043	GT	3	6	265363	265368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008043	GA	3	6	269113	269118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008043	TG	3	6	275576	275581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008043	AG	3	6	277589	277594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008043	GT	3	6	280065	280070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008043	AC	3	6	280252	280257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008043	GC	3	6	281300	281305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008043	CA	3	6	281326	281331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008043	GC	3	6	282027	282032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008043	GC	3	6	282999	283004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008043	TC	3	6	283790	283795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008043	CG	3	6	284023	284028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008043	CA	3	6	291937	291942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008043	CG	4	8	297295	297302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008043	CG	3	6	297484	297489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008043	GC	5	10	301924	301933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008043	CG	3	6	302385	302390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008043	CG	3	6	302430	302435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008043	CG	4	8	302852	302859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008043	AC	3	6	307085	307090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008043	GC	3	6	308324	308329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008043	GC	3	6	309194	309199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008043	GC	3	6	309365	309370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008043	CG	3	6	310020	310025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008043	AG	3	6	311174	311179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008043	TC	3	6	319779	319784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008043	GC	3	6	322201	322206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008043	CT	3	6	328579	328584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008043	CG	4	8	331260	331267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008043	GC	3	6	332096	332101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008043	AC	3	6	335937	335942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008043	TC	3	6	336065	336070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008043	AC	3	6	336107	336112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008043	CG	3	6	336145	336150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008043	CG	3	6	336240	336245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008043	GC	3	6	340237	340242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008043	TC	3	6	343803	343808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_008043	TC	3	6	343817	343822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_008043	AG	3	6	351988	351993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.