MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007958	CCG	2	6	1032782	1032787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_007958	GGCGC	2	10	1034396	1034405	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3003	NC_007958	CGCA	2	8	1034459	1034466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_007958	GC	3	6	1034513	1034518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_007958	GCC	3	9	1034533	1034541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_007958	TGGT	2	8	1036213	1036220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_007958	GATCC	2	10	1036253	1036262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3008	NC_007958	TGA	2	6	1036268	1036273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_007958	GC	3	6	1036276	1036281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_007958	GCA	2	6	1036341	1036346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_007958	CCG	2	6	1036379	1036384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_007958	G	7	7	1036384	1036390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007958	CGG	2	6	1036395	1036400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007958	CG	3	6	1036405	1036410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_007958	AAC	2	6	1036761	1036766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_007958	GC	3	6	1036825	1036830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_007958	GCT	2	6	1036846	1036851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_007958	CGC	2	6	1038360	1038365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_007958	GAT	2	6	1038384	1038389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_007958	ATT	2	6	1038417	1038422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_007958	CTG	2	6	1038454	1038459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_007958	GCGG	2	8	1038534	1038541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_007958	CCCG	2	8	1038563	1038570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3024	NC_007958	CGC	2	6	1038614	1038619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_007958	TGA	2	6	1038994	1038999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_007958	ACGG	2	8	1039009	1039016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_007958	CG	3	6	1039032	1039037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_007958	AGG	2	6	1039115	1039120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007958	TCGGC	2	10	1039188	1039197	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_007958	CGG	2	6	1039245	1039250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_007958	GC	3	6	1039259	1039264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_007958	TCG	2	6	1039318	1039323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_007958	ACG	2	6	1039330	1039335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_007958	CTC	2	6	1039386	1039391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_007958	CGC	2	6	1039415	1039420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_007958	GA	3	6	1039544	1039549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_007958	AGG	2	6	1039601	1039606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007958	TCG	3	9	1039666	1039674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_007958	ATG	2	6	1039678	1039683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_007958	TCGT	2	8	1039713	1039720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_007958	TCT	2	6	1039734	1039739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_007958	GGC	2	6	1039821	1039826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_007958	CG	4	8	1039831	1039838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_007958	CCT	2	6	1040332	1040337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_007958	GAC	2	6	1040434	1040439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3047	NC_007958	GAT	2	6	1041743	1041748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_007958	GGA	2	6	1041781	1041786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_007958	AAG	2	6	1041810	1041815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_007958	AG	3	6	1041849	1041854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_007958	ATC	2	6	1041898	1041903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3053	NC_007958	GTC	3	9	1042541	1042549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_007958	GTC	2	6	1042587	1042592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_007958	GC	3	6	1042626	1042631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_007958	CG	3	6	1042634	1042639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_007958	GAG	2	6	1042657	1042662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_007958	GAG	2	6	1042676	1042681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_007958	TGGTTC	2	12	1042713	1042724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3060	NC_007958	GATG	2	8	1043514	1043521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_007958	CATGG	2	10	1044504	1044513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_007958	CTGA	2	8	1046579	1046586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_007958	TGC	2	6	1046591	1046596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_007958	CCA	2	6	1046624	1046629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_007958	CGGC	2	8	1046655	1046662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_007958	CCG	2	6	1047563	1047568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_007958	CCG	2	6	1047588	1047593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_007958	CGGA	2	8	1049346	1049353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_007958	ATCG	2	8	1050421	1050428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_007958	CGCGG	2	10	1050741	1050750	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3071	NC_007958	TCC	2	6	1051117	1051122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_007958	TG	3	6	1051128	1051133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_007958	GGA	2	6	1051156	1051161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_007958	GC	3	6	1051187	1051192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_007958	GC	4	8	1051213	1051220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_007958	GGC	2	6	1051932	1051937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_007958	GCC	2	6	1053397	1053402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_007958	GGTGGG	2	12	1055035	1055046	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_007958	CGG	2	6	1055059	1055064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_007958	CG	3	6	1055085	1055090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_007958	CCG	2	6	1055153	1055158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_007958	CGC	2	6	1055159	1055164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_007958	TAACC	2	10	1055184	1055193	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3086	NC_007958	TTGG	2	8	1055627	1055634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_007958	GGC	2	6	1055640	1055645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_007958	TGG	2	6	1055693	1055698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_007958	CGG	2	6	1055708	1055713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_007958	GCC	2	6	1055730	1055735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_007958	GGC	2	6	1055754	1055759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_007958	GA	3	6	1055766	1055771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_007958	TCGCCC	2	12	1058446	1058457	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_007958	CAGG	2	8	1058899	1058906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_007958	CGGC	3	12	1058918	1058929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_007958	GGATC	2	10	1058938	1058947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_007958	GGCGT	2	10	1059929	1059938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3098	NC_007958	CGATCG	2	12	1059956	1059967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_007958	GGC	2	6	1061628	1061633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_007958	CG	3	6	1061644	1061649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_007958	AACG	2	8	1061671	1061678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_007958	TCG	2	6	1061692	1061697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_007958	TCT	2	6	1061717	1061722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_007958	CG	4	8	1063405	1063412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_007958	CTG	2	6	1063422	1063427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_007958	GTT	2	6	1063484	1063489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_007958	GCG	2	6	1064259	1064264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_007958	TTG	2	6	1065522	1065527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_007958	GC	3	6	1065565	1065570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_007958	CGGAG	2	10	1065635	1065644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3111	NC_007958	CGC	2	6	1065655	1065660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_007958	GC	3	6	1065664	1065669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_007958	GCA	2	6	1065714	1065719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_007958	TGC	2	6	1067374	1067379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_007958	GCA	2	6	1067454	1067459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_007958	GC	4	8	1067513	1067520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_007958	GCG	2	6	1068533	1068538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_007958	GA	3	6	1068547	1068552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_007958	CTC	2	6	1069738	1069743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_007958	ATG	2	6	1072278	1072283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3122	NC_007958	GCG	2	6	1072359	1072364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_007958	GCT	2	6	1072423	1072428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_007958	CGCGG	2	10	1072459	1072468	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3126	NC_007958	TGA	2	6	1072469	1072474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_007958	GCG	2	6	1072477	1072482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_007958	CGC	2	6	1072509	1072514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_007958	CGC	2	6	1072534	1072539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3131	NC_007958	AT	3	6	1072612	1072617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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