MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007958	GCCG	2	8	486950	486957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_007958	GA	3	6	486968	486973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007958	GCC	2	6	487498	487503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_007958	CGGC	2	8	488232	488239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_007958	TCC	2	6	488849	488854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_007958	TCG	2	6	488879	488884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_007958	TTG	2	6	488905	488910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007958	AAC	2	6	490435	490440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_007958	CGC	2	6	490449	490454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_007958	GCC	2	6	490472	490477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_007958	GCGG	2	8	490478	490485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_007958	TTC	2	6	490500	490505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_007958	AGC	2	6	490581	490586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_007958	CCG	2	6	490606	490611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_007958	GGC	2	6	490858	490863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_007958	TGCG	2	8	491359	491366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_007958	GCC	2	6	491444	491449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_007958	CCTT	2	8	491475	491482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_007958	CGT	2	6	491491	491496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_007958	CT	3	6	491539	491544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_007958	CT	3	6	491561	491566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_007958	C	7	7	491583	491589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1523	NC_007958	TCCG	2	8	492857	492864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_007958	T	6	6	492907	492912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_007958	CGA	2	6	494443	494448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_007958	CGT	2	6	494517	494522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_007958	GAG	2	6	496461	496466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_007958	CGGG	2	8	496497	496504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_007958	TGAG	2	8	496505	496512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_007958	CCCCA	2	10	496543	496552	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1531	NC_007958	GC	3	6	496581	496586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_007958	GGC	2	6	496596	496601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_007958	GCATA	2	10	496684	496693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1534	NC_007958	GC	3	6	496717	496722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_007958	TGGGG	2	10	496751	496760	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_007958	CG	3	6	496790	496795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_007958	GCG	2	6	496846	496851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_007958	CG	4	8	496850	496857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_007958	GTC	2	6	496861	496866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_007958	TCG	2	6	496987	496992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_007958	GC	3	6	498609	498614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_007958	GCAC	2	8	498659	498666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_007958	GCT	3	9	498699	498707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_007958	GGC	2	6	498764	498769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_007958	CGG	2	6	498808	498813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_007958	ACG	2	6	498844	498849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_007958	GTC	2	6	499864	499869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_007958	CGC	2	6	499870	499875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_007958	CG	3	6	499923	499928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_007958	ACGA	2	8	499939	499946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_007958	GT	3	6	499966	499971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007958	CAC	2	6	499990	499995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_007958	GAT	2	6	500002	500007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_007958	TTCTG	2	10	500056	500065	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_007958	TTC	2	6	500073	500078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_007958	CGG	2	6	501155	501160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_007958	GCG	2	6	501171	501176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_007958	CGGC	2	8	504384	504391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_007958	CG	3	6	504422	504427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_007958	CG	4	8	504464	504471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_007958	GC	3	6	504474	504479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_007958	ATGGG	2	10	504511	504520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_007958	GCC	2	6	504532	504537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_007958	CGG	2	6	504569	504574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_007958	AC	3	6	506285	506290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_007958	CTT	2	6	506313	506318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_007958	GC	3	6	506375	506380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_007958	CGG	2	6	506419	506424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_007958	GCTC	3	12	507119	507130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_007958	GC	3	6	507133	507138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_007958	GCGG	3	12	507732	507743	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_007958	CG	3	6	507814	507819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_007958	GCC	2	6	507838	507843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_007958	CGC	2	6	508589	508594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_007958	T	6	6	508675	508680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_007958	GCCG	2	8	508681	508688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_007958	CT	3	6	509172	509177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_007958	CGAGC	2	10	509211	509220	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_007958	GC	3	6	509258	509263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_007958	CAT	2	6	509276	509281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_007958	GCG	2	6	509317	509322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_007958	CCCCA	2	10	509339	509348	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1583	NC_007958	GC	3	6	509375	509380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_007958	CCG	2	6	511466	511471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_007958	CCA	2	6	515252	515257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_007958	C	6	6	516195	516200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1587	NC_007958	GGA	2	6	516202	516207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_007958	GTC	2	6	517677	517682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_007958	GAAG	2	8	517691	517698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_007958	CTGG	2	8	518085	518092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_007958	GC	3	6	518184	518189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_007958	GCA	2	6	518233	518238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_007958	AGG	2	6	518335	518340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_007958	TAATA	2	10	518357	518366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_007958	TGG	2	6	518371	518376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_007958	CGG	2	6	518703	518708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_007958	TGG	2	6	518712	518717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_007958	CAA	2	6	518752	518757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_007958	GCGCTC	2	12	518758	518769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_007958	CGT	2	6	518846	518851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_007958	CCG	2	6	518869	518874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_007958	TTCTG	2	10	518921	518930	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_007958	TTC	2	6	518938	518943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_007958	AAT	2	6	519351	519356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_007958	AAG	2	6	519368	519373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_007958	GC	3	6	519425	519430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_007958	TGAT	2	8	519442	519449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_007958	TC	3	6	519464	519469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_007958	ATG	2	6	519553	519558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_007958	AAGCG	2	10	520519	520528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_007958	TGA	2	6	520543	520548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_007958	CGG	3	9	520606	520614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_007958	AAG	2	6	521960	521965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007958	CGC	2	6	521968	521973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_007958	GC	3	6	521993	521998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_007958	CTG	2	6	522011	522016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_007958	GCGGA	2	10	522062	522071	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1618	NC_007958	CGGG	2	8	522112	522119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_007958	CGT	2	6	522431	522436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_007958	ATT	2	6	523165	523170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_007958	CGT	2	6	523172	523177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_007958	GAAA	2	8	523204	523211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_007958	CGGC	2	8	524286	524293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_007958	GGC	3	9	524291	524299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_007958	CAG	2	6	524330	524335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_007958	GC	4	8	524349	524356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_007958	GCG	2	6	524373	524378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_007958	GCC	2	6	524389	524394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_007958	C	7	7	524393	524399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1630	NC_007958	GCC	2	6	524419	524424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_007958	GCC	2	6	524620	524625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_007958	A	8	8	526425	526432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_007958	TTC	2	6	527322	527327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_007958	GGC	2	6	527335	527340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_007958	GCG	2	6	527405	527410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_007958	GCG	2	6	527699	527704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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