MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007958	CGC	2	6	2178196	2178201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_007958	GC	3	6	2178200	2178205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_007958	GCG	2	6	2178207	2178212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_007958	TTG	2	6	2179198	2179203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007958	ATC	2	6	2179225	2179230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007958	CGGCG	2	10	2179252	2179261	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_007958	CG	3	6	2179260	2179265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_007958	A	7	7	2179756	2179762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_007958	GCCG	2	8	2179931	2179938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_007958	CTGC	2	8	2181021	2181028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_007958	AT	3	6	2181061	2181066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_007958	CG	3	6	2181525	2181530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_007958	CGT	2	6	2181535	2181540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_007958	CCTT	2	8	2181575	2181582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_007958	TTAC	2	8	2181614	2181621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_007958	AAAAC	2	10	2181641	2181650	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6017	NC_007958	TTTCG	2	10	2181695	2181704	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6018	NC_007958	CCA	2	6	2181719	2181724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_007958	CCG	2	6	2181738	2181743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_007958	GCA	2	6	2181794	2181799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_007958	CG	3	6	2181815	2181820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_007958	CGTT	2	8	2181838	2181845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_007958	CCAA	2	8	2181869	2181876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_007958	AGCG	2	8	2181910	2181917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_007958	TTG	2	6	2184564	2184569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_007958	CTCG	2	8	2184607	2184614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_007958	GGC	2	6	2184985	2184990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_007958	GCG	2	6	2186194	2186199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_007958	CACC	2	8	2188016	2188023	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6030	NC_007958	CCA	2	6	2188118	2188123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_007958	CAT	2	6	2188159	2188164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007958	C	6	6	2188213	2188218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6033	NC_007958	ACC	2	6	2188224	2188229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_007958	GGT	2	6	2188252	2188257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_007958	GAC	2	6	2188286	2188291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_007958	GCGCC	2	10	2188313	2188322	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6037	NC_007958	CGC	4	12	2188328	2188339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_007958	CCT	2	6	2192684	2192689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_007958	GCC	2	6	2192701	2192706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_007958	ATC	2	6	2192741	2192746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_007958	AAT	2	6	2192874	2192879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_007958	ATT	2	6	2192884	2192889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_007958	ATGCT	2	10	2192916	2192925	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6044	NC_007958	CCT	2	6	2192927	2192932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_007958	GATC	2	8	2192938	2192945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_007958	TCG	2	6	2192967	2192972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007958	TTCCG	2	10	2192996	2193005	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_007958	TGC	2	6	2193009	2193014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_007958	CT	3	6	2195586	2195591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_007958	CGG	2	6	2195596	2195601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_007958	TCT	2	6	2195652	2195657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_007958	TGT	2	6	2195693	2195698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_007958	TCT	2	6	2195705	2195710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_007958	AC	3	6	2195811	2195816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_007958	CCTT	2	8	2195868	2195875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_007958	TCC	2	6	2195884	2195889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_007958	TCG	2	6	2197215	2197220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_007958	GC	3	6	2197262	2197267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_007958	TGC	2	6	2197268	2197273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_007958	CGTG	2	8	2197326	2197333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_007958	ATG	2	6	2197361	2197366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_007958	ACG	2	6	2197418	2197423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_007958	GGA	2	6	2197433	2197438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_007958	TGC	2	6	2197795	2197800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_007958	GCCGC	2	10	2197823	2197832	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6066	NC_007958	GC	3	6	2197831	2197836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_007958	ACC	2	6	2197854	2197859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_007958	CGG	2	6	2199557	2199562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_007958	GC	3	6	2199665	2199670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_007958	CG	3	6	2199675	2199680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_007958	GCA	2	6	2199715	2199720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_007958	CGG	2	6	2201139	2201144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_007958	GGC	2	6	2201170	2201175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_007958	TCC	3	9	2201248	2201256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_007958	GGAA	2	8	2201262	2201269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_007958	CGAACC	2	12	2201508	2201519	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_007958	CGT	3	9	2201545	2201553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_007958	CG	3	6	2201575	2201580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_007958	GCG	2	6	2201608	2201613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_007958	GGC	3	9	2201658	2201666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_007958	CG	3	6	2201882	2201887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_007958	CGG	3	9	2201893	2201901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_007958	CGG	2	6	2201991	2201996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_007958	CGA	2	6	2202007	2202012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_007958	ATC	2	6	2202041	2202046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_007958	CG	3	6	2202062	2202067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_007958	CGA	2	6	2202357	2202362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_007958	ACG	2	6	2202377	2202382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_007958	ATC	2	6	2203364	2203369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_007958	CCG	2	6	2203375	2203380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_007958	CGGC	2	8	2203395	2203402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_007958	AG	3	6	2204618	2204623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_007958	GC	3	6	2204977	2204982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_007958	CG	4	8	2205010	2205017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_007958	AAC	2	6	2205079	2205084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_007958	GCG	2	6	2206290	2206295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_007958	CTT	2	6	2206759	2206764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_007958	GGAGGG	2	12	2206776	2206787	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_007958	CG	3	6	2206801	2206806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_007958	GGGGT	2	10	2206822	2206831	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_007958	CG	3	6	2206836	2206841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_007958	CGG	2	6	2206844	2206849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_007958	CCACC	2	10	2206862	2206871	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6104	NC_007958	CGCT	2	8	2206873	2206880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_007958	CCCTCC	2	12	2206892	2206903	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
6106	NC_007958	GTC	2	6	2206915	2206920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_007958	GCC	2	6	2206974	2206979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_007958	GCCGT	2	10	2206986	2206995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6109	NC_007958	ATTC	2	8	2207027	2207034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_007958	CGG	2	6	2207804	2207809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_007958	GC	3	6	2207847	2207852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_007958	GGGT	2	8	2209196	2209203	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_007958	TCG	2	6	2209794	2209799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_007958	CG	3	6	2209798	2209803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_007958	AAT	2	6	2209863	2209868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_007958	TAGC	2	8	2209888	2209895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_007958	ATGTT	2	10	2209952	2209961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_007958	CCT	2	6	2209980	2209985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_007958	ACG	2	6	2210019	2210024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_007958	CGG	2	6	2210030	2210035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_007958	CCG	2	6	2210098	2210103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_007958	CGT	2	6	2214467	2214472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_007958	GCC	2	6	2214482	2214487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_007958	TCC	2	6	2214488	2214493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_007958	TGG	2	6	2214527	2214532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_007958	GCG	2	6	2214558	2214563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_007958	GCG	2	6	2214574	2214579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_007958	CGC	2	6	2214587	2214592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_007958	GC	3	6	2214620	2214625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_007958	ATC	2	6	2214669	2214674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_007958	CGCATC	2	12	2215367	2215378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_007958	CAA	2	6	2215398	2215403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_007958	GAC	2	6	2215416	2215421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_007958	GCT	3	9	2215425	2215433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6136	NC_007958	CCG	2	6	2216698	2216703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6140	NC_007958	TGG	2	6	2217571	2217576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6260	NC_007958	AGT	2	6	2272351	2272356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6396	NC_007958	CGTT	2	8	2335229	2335236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6397	NC_007958	ATCC	2	8	2336115	2336122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6398	NC_007958	CTCG	2	8	2339467	2339474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6399	NC_007958	GTCG	2	8	2339475	2339482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6401	NC_007958	CGGG	2	8	2341526	2341533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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