MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007958	CGA	2	6	1855996	1856001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_007958	CGCC	2	8	1857104	1857111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5003	NC_007958	GCCG	2	8	1857124	1857131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_007958	CGG	2	6	1857132	1857137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_007958	CAG	2	6	1857181	1857186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_007958	CGC	2	6	1859967	1859972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_007958	ATA	2	6	1859995	1860000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_007958	GCCG	2	8	1860701	1860708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_007958	CGT	2	6	1860731	1860736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_007958	GTCG	2	8	1860750	1860757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_007958	CAG	2	6	1860769	1860774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_007958	CGT	2	6	1860778	1860783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_007958	TCC	2	6	1863419	1863424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_007958	TCC	2	6	1864260	1864265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_007958	CGT	2	6	1864276	1864281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_007958	TCG	2	6	1864336	1864341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_007958	CGT	2	6	1864632	1864637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_007958	GCG	2	6	1866743	1866748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_007958	TCC	2	6	1867818	1867823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_007958	CGG	2	6	1867824	1867829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_007958	GGC	2	6	1867830	1867835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_007958	AAC	2	6	1867948	1867953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_007958	CG	3	6	1867971	1867976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_007958	GCC	2	6	1868068	1868073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_007958	GGC	2	6	1868074	1868079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_007958	GCT	2	6	1868096	1868101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_007958	GGAA	3	12	1868108	1868119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_007958	GCT	2	6	1868122	1868127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_007958	CGGC	2	8	1868128	1868135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_007958	GACGAG	2	12	1868150	1868161	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5031	NC_007958	GTA	2	6	1868729	1868734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_007958	CG	3	6	1868754	1868759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_007958	CG	3	6	1868766	1868771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_007958	T	9	9	1868774	1868782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_007958	TGA	2	6	1868856	1868861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_007958	GCC	2	6	1868909	1868914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_007958	TGC	2	6	1868915	1868920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_007958	CGG	2	6	1869413	1869418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_007958	CGC	2	6	1869482	1869487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_007958	GCG	2	6	1869532	1869537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_007958	GC	3	6	1870160	1870165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_007958	CAA	2	6	1870210	1870215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_007958	GC	4	8	1870239	1870246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_007958	GAT	2	6	1870268	1870273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_007958	CGG	2	6	1870711	1870716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_007958	GGC	2	6	1870759	1870764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007958	GGC	2	6	1870784	1870789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_007958	GCG	2	6	1870794	1870799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_007958	CTT	2	6	1870854	1870859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_007958	TTC	2	6	1870873	1870878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_007958	CTCG	2	8	1870897	1870904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_007958	TTCC	2	8	1871448	1871455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_007958	GGCG	2	8	1871456	1871463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_007958	GGACA	2	10	1871491	1871500	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_007958	GCT	2	6	1873003	1873008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_007958	GGC	2	6	1873069	1873074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_007958	CGG	2	6	1873647	1873652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_007958	TCG	2	6	1873658	1873663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_007958	CGGT	2	8	1873711	1873718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_007958	GA	3	6	1873724	1873729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_007958	ACA	2	6	1873749	1873754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_007958	GCC	2	6	1873775	1873780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_007958	GCA	2	6	1875693	1875698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_007958	GCC	2	6	1880127	1880132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_007958	GC	4	8	1880223	1880230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_007958	TG	3	6	1880271	1880276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_007958	TCGTG	2	10	1880309	1880318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5068	NC_007958	ACA	2	6	1880326	1880331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_007958	CG	3	6	1882205	1882210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_007958	TCGT	2	8	1882221	1882228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_007958	TAGT	2	8	1882238	1882245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_007958	GGC	2	6	1884119	1884124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5074	NC_007958	CGG	2	6	1885776	1885781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_007958	CGGCG	2	10	1885803	1885812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5076	NC_007958	TCGC	2	8	1885850	1885857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_007958	GTT	2	6	1885879	1885884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_007958	AAG	2	6	1885989	1885994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_007958	CGG	2	6	1888347	1888352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_007958	CCG	2	6	1888361	1888366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_007958	CGG	3	9	1888409	1888417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_007958	CGG	2	6	1888514	1888519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_007958	GAA	2	6	1888539	1888544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_007958	AGC	3	9	1888668	1888676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_007958	GC	3	6	1888675	1888680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_007958	CGC	2	6	1888690	1888695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_007958	TC	3	6	1888737	1888742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_007958	CGG	2	6	1888781	1888786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_007958	ACC	2	6	1888798	1888803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_007958	AAG	2	6	1888825	1888830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_007958	CTT	2	6	1888860	1888865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_007958	CAA	2	6	1888902	1888907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007958	GGC	2	6	1888947	1888952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007958	CGA	2	6	1889039	1889044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_007958	CCG	2	6	1889150	1889155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_007958	CGG	3	9	1889190	1889198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_007958	CGC	2	6	1889238	1889243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_007958	CGG	2	6	1889259	1889264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007958	CAC	3	9	1889403	1889411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_007958	TCG	2	6	1889416	1889421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_007958	CCG	2	6	1889423	1889428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_007958	GC	3	6	1889471	1889476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_007958	GGT	2	6	1889523	1889528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_007958	CCGGG	2	10	1889709	1889718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5106	NC_007958	TCAACG	2	12	1889793	1889804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_007958	GCCA	2	8	1889849	1889856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_007958	GGC	2	6	1889918	1889923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_007958	GAC	2	6	1890004	1890009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_007958	TCG	2	6	1890029	1890034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_007958	CGG	2	6	1890178	1890183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_007958	GGC	2	6	1890221	1890226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007958	CGG	2	6	1890259	1890264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_007958	CAA	2	6	1890307	1890312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_007958	AAC	2	6	1890359	1890364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_007958	GCTCG	2	10	1890382	1890391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5117	NC_007958	GGC	2	6	1890401	1890406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_007958	GC	3	6	1890405	1890410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_007958	CAC	2	6	1890442	1890447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_007958	CCG	2	6	1890455	1890460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_007958	GC	4	8	1890485	1890492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_007958	TCG	2	6	1890498	1890503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5124	NC_007958	CAG	2	6	1890524	1890529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_007958	CAC	2	6	1890532	1890537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_007958	CGG	2	6	1890654	1890659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_007958	CAA	2	6	1890715	1890720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_007958	CGA	2	6	1890747	1890752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5130	NC_007958	TGC	2	6	1890837	1890842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5242	NC_007958	GC	3	6	1923848	1923853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5255	NC_007958	GCG	2	6	1926382	1926387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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