MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	ATAAAC	2	12	26679	26690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007940	TTTCTT	2	12	32249	32260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007940	GCCATT	2	12	100078	100089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007940	GCTGAA	2	12	101885	101896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007940	AAATAA	2	12	103410	103421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007940	TTTTAA	2	12	133343	133354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007940	GTTTAT	2	12	133366	133377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007940	AATATT	2	12	164504	164515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007940	ATTTTA	2	12	164597	164608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007940	ATTTTT	2	12	179499	179510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007940	TTTTAA	2	12	187668	187679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007940	AAATAA	2	12	198583	198594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007940	ATGATA	2	12	199369	199380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007940	TAATAT	2	12	213347	213358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007940	ACTGCT	2	12	214986	214997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007940	TATTTT	2	12	224032	224043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007940	TTTTAA	2	12	243311	243322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007940	TTTAAT	2	12	252887	252898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007940	AATGAT	2	12	261379	261390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007940	ACGAAA	2	12	266461	266472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007940	TTTTTA	2	12	270242	270253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007940	ATATCA	2	12	271975	271986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007940	TTAAAA	2	12	285024	285035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007940	AAATTC	2	12	294029	294040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007940	TAAAAA	2	12	306922	306933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007940	TAATAT	2	12	308256	308267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007940	CAAAAT	2	12	310456	310467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007940	TTAAAA	2	12	325737	325748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007940	ATAAAA	2	12	347986	347997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007940	AATATC	2	12	368767	368778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007940	TAAAAG	2	12	370878	370889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007940	TATTTA	2	12	373819	373830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007940	ATATTA	2	12	376105	376116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007940	TTTTAA	2	12	386676	386687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007940	TTTTAA	2	12	391170	391181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007940	TTCTGC	2	12	391215	391226	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007940	TTATAT	2	12	402306	402317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007940	TTTTAA	2	12	411248	411259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007940	TAAATA	2	12	414528	414539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007940	CCTGAA	2	12	419605	419616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007940	CTTTAA	2	12	423991	424002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007940	ATTTTT	2	12	424898	424909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007940	TTGATA	2	12	463830	463841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007940	TCAAGA	2	12	470303	470314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007940	TAATTT	2	12	482092	482103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007940	TCTTTT	2	12	527238	527249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007940	TTATAA	2	12	534261	534272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007940	AATCAC	2	12	534577	534588	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007940	TTTATA	2	12	536724	536735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007940	TAGATA	2	12	537718	537729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007940	ATATAG	2	12	545755	545766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007940	AAAGTA	2	12	550052	550063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007940	TAATTA	2	12	598865	598876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007940	TTAAAA	2	12	603966	603977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007940	GCTTTG	2	12	616618	616629	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007940	AGCTGT	2	12	629924	629935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007940	TTTTAA	2	12	637188	637199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007940	TAAAAA	2	12	653556	653567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007940	AACTTT	2	12	655785	655796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007940	TGCTTC	2	12	656129	656140	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007940	TAAATT	2	12	657639	657650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007940	TTTTAA	2	12	685291	685302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007940	AAGCTA	2	12	687175	687186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007940	TTTTAC	2	12	687398	687409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007940	TAAAAA	2	12	689608	689619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007940	TATTAA	2	12	690778	690789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007940	ATGAAA	2	12	693539	693550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007940	TTATCA	2	12	694460	694471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007940	TACAAA	2	12	719014	719025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007940	TTAATT	2	12	721927	721938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007940	TTAAAA	2	12	744990	745001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007940	TTTAGA	2	12	760503	760514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007940	AAAAGA	2	12	779227	779238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007940	TTAATT	2	12	815383	815394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007940	ATATTT	2	12	861978	861989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007940	TAAATT	2	12	864214	864225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007940	TTTGTT	2	12	869086	869097	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007940	TACAAC	2	12	879554	879565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007940	TTTTAA	2	12	916434	916445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007940	ATAATT	2	12	938519	938530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007940	TTTAAA	2	12	941486	941497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007940	TTAAAA	2	12	946190	946201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007940	ACGCCA	2	12	966203	966214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007940	TTATAA	2	12	984893	984904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007940	AATTTA	2	12	986571	986582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007940	TTATAA	2	12	993174	993185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007940	GAAGCA	2	12	993471	993482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007940	TATAAA	2	12	1004241	1004252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007940	TTTATA	2	12	1007657	1007668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007940	TACTAG	2	12	1009082	1009093	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007940	AATATT	2	12	1050325	1050336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007940	TTTTAA	2	12	1060494	1060505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007940	TTAAAA	2	12	1064597	1064608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007940	ATAGTA	2	12	1070615	1070626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007940	TATTTT	2	12	1073662	1073673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007940	GTAAAT	2	12	1092685	1092696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007940	ATAATT	2	12	1097203	1097214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007940	TTTTAA	2	12	1108580	1108591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007940	TTAAAA	2	12	1138121	1138132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007940	TTAAAA	2	12	1164258	1164269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007940	AGGAAT	2	12	1168374	1168385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007940	GAATAT	2	12	1171418	1171429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007940	TTGGGT	2	12	1177197	1177208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007940	TTGATT	2	12	1179825	1179836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007940	TAAAAA	2	12	1179882	1179893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007940	AATTAG	2	12	1213240	1213251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007940	ATTTAA	2	12	1251187	1251198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007940	TAAATT	2	12	1257992	1258003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007940	GATATT	2	12	1305233	1305244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007940	TTTTAA	2	12	1311507	1311518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007940	AATATC	2	12	1316676	1316687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007940	TTAAAA	2	12	1341883	1341894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007940	AAATTT	2	12	1372313	1372324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007940	TGGTAC	2	12	1372514	1372525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007940	TTATAT	2	12	1386955	1386966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007940	CTTTAA	2	12	1397380	1397391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007940	TTTTAA	2	12	1399704	1399715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007940	TTAGCA	2	12	1414032	1414043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007940	TAAAAA	2	12	1483790	1483801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007940	ATAGCT	2	12	1487025	1487036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007940	TTTAAT	2	12	1489118	1489129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007940	TTTCAA	2	12	1513216	1513227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007940	TACTAT	2	12	1519134	1519145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.