MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 5284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	AGC	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007908	ACA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007908	GAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007908	CGC	2	6	5921	5926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007908	CAG	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007908	TAT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007908	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007908	AGG	2	6	8473	8478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007908	TGC	2	6	12288	12293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007908	ATG	2	6	13371	13376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007908	GAT	2	6	13430	13435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007908	TTC	2	6	14537	14542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007908	CAA	2	6	15479	15484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007908	TTG	2	6	18545	18550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007908	CCA	2	6	18599	18604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007908	CAG	2	6	18639	18644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007908	GGC	2	6	18668	18673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007908	GAA	2	6	18681	18686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007908	GAC	2	6	18699	18704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007908	TTC	2	6	19374	19379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007908	TTG	2	6	19413	19418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007908	CCT	2	6	21695	21700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007908	CAA	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007908	ACT	2	6	21712	21717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007908	GCT	2	6	22460	22465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007908	CGC	2	6	22477	22482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007908	GAC	2	6	23919	23924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007908	ATG	2	6	25417	25422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007908	TGG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007908	CAT	2	6	29064	29069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007908	CTA	2	6	38428	38433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007908	TAG	2	6	38439	38444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007908	GGC	2	6	38544	38549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007908	GCG	2	6	38562	38567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007908	GCT	2	6	39704	39709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007908	AGG	2	6	40703	40708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007908	TTC	2	6	40720	40725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007908	TCT	2	6	40733	40738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007908	TAG	4	12	40759	40770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007908	TGC	2	6	41012	41017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007908	TGC	2	6	41072	41077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007908	TGG	2	6	41111	41116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007908	TGG	2	6	41187	41192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007908	CCT	2	6	41255	41260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007908	GTG	2	6	48378	48383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007908	CGG	2	6	48426	48431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007908	ACC	2	6	48633	48638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007908	TGG	2	6	49857	49862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007908	GCC	2	6	49910	49915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007908	GGC	2	6	54425	54430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007908	GCG	2	6	54511	54516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007908	CAT	2	6	54530	54535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007908	TTG	2	6	54540	54545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007908	AAT	2	6	54615	54620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007908	CCA	2	6	54623	54628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007908	TCA	2	6	55481	55486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007908	TAG	2	6	55508	55513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007908	GCA	2	6	57129	57134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007908	GTC	2	6	57979	57984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007908	CTG	2	6	58796	58801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007908	CAT	2	6	58880	58885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007908	TCA	2	6	60170	60175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007908	GGC	2	6	60720	60725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007908	GCC	2	6	60736	60741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007908	GAC	2	6	60776	60781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007908	AGA	2	6	61289	61294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007908	GAA	2	6	62862	62867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007908	CTA	2	6	64220	64225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007908	GCG	2	6	65993	65998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007908	TCT	2	6	69828	69833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007908	ATC	2	6	69837	69842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007908	TCA	2	6	70227	70232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007908	GCT	2	6	70903	70908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007908	GTC	2	6	72353	72358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007908	CCG	2	6	72436	72441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007908	CGG	2	6	74612	74617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007908	TTG	2	6	74669	74674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007908	GTG	2	6	74757	74762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007908	GCG	2	6	75056	75061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007908	GCG	2	6	77622	77627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007908	GAA	2	6	81076	81081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007908	AGC	2	6	81103	81108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007908	TCA	2	6	81140	81145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007908	GAC	2	6	81739	81744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007908	TCA	2	6	81862	81867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007908	CGG	2	6	82412	82417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007908	GTT	2	6	83312	83317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007908	GTC	2	6	83371	83376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007908	GCT	2	6	83397	83402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007908	CGG	2	6	83430	83435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007908	CGC	2	6	83459	83464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007908	CAG	2	6	83550	83555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007908	GGT	2	6	83566	83571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007908	GCA	2	6	83621	83626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007908	GCG	2	6	83671	83676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007908	GCC	2	6	83677	83682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007908	GTT	2	6	83774	83779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007908	CAG	2	6	83781	83786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007908	GCA	2	6	83813	83818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007908	GCC	2	6	83824	83829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007908	GGC	2	6	83881	83886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007908	CAG	2	6	83910	83915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007908	GCC	2	6	83952	83957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007908	GCC	2	6	84029	84034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007908	CCA	2	6	84042	84047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007908	CAG	2	6	84088	84093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007908	CAG	2	6	84106	84111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007908	GGT	2	6	84141	84146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007908	GCT	2	6	84226	84231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007908	GTT	2	6	84285	84290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007908	GCA	2	6	84348	84353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007908	CAG	2	6	84382	84387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007908	TCG	2	6	84428	84433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007908	ATG	2	6	84434	84439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007908	GCT	2	6	84445	84450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007908	CGG	2	6	84456	84461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007908	GGC	2	6	84526	84531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007908	CTC	2	6	84553	84558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007908	GCA	2	6	84570	84575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007908	AGC	2	6	84645	84650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007908	AGC	2	6	84689	84694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007908	CCA	2	6	84701	84706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007908	GCT	2	6	84715	84720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007908	GCC	2	6	84721	84726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007908	GCC	2	6	84733	84738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007908	CAG	2	6	84757	84762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007908	TGT	2	6	84950	84955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007908	GCC	2	6	85812	85817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007908	CTG	2	6	85820	85825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007908	CCG	2	6	88665	88670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007908	CGC	2	6	88694	88699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007908	TGC	2	6	91550	91555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007908	GGC	2	6	91576	91581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007908	GCT	2	6	92688	92693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007908	CCG	2	6	93298	93303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007908	ATC	2	6	93324	93329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007908	ATT	2	6	97383	97388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_007908	AGC	2	6	98496	98501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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