MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	GT	3	6	9762	9767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007901	TC	3	6	15685	15690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007901	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007901	GC	3	6	26299	26304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007901	CG	3	6	34125	34130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007901	AC	3	6	37034	37039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007901	AT	3	6	37170	37175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007901	TC	3	6	37347	37352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007901	TC	3	6	46739	46744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007901	AC	3	6	49718	49723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007901	GC	3	6	55149	55154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007901	AC	3	6	56327	56332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007901	GT	3	6	56340	56345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007901	GT	3	6	63057	63062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007901	GC	3	6	70371	70376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007901	AT	3	6	70918	70923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007901	TC	3	6	71292	71297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007901	CT	3	6	73745	73750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007901	AT	3	6	81184	81189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007901	CG	3	6	84308	84313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007901	TG	3	6	87095	87100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007901	AG	3	6	87147	87152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007901	GT	3	6	88754	88759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007901	AG	3	6	94658	94663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007901	CG	3	6	103883	103888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007901	GT	3	6	105056	105061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007901	TC	4	8	108342	108349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007901	AT	3	6	108388	108393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007901	GT	3	6	110977	110982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007901	TC	3	6	111240	111245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007901	CA	3	6	114660	114665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007901	AC	3	6	115363	115368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007901	GC	3	6	121937	121942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007901	CT	3	6	124786	124791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007901	CG	3	6	128660	128665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007901	TC	3	6	132023	132028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007901	AC	3	6	134759	134764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007901	CG	3	6	134887	134892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007901	CG	3	6	135102	135107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007901	GC	3	6	138131	138136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007901	GC	3	6	139109	139114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007901	GC	3	6	149578	149583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007901	GC	3	6	150481	150486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007901	GT	3	6	160576	160581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007901	AG	3	6	160609	160614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007901	CA	3	6	169197	169202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007901	CG	3	6	171014	171019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007901	CG	3	6	172264	172269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007901	TC	3	6	184448	184453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007901	TC	3	6	186174	186179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007901	GC	3	6	186431	186436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007901	CT	3	6	187127	187132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007901	GA	3	6	191121	191126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007901	TC	3	6	192451	192456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007901	TA	3	6	198775	198780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007901	GT	3	6	200325	200330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007901	GC	3	6	202424	202429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007901	TG	3	6	205592	205597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007901	AG	4	8	209108	209115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007901	TC	3	6	209608	209613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007901	TC	3	6	211779	211784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007901	AT	3	6	215165	215170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007901	CG	3	6	216850	216855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007901	GC	4	8	218023	218030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007901	CG	3	6	238925	238930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007901	CG	3	6	241189	241194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007901	GC	4	8	244413	244420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007901	TG	3	6	244529	244534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007901	GC	3	6	244571	244576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007901	TG	3	6	244698	244703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007901	GA	3	6	245286	245291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007901	GA	3	6	245558	245563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007901	GC	3	6	245653	245658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007901	TC	3	6	248067	248072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007901	AC	4	8	248419	248426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007901	GC	3	6	249606	249611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007901	GT	3	6	251106	251111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007901	TC	3	6	252290	252295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007901	CT	3	6	256334	256339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.