MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_007778	A	6	6	5330	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007778	T	6	6	9757	9762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007778	A	6	6	53712	53717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007778	C	6	6	53992	53997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_007778	G	6	6	69279	69284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007778	T	6	6	74045	74050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007778	T	6	6	112818	112823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007778	T	6	6	112889	112894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007778	T	6	6	122253	122258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007778	T	6	6	129263	129268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007778	G	6	6	160406	160411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007778	C	6	6	204839	204844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_007778	A	6	6	226027	226032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007778	C	6	6	288384	288389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_007778	A	6	6	302822	302827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007778	C	6	6	311108	311113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_007778	T	6	6	326159	326164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007778	C	6	6	327660	327665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_007778	T	6	6	327731	327736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007778	C	7	7	335902	335908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_007778	G	6	6	351093	351098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007778	A	6	6	351126	351131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007778	G	6	6	354181	354186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007778	G	6	6	362315	362320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007778	G	6	6	373798	373803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007778	A	6	6	376604	376609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007778	C	6	6	376670	376675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_007778	A	6	6	381853	381858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007778	A	6	6	392808	392813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007778	C	6	6	420701	420706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_007778	G	6	6	424673	424678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007778	A	6	6	440711	440716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007778	C	6	6	444391	444396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_007778	T	6	6	450058	450063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007778	C	7	7	471965	471971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_007778	G	6	6	491298	491303	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007778	T	6	6	530037	530042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007778	G	6	6	614383	614388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007778	C	6	6	614634	614639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_007778	A	6	6	650862	650867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007778	C	6	6	670022	670027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_007778	T	6	6	670039	670044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007778	G	6	6	681308	681313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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46	NC_007778	C	6	6	733279	733284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_007778	A	6	6	769274	769279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007778	G	6	6	803183	803188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007778	G	6	6	846499	846504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007778	A	6	6	852332	852337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007778	T	6	6	865245	865250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007778	A	7	7	887652	887658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007778	G	6	6	893887	893892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007778	G	6	6	897138	897143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_007778	A	6	6	1338126	1338131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_007778	T	6	6	1376986	1376991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76	NC_007778	G	6	6	1437797	1437802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007778	G	6	6	1472618	1472623	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_007778	C	6	6	1933798	1933803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_007778	A	6	6	1963120	1963125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007778	T	6	6	1987519	1987524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007778	A	8	8	2014422	2014429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_007778	T	6	6	2094310	2094315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.