MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007778	TGT	2	6	1019880	1019885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_007778	TCG	2	6	1019891	1019896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_007778	ATG	2	6	1019932	1019937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_007778	AGC	2	6	1019951	1019956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_007778	CGC	2	6	1019967	1019972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_007778	TCG	2	6	1020111	1020116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_007778	AGTT	2	8	1020137	1020144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_007778	GCG	2	6	1021181	1021186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_007778	CCG	2	6	1021188	1021193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_007778	CGG	2	6	1023706	1023711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_007778	CG	3	6	1023714	1023719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_007778	GAG	2	6	1023792	1023797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007778	GGC	2	6	1023798	1023803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007778	CG	4	8	1025795	1025802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_007778	ACG	2	6	1025822	1025827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_007778	CG	3	6	1025843	1025848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_007778	CGG	2	6	1025897	1025902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_007778	GCG	2	6	1025915	1025920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_007778	TTTG	2	8	1025973	1025980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_007778	ATC	2	6	1026031	1026036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_007778	CGA	2	6	1026729	1026734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_007778	TCG	3	9	1026737	1026745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_007778	GCG	2	6	1026763	1026768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_007778	CG	3	6	1026813	1026818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_007778	GTC	2	6	1026866	1026871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_007778	CGC	3	9	1026966	1026974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3028	NC_007778	GC	3	6	1027081	1027086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_007778	TCA	2	6	1031332	1031337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3031	NC_007778	AC	3	6	1031414	1031419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_007778	CCG	2	6	1031451	1031456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_007778	TCG	2	6	1032217	1032222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_007778	CGC	2	6	1032248	1032253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_007778	AGCCGG	2	12	1033930	1033941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_007778	GCGG	2	8	1034041	1034048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_007778	CGG	2	6	1034108	1034113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_007778	CGG	2	6	1034117	1034122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_007778	CTG	2	6	1034519	1034524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3041	NC_007778	GATC	2	8	1034547	1034554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_007778	CTC	2	6	1036733	1036738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_007778	CGA	2	6	1036912	1036917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3049	NC_007778	GCG	2	6	1037884	1037889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_007778	TGCT	2	8	1038011	1038018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3055	NC_007778	GCG	2	6	1042390	1042395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_007778	ATG	2	6	1042396	1042401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007778	CGA	2	6	1042545	1042550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_007778	CGC	2	6	1042620	1042625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_007778	GCA	2	6	1042646	1042651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_007778	ACC	2	6	1044124	1044129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_007778	GGA	2	6	1044159	1044164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_007778	CG	4	8	1046215	1046222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_007778	CGGG	2	8	1046255	1046262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_007778	GCGTTT	2	12	1046270	1046281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3066	NC_007778	CG	4	8	1046341	1046348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_007778	CCG	2	6	1046363	1046368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3071	NC_007778	GCGA	2	8	1047872	1047879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_007778	TCG	2	6	1047920	1047925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3075	NC_007778	TTG	3	9	1049086	1049094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_007778	ATC	2	6	1049129	1049134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3082	NC_007778	GC	4	8	1049225	1049232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_007778	TCGG	2	8	1049281	1049288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_007778	GC	3	6	1049303	1049308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3087	NC_007778	AGCG	2	8	1049363	1049370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3093	NC_007778	CGG	2	6	1052750	1052755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_007778	GGC	2	6	1052757	1052762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3098	NC_007778	CCG	2	6	1053421	1053426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_007778	AGGCC	2	10	1055604	1055613	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3100	NC_007778	CCGTT	2	10	1055665	1055674	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3101	NC_007778	GTCC	2	8	1055687	1055694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3103	NC_007778	GAAC	2	8	1058114	1058121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_007778	TGA	2	6	1058123	1058128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_007778	GTT	2	6	1058132	1058137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_007778	CGG	2	6	1059726	1059731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_007778	GGA	2	6	1059756	1059761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_007778	ATCAA	2	10	1059768	1059777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3112	NC_007778	GA	3	6	1059855	1059860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_007778	GT	3	6	1059895	1059900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_007778	ACCGT	2	10	1059908	1059917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3115	NC_007778	CT	3	6	1059932	1059937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_007778	GCC	2	6	1060046	1060051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3122	NC_007778	TCC	2	6	1060271	1060276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_007778	TCG	2	6	1060294	1060299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_007778	TC	3	6	1060436	1060441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_007778	GCG	3	9	1062389	1062397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_007778	CG	3	6	1062416	1062421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_007778	TG	3	6	1062461	1062466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_007778	CTT	2	6	1062528	1062533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_007778	G	6	6	1062556	1062561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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