MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007778	TCGA	2	8	362159	362166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_007778	CGG	2	6	362211	362216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007778	CGC	2	6	362233	362238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_007778	CGGC	2	8	362262	362269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_007778	G	6	6	362315	362320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_007778	AAC	2	6	362344	362349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007778	CATC	2	8	362394	362401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_007778	CCG	2	6	362471	362476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_007778	CGG	2	6	362508	362513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_007778	GGA	2	6	362539	362544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_007778	CG	3	6	364551	364556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_007778	GGGGC	2	10	364558	364567	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_007778	GAT	2	6	364586	364591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_007778	CGCT	2	8	364637	364644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_007778	TG	4	8	364657	364664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007778	GTT	2	6	364698	364703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_007778	CGG	2	6	364724	364729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007778	TTTC	2	8	364732	364739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_007778	CGGT	2	8	364779	364786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_007778	CG	3	6	364790	364795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_007778	GCG	3	9	364817	364825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_007778	GGAC	2	8	364826	364833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_007778	GA	3	6	364857	364862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007778	GCTCGC	2	12	365400	365411	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007778	CT	4	8	365439	365446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_007778	GC	3	6	365471	365476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_007778	GCG	2	6	365483	365488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_007778	CGG	2	6	365564	365569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_007778	TGGT	2	8	365573	365580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_007778	GC	3	6	365644	365649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_007778	GC	3	6	367903	367908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_007778	TTC	2	6	367961	367966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007778	CGG	2	6	367973	367978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007778	TCG	2	6	367989	367994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1037	NC_007778	GGATTG	2	12	368013	368024	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_007778	CGG	2	6	368027	368032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_007778	CGG	2	6	368072	368077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_007778	CGG	2	6	368084	368089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_007778	CGG	2	6	368650	368655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_007778	ATGGCG	2	12	368687	368698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1052	NC_007778	GAT	2	6	372461	372466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007778	TCGC	2	8	372512	372519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_007778	GC	3	6	372559	372564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_007778	CTG	2	6	372578	372583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1058	NC_007778	CG	3	6	372675	372680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_007778	TCCC	2	8	373696	373703	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1060	NC_007778	GGCC	2	8	373719	373726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_007778	ACGC	2	8	373753	373760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_007778	ACCCCC	2	12	373772	373783	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1063	NC_007778	G	6	6	373798	373803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007778	GATCG	2	10	376215	376224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_007778	GCTCG	2	10	376275	376284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_007778	GGC	2	6	376339	376344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007778	ATC	2	6	376349	376354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_007778	ATC	2	6	376416	376421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_007778	CGCAA	2	10	376431	376440	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_007778	GC	3	6	376444	376449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_007778	TGGGG	2	10	376476	376485	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007778	GC	4	8	376492	376499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_007778	TCA	2	6	376532	376537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_007778	GCG	2	6	377371	377376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_007778	CG	3	6	378998	379003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_007778	TCA	2	6	379036	379041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1100	NC_007778	GC	3	6	381805	381810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1103	NC_007778	A	6	6	381853	381858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_007778	ACG	2	6	382443	382448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_007778	TGC	2	6	383379	383384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1109	NC_007778	CGG	2	6	383394	383399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1112	NC_007778	GCG	2	6	384504	384509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_007778	CGC	2	6	384544	384549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_007778	TCGCT	2	10	384562	384571	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1115	NC_007778	GC	3	6	384668	384673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_007778	GC	3	6	384676	384681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_007778	CACGTC	2	12	385317	385328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_007778	GC	3	6	385404	385409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_007778	GC	3	6	385414	385419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_007778	TC	3	6	386108	386113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_007778	GTC	2	6	386125	386130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_007778	CCCG	2	8	386184	386191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_007778	GCC	2	6	386206	386211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1128	NC_007778	AAG	2	6	387217	387222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_007778	TGGGG	2	10	387331	387340	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_007778	CCG	2	6	387406	387411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_007778	CG	4	8	387425	387432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_007778	CCGGC	2	10	388084	388093	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1134	NC_007778	GCGA	2	8	388158	388165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_007778	GGA	2	6	388268	388273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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