MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007778	CGC	2	6	2096190	2096195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_007778	CCG	2	6	2096261	2096266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_007778	ACG	2	6	2096282	2096287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_007778	GGACA	2	10	2096308	2096317	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_007778	ATA	2	6	2096333	2096338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_007778	ATT	2	6	2096341	2096346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_007778	AAG	2	6	2096350	2096355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_007778	GCT	2	6	2096380	2096385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_007778	GAA	2	6	2096453	2096458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_007778	GCG	2	6	2096475	2096480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_007778	GC	3	6	2096488	2096493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_007778	GC	4	8	2098431	2098438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_007778	CGG	2	6	2098555	2098560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_007778	TCGG	2	8	2098566	2098573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_007778	GCCG	2	8	2098589	2098596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_007778	CAT	2	6	2098616	2098621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_007778	CAA	2	6	2098625	2098630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007778	GCC	2	6	2100581	2100586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_007778	CG	3	6	2100672	2100677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_007778	CAG	2	6	2100731	2100736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_007778	GGT	2	6	2100826	2100831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_007778	GAG	2	6	2100883	2100888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_007778	CCG	2	6	2102171	2102176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_007778	GGCG	2	8	2102177	2102184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_007778	A	6	6	2102187	2102192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_007778	GCC	2	6	2102197	2102202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_007778	GGC	2	6	2102207	2102212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_007778	GAGGC	2	10	2102237	2102246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6029	NC_007778	GGA	2	6	2104258	2104263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_007778	GCT	2	6	2104313	2104318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_007778	TTG	2	6	2104344	2104349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_007778	TGT	2	6	2104411	2104416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_007778	GCG	3	9	2104471	2104479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_007778	TG	3	6	2104489	2104494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_007778	TC	3	6	2104519	2104524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_007778	TCGAG	2	10	2105058	2105067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6037	NC_007778	CGG	2	6	2106302	2106307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_007778	GCGA	2	8	2106360	2106367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_007778	GTA	2	6	2107193	2107198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_007778	TCGCG	2	10	2107278	2107287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6041	NC_007778	AAG	2	6	2107315	2107320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_007778	CGC	2	6	2107321	2107326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_007778	GTG	2	6	2107337	2107342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007778	CGA	2	6	2107428	2107433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_007778	GCC	2	6	2108269	2108274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_007778	GGC	2	6	2108279	2108284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007778	GGC	2	6	2108313	2108318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_007778	CG	3	6	2109197	2109202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_007778	CCG	2	6	2109210	2109215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_007778	GCG	2	6	2109219	2109224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_007778	CG	4	8	2109228	2109235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_007778	CGGGC	2	10	2109257	2109266	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6053	NC_007778	TGC	2	6	2111223	2111228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_007778	GTT	2	6	2111229	2111234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_007778	GCG	2	6	2111262	2111267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_007778	CAG	2	6	2113451	2113456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_007778	CAG	2	6	2114375	2114380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_007778	CCG	2	6	2114395	2114400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_007778	GCC	2	6	2114405	2114410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_007778	GTT	2	6	2114422	2114427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_007778	CGA	2	6	2114459	2114464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_007778	TCG	2	6	2114470	2114475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_007778	GGA	2	6	2114522	2114527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_007778	CGGC	2	8	2116201	2116208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_007778	TTTGAT	2	12	2116231	2116242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_007778	GCCA	2	8	2116807	2116814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_007778	TCGC	2	8	2116815	2116822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_007778	CCG	2	6	2117378	2117383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_007778	GCG	2	6	2117421	2117426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_007778	GCTT	2	8	2117469	2117476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_007778	CGCGC	2	10	2117553	2117562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6072	NC_007778	CG	3	6	2119088	2119093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_007778	ACC	2	6	2122845	2122850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_007778	TGA	2	6	2122857	2122862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_007778	ATC	2	6	2122922	2122927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_007778	GGCC	2	8	2123777	2123784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_007778	TCA	2	6	2125512	2125517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_007778	CGAGC	2	10	2128834	2128843	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6082	NC_007778	GGA	2	6	2128986	2128991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_007778	GCG	2	6	2129914	2129919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_007778	CGCC	2	8	2129941	2129948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6085	NC_007778	ACC	2	6	2129987	2129992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_007778	GGA	2	6	2129994	2129999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_007778	AAGC	2	8	2132073	2132080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_007778	GC	3	6	2132134	2132139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6092	NC_007778	AGG	2	6	2133826	2133831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_007778	TGC	2	6	2134829	2134834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_007778	CGG	2	6	2136641	2136646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_007778	GCG	2	6	2136939	2136944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_007778	GTC	2	6	2137444	2137449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_007778	CGG	2	6	2137564	2137569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_007778	GCT	2	6	2137589	2137594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_007778	AGCG	2	8	2137626	2137633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_007778	CG	3	6	2137735	2137740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_007778	ACGA	2	8	2137751	2137758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_007778	CGG	2	6	2138700	2138705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_007778	GGAA	2	8	2141877	2141884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_007778	CGC	2	6	2142207	2142212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_007778	CAA	2	6	2142240	2142245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_007778	GCTG	2	8	2142293	2142300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_007778	ATC	2	6	2142303	2142308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_007778	GGA	2	6	2142316	2142321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_007778	CCGCGA	2	12	2142401	2142412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_007778	GAC	2	6	2156573	2156578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_007778	CGC	2	6	2156603	2156608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_007778	CG	3	6	2156615	2156620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_007778	GCCC	2	8	2160413	2160420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6119	NC_007778	GTC	2	6	2165096	2165101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_007778	TCCG	2	8	2168009	2168016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_007778	TGCG	2	8	2168069	2168076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_007778	GT	3	6	2168084	2168089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_007778	GCG	2	6	2171713	2171718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_007778	TGA	2	6	2172513	2172518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_007778	TGC	2	6	2172522	2172527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_007778	CG	3	6	2172629	2172634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6130	NC_007778	AGG	2	6	2172707	2172712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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