MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007778	TGC	2	6	1515489	1515494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_007778	GGC	2	6	1516386	1516391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_007778	CTG	2	6	1516393	1516398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_007778	GCC	2	6	1516451	1516456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_007778	TTGGC	2	10	1516587	1516596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4506	NC_007778	GCC	2	6	1516616	1516621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_007778	CGA	2	6	1516632	1516637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_007778	CGAG	2	8	1519661	1519668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_007778	GGGC	2	8	1519758	1519765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_007778	C	6	6	1519950	1519955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4511	NC_007778	CGC	2	6	1519967	1519972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_007778	GA	3	6	1519990	1519995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_007778	GCG	3	9	1520013	1520021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_007778	CTT	2	6	1520251	1520256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_007778	CGCC	2	8	1520694	1520701	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4516	NC_007778	C	6	6	1520707	1520712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4517	NC_007778	AAGT	2	8	1520745	1520752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_007778	CCT	2	6	1521135	1521140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_007778	CGC	2	6	1521245	1521250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_007778	GTC	2	6	1521251	1521256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_007778	CCTCCG	2	12	1521282	1521293	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_007778	CTC	2	6	1521298	1521303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_007778	TC	3	6	1521336	1521341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_007778	TGACA	2	10	1521380	1521389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4525	NC_007778	GGCA	2	8	1521420	1521427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_007778	CCGCG	2	10	1521729	1521738	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4527	NC_007778	CCG	2	6	1521747	1521752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_007778	GC	3	6	1521766	1521771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_007778	GCGCC	2	10	1521797	1521806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4530	NC_007778	CCGC	2	8	1522549	1522556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4531	NC_007778	CGC	2	6	1522578	1522583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_007778	CG	3	6	1522626	1522631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_007778	GC	3	6	1522665	1522670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_007778	GTG	2	6	1522771	1522776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_007778	GTT	2	6	1522794	1522799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_007778	TTGCGC	2	12	1522893	1522904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_007778	GAT	2	6	1522923	1522928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_007778	AAT	2	6	1522941	1522946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_007778	AGG	2	6	1523048	1523053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_007778	CCG	2	6	1523068	1523073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_007778	AGCGA	2	10	1523112	1523121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4542	NC_007778	GC	3	6	1523209	1523214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_007778	ACGCT	2	10	1523228	1523237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4544	NC_007778	AGTG	2	8	1523280	1523287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_007778	GCC	2	6	1523439	1523444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_007778	GGTT	2	8	1523469	1523476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_007778	TTG	2	6	1523490	1523495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_007778	CGC	2	6	1523507	1523512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_007778	GAT	3	9	1523574	1523582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_007778	AAT	2	6	1523589	1523594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_007778	ATT	2	6	1523616	1523621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_007778	CGC	2	6	1523654	1523659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_007778	CGT	2	6	1523740	1523745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_007778	GAG	2	6	1523843	1523848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_007778	TCGCT	2	10	1523963	1523972	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4556	NC_007778	GAC	2	6	1524020	1524025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_007778	ATG	2	6	1524038	1524043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_007778	GC	3	6	1524062	1524067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_007778	TCT	2	6	1524153	1524158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_007778	GAG	2	6	1524289	1524294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_007778	ATT	2	6	1524371	1524376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_007778	AATA	2	8	1524389	1524396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_007778	GGC	2	6	1524421	1524426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_007778	CGC	3	9	1524516	1524524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_007778	GTC	2	6	1524622	1524627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_007778	GCGGG	2	10	1524628	1524637	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4567	NC_007778	CCG	2	6	1524772	1524777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_007778	TGC	2	6	1524900	1524905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_007778	ACT	2	6	1524909	1524914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_007778	CCTC	2	8	1524940	1524947	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4571	NC_007778	GC	3	6	1524982	1524987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_007778	GAG	2	6	1525063	1525068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_007778	CGCGGC	2	12	1525458	1525469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_007778	CGT	2	6	1525479	1525484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_007778	TCC	2	6	1525487	1525492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_007778	GGA	2	6	1525501	1525506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_007778	CG	3	6	1525538	1525543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_007778	GGT	2	6	1525583	1525588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_007778	CGG	2	6	1525604	1525609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4582	NC_007778	CG	4	8	1525632	1525639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_007778	GCGCC	2	10	1525641	1525650	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4584	NC_007778	GCC	2	6	1526434	1526439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4588	NC_007778	GGCC	2	8	1527599	1527606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_007778	GCCC	2	8	1527613	1527620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4590	NC_007778	GC	3	6	1527633	1527638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4593	NC_007778	C	6	6	1527679	1527684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4597	NC_007778	GC	4	8	1529256	1529263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_007778	TC	3	6	1529791	1529796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_007778	GCG	3	9	1529850	1529858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4601	NC_007778	CGC	2	6	1529940	1529945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_007778	GCG	2	6	1529949	1529954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_007778	CGCA	2	8	1529971	1529978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_007778	GC	3	6	1530001	1530006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_007778	GC	3	6	1530011	1530016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_007778	ATTG	2	8	1531777	1531784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_007778	GCC	2	6	1531892	1531897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_007778	CGA	2	6	1531942	1531947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4610	NC_007778	CAG	2	6	1533539	1533544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_007778	TCG	2	6	1533569	1533574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4613	NC_007778	ACTG	2	8	1535552	1535559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_007778	CCAT	2	8	1535560	1535567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_007778	AAG	2	6	1535578	1535583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4618	NC_007778	CGC	4	12	1535636	1535647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_007778	CCG	2	6	1535661	1535666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4622	NC_007778	TCG	2	6	1535865	1535870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4629	NC_007778	GGC	2	6	1551762	1551767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_007778	CGTT	2	8	1551776	1551783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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