MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	GC	3	6	3474	3479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007765	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007765	GA	3	6	6899	6904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007765	GC	4	8	6995	7002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007765	GA	4	8	9629	9636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007765	GC	3	6	18747	18752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007765	CG	3	6	20216	20221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007765	CG	3	6	21572	21577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007765	CG	3	6	26648	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007765	TC	3	6	26783	26788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007765	CG	3	6	28636	28641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007765	TG	3	6	28680	28685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007765	GC	3	6	28835	28840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007765	GA	3	6	28884	28889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007765	AT	3	6	40249	40254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007765	GC	3	6	61721	61726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007765	CG	3	6	64836	64841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007765	CG	3	6	64941	64946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007765	CG	3	6	79499	79504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007765	TA	3	6	87166	87171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007765	GC	3	6	87201	87206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007765	GA	4	8	87243	87250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007765	CG	4	8	99213	99220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007765	GC	3	6	99430	99435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007765	CT	3	6	100381	100386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007765	CG	3	6	105209	105214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007765	CG	3	6	105251	105256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007765	GC	4	8	105259	105266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007765	CA	3	6	126162	126167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007765	GC	3	6	126324	126329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007765	AT	3	6	135351	135356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007765	GA	3	6	151598	151603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007765	CG	3	6	152551	152556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007765	GC	4	8	163204	163211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007765	AG	3	6	163254	163259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007765	AT	3	6	163405	163410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007765	CG	3	6	163766	163771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007765	CG	3	6	163909	163914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007765	CG	3	6	168857	168862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007765	TG	3	6	171928	171933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007765	GC	3	6	172184	172189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007765	GC	3	6	172255	172260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007765	CG	3	6	172761	172766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007765	GT	3	6	173258	173263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007765	AG	3	6	173957	173962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007765	CA	3	6	174108	174113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007765	CG	3	6	174259	174264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007765	CG	3	6	174898	174903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007765	TC	3	6	185060	185065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007765	GA	3	6	185073	185078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007765	GC	3	6	187912	187917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007765	CG	3	6	192551	192556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007765	CG	3	6	194888	194893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007765	GC	3	6	194908	194913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007765	GC	3	6	196579	196584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007765	TA	3	6	199348	199353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007765	GC	3	6	204963	204968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007765	TG	3	6	214447	214452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007765	AC	3	6	215513	215518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007765	TC	3	6	217842	217847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007765	CG	3	6	217942	217947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007765	GA	3	6	218266	218271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007765	TC	3	6	218727	218732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007765	AG	3	6	218747	218752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007765	TG	3	6	219038	219043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007765	AT	3	6	219156	219161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007765	CG	3	6	221862	221867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007765	CT	3	6	225774	225779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007765	GT	3	6	230875	230880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007765	CT	3	6	234784	234789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007765	GC	3	6	238435	238440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007765	GA	3	6	238453	238458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007765	CG	3	6	239705	239710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007765	GC	3	6	239838	239843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007765	GA	3	6	241763	241768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007765	TC	3	6	251583	251588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007765	GC	3	6	263914	263919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007765	AG	3	6	264314	264319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007765	GA	4	8	267103	267110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007765	GA	3	6	274730	274735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007765	CA	3	6	276180	276185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007765	CG	3	6	284867	284872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007765	GT	3	6	285330	285335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007765	AG	3	6	287830	287835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007765	TA	3	6	293569	293574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007765	TC	3	6	301984	301989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007765	TA	3	6	302045	302050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007765	TC	3	6	302671	302676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007765	GA	3	6	309619	309624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007765	GC	3	6	331265	331270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007765	CG	3	6	340666	340671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007765	CG	3	6	341534	341539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007765	CG	3	6	341697	341702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007765	AG	3	6	341905	341910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007765	TC	3	6	356424	356429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007765	TG	3	6	356925	356930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007765	TC	3	6	357054	357059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007765	GA	3	6	369079	369084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007765	GC	3	6	369087	369092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007765	AT	3	6	370656	370661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007765	TC	3	6	383802	383807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007765	GA	4	8	385441	385448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007765	GT	3	6	389821	389826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007765	GC	3	6	397322	397327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007765	GA	3	6	398596	398601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007765	GC	3	6	400341	400346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007765	GA	3	6	404766	404771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007765	GC	3	6	407121	407126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007765	GC	3	6	407223	407228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007765	CT	3	6	412891	412896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007765	CT	3	6	416940	416945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007765	TC	3	6	418985	418990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007765	CG	3	6	431828	431833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007765	TC	3	6	436075	436080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007765	AG	3	6	439450	439455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007765	GC	3	6	444671	444676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007765	TG	3	6	449390	449395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007765	TC	4	8	452939	452946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007765	CT	3	6	454588	454593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007765	TG	3	6	456054	456059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007765	TA	3	6	459955	459960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007765	GC	3	6	465346	465351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007765	TC	3	6	473269	473274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007765	GC	3	6	473306	473311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007765	TC	3	6	476927	476932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007765	TG	3	6	479014	479019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007765	CG	3	6	488627	488632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.