MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	CGGC	2	8	156	163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007763	TGAT	2	8	939	946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007763	GGCC	2	8	4537	4544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007763	GGAA	2	8	6209	6216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007763	CGAC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007763	GAAA	2	8	11076	11083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007763	GCCG	2	8	14303	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007763	GCGA	2	8	15275	15282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007763	GCAT	2	8	17600	17607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007763	GCAC	2	8	17628	17635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007763	CTTT	2	8	18626	18633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007763	AACA	2	8	19451	19458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007763	CCGG	2	8	27098	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007763	ATCT	2	8	27166	27173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007763	GCGA	2	8	27210	27217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007763	GATC	2	8	28764	28771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007763	CGGC	2	8	32282	32289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007763	GGTC	2	8	42326	42333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007763	GACG	2	8	48024	48031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007763	ATGA	2	8	48049	48056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007763	GCGA	2	8	48067	48074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007763	TTGC	2	8	48160	48167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007763	GAAG	2	8	49379	49386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007763	GCCT	2	8	53112	53119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007763	CGGA	2	8	55552	55559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007763	CCAG	2	8	66985	66992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007763	CCCA	2	8	71883	71890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_007763	GCCG	2	8	72070	72077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007763	CTTC	2	8	73305	73312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007763	CGTG	2	8	73662	73669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007763	AAAC	2	8	73775	73782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007763	TGCC	2	8	73814	73821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007763	GTCG	2	8	74003	74010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007763	GCCA	2	8	75258	75265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007763	ATGG	2	8	75342	75349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007763	CGGC	2	8	75713	75720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007763	GCCG	2	8	76523	76530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007763	GGGA	2	8	76633	76640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007763	CGTC	2	8	77150	77157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007763	GGTT	2	8	77643	77650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007763	CAGA	2	8	109682	109689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007763	GGCG	2	8	109984	109991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007763	TCGT	2	8	114183	114190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007763	GTCG	2	8	114194	114201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007763	CATG	2	8	122853	122860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007763	GCAT	3	12	122876	122887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007763	CTTC	2	8	127427	127434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007763	AGTC	2	8	128793	128800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007763	AGCC	2	8	132018	132025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007763	TTTC	2	8	133642	133649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007763	GATC	2	8	141606	141613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007763	GATC	2	8	154510	154517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007763	CATC	2	8	158684	158691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007763	AGCC	2	8	158760	158767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007763	AGTT	2	8	158787	158794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007763	CGTC	2	8	159921	159928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007763	GGCG	2	8	165799	165806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007763	CTGC	2	8	175200	175207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007763	AGCG	2	8	175853	175860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007763	CTGA	2	8	177897	177904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007763	AGAA	2	8	178075	178082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007763	TCCA	2	8	180285	180292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007763	CCGG	2	8	180383	180390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007763	CGGC	2	8	180446	180453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.