MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	CATCT	2	10	11702	11711	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007761	GTTTT	2	10	50356	50365	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007761	GACGT	2	10	62560	62569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007761	TCGTG	2	10	63599	63608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007761	GGGCT	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007761	CGCAA	2	10	64184	64193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007761	GAAGA	2	10	64724	64733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007761	AGCGG	2	10	66789	66798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007761	AGAGG	2	10	67064	67073	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007761	GAGAT	2	10	69224	69233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007761	AGCGC	2	10	70581	70590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007761	GGCCC	2	10	88048	88057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007761	CTGCC	2	10	97915	97924	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_007761	GGCAG	2	10	98061	98070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007761	GCATG	2	10	111212	111221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007761	AGCGC	2	10	112049	112058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007761	GCCGC	2	10	114351	114360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_007761	TAGAA	2	10	119632	119641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007761	GCGCA	2	10	121876	121885	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007761	ATCGC	2	10	123490	123499	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007761	CCGCG	2	10	140567	140576	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007761	ACGTA	2	10	150738	150747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007761	CCGAG	2	10	159146	159155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007761	CGCGA	2	10	163884	163893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007761	TGGAC	2	10	191370	191379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007761	GGCCG	2	10	198800	198809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007761	CCCAT	2	10	200345	200354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007761	TGCCG	2	10	241884	241893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007761	TCGTT	2	10	247165	247174	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007761	TAAAC	2	10	248525	248534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007761	TGATT	2	10	250420	250429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007761	GAATG	2	10	257734	257743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007761	GGAGG	2	10	257930	257939	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007761	GCCTT	2	10	295948	295957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007761	TTCCT	2	10	302702	302711	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007761	CGAGC	2	10	303838	303847	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007761	GGCCA	2	10	318248	318257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007761	GCAAA	2	10	319820	319829	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007761	CGGCG	2	10	319846	319855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007761	ACGAC	2	10	339491	339500	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007761	ATACA	2	10	346584	346593	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007761	GAGGC	2	10	354536	354545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007761	CCGTG	2	10	370369	370378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007761	GAGAA	2	10	380410	380419	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007761	CGTGT	2	10	405555	405564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007761	ATGGC	2	10	436468	436477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007761	CCCGC	2	10	441584	441593	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_007761	AGCGA	2	10	457508	457517	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007761	TGCGG	2	10	459740	459749	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007761	CTTTT	2	10	462682	462691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007761	TCCTT	2	10	472810	472819	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007761	CGAAG	2	10	478334	478343	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007761	GCATG	2	10	519111	519120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007761	GCTTC	2	10	519124	519133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007761	TGATT	2	10	521199	521208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007761	GAGGG	2	10	521568	521577	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007761	TAGGG	2	10	522672	522681	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007761	AAATC	2	10	525049	525058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007761	CCCCT	2	10	539097	539106	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
60	NC_007761	GACTA	2	10	542965	542974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007761	GCAGT	2	10	543139	543148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007761	CGCGG	2	10	555199	555208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_007761	CTGCC	2	10	567769	567778	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_007761	GGCAG	2	10	567920	567929	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007761	AGGGG	2	10	571379	571388	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007761	AGATG	2	10	576422	576431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007761	GCCCC	2	10	579835	579844	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_007761	CTGCC	2	10	582171	582180	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_007761	AACGC	2	10	583314	583323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007761	ATGAC	2	10	592962	592971	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007761	CGTCA	2	10	597312	597321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007761	CGGAT	2	10	597345	597354	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007761	CATGG	2	10	599955	599964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007761	TCGGA	2	10	613499	613508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007761	CTTCC	2	10	618770	618779	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_007761	TGACG	2	10	638493	638502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007761	GGGAA	2	10	657775	657784	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007761	TTGAA	2	10	669028	669037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007761	CAAAA	2	10	672258	672267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007761	CGTTC	2	10	676154	676163	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007761	GGCCA	2	10	686920	686929	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007761	ACCTT	2	10	691028	691037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007761	TTGCC	2	10	712147	712156	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007761	TGACT	2	10	714356	714365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007761	TAATC	2	10	725723	725732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007761	GTGCA	2	10	725750	725759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007761	AATAG	2	10	730387	730396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007761	GCTTG	2	10	735218	735227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007761	AATGC	2	10	745783	745792	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007761	TTTGG	2	10	767936	767945	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007761	GCGCT	2	10	771769	771778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007761	ACGAT	2	10	771818	771827	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007761	TGCAT	2	10	815981	815990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007761	CAGGT	2	10	819127	819136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007761	GCGCG	2	10	825442	825451	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007761	TTCAC	2	10	825716	825725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007761	CGATG	2	10	831398	831407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007761	TCATT	2	10	835714	835723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007761	CGCGT	2	10	845182	845191	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007761	ATTCA	2	10	851201	851210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007761	GAAAA	2	10	851957	851966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007761	CTGCC	2	10	861860	861869	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_007761	GGCAG	2	10	862020	862029	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007761	ATCGC	2	10	870986	870995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_007761	CGGCC	2	10	871085	871094	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_007761	GGAAT	2	10	883103	883112	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007761	AACCG	2	10	898472	898481	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_007761	GGGGA	2	10	904513	904522	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007761	TGGCG	2	10	909045	909054	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007761	ACCGC	2	10	911947	911956	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_007761	CGAAG	2	10	919753	919762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007761	GCACG	2	10	920903	920912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007761	CCAAT	2	10	933989	933998	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_007761	TTGCC	2	10	934029	934038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007761	CCGTG	2	10	938471	938480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007761	GCCGC	2	10	966038	966047	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_007761	CAATT	2	10	977027	977036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007761	GTGAC	2	10	980344	980353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007761	GCCAT	2	10	1006717	1006726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007761	GCCGC	3	15	1008175	1008189	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_007761	TAACA	2	10	1016311	1016320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007761	GGCCG	2	10	1029677	1029686	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007761	GCCCG	2	10	1043870	1043879	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_007761	TCCGG	2	10	1057360	1057369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007761	GGCCG	2	10	1057463	1057472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007761	GGACG	2	10	1067262	1067271	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007761	GCCCG	2	10	1067638	1067647	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_007761	GTGCT	2	10	1068842	1068851	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007761	CTGCC	2	10	1074372	1074381	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007761	GGCAG	2	10	1074704	1074713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007761	GCCGT	2	10	1079556	1079565	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007761	CAAAA	2	10	1079910	1079919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007761	CACTC	2	10	1080696	1080705	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_007761	GCGAA	2	10	1086135	1086144	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007761	GCCGC	2	10	1087983	1087992	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007761	CGGCG	2	10	1088985	1088994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007761	GGAAG	2	10	1092510	1092519	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007761	GTTGT	2	10	1097332	1097341	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007761	CCGCG	2	10	1097375	1097384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_007761	ATCGC	2	10	1105301	1105310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_007761	AATGA	2	10	1107140	1107149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007761	GCGCC	2	10	1108985	1108994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_007761	GAGAT	2	10	1112190	1112199	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007761	GGACG	2	10	1130335	1130344	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007761	ACCAA	2	10	1151244	1151253	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007761	TGTAG	2	10	1159143	1159152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_007761	TCAAG	2	10	3355221	3355230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_007761	GGAAA	2	10	3448251	3448260	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_007761	TGCAT	2	10	3528416	3528425	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_007761	CATGA	2	10	3543116	3543125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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