MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 1724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	ATCC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007761	GCCA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007761	CAGG	2	8	11937	11944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007761	GCCG	2	8	12019	12026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007761	CGAT	2	8	12362	12369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007761	CGTT	2	8	12887	12894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007761	CTGC	2	8	15968	15975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007761	GTGA	2	8	20587	20594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007761	ATTA	2	8	39811	39818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007761	GTTC	2	8	44029	44036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007761	CTTT	2	8	46153	46160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007761	GAAG	2	8	46251	46258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007761	ACGG	2	8	50429	50436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007761	TGAA	2	8	52885	52892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007761	GGTT	2	8	62230	62237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007761	CACT	2	8	62247	62254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007761	GAAC	2	8	62616	62623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007761	GTGA	2	8	62959	62966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007761	GATC	2	8	63118	63125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007761	TTGG	2	8	63664	63671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007761	TCTT	2	8	64249	64256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007761	ATGG	2	8	64802	64809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007761	GCCG	2	8	64814	64821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007761	GTAG	2	8	64842	64849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007761	GACT	2	8	65075	65082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007761	GCGA	2	8	65589	65596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007761	CAAG	2	8	65923	65930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007761	CGTC	2	8	66288	66295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007761	AAAG	2	8	66411	66418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007761	CAAA	2	8	68264	68271	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007761	GGGC	2	8	68676	68683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007761	GCCG	2	8	69016	69023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007761	CGCC	2	8	69379	69386	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_007761	CCAA	2	8	69964	69971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007761	CTTC	2	8	70384	70391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007761	CGAC	2	8	70561	70568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007761	TCCT	2	8	70853	70860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007761	GCAA	2	8	89023	89030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007761	CGAA	2	8	105279	105286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007761	CCAC	2	8	111466	111473	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007761	ACCT	2	8	111549	111556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007761	GTGC	2	8	111660	111667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007761	TTGA	2	8	112077	112084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007761	GTCC	2	8	113020	113027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007761	CGAC	2	8	115143	115150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007761	ATGA	2	8	115804	115811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007761	CTTG	2	8	115818	115825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007761	CATC	2	8	115862	115869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007761	TTTG	2	8	118555	118562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007761	CAAT	2	8	121896	121903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007761	GGTT	2	8	122043	122050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007761	ACAT	2	8	135827	135834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007761	AAGC	2	8	138387	138394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007761	ATGG	2	8	140872	140879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007761	TTCC	2	8	145243	145250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007761	TTTG	2	8	146922	146929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007761	GCAG	2	8	147013	147020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007761	AAGC	2	8	155020	155027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007761	AGCG	2	8	157939	157946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007761	GCCG	2	8	159205	159212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007761	AGGC	2	8	160669	160676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007761	CTGA	2	8	160803	160810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007761	GGAA	2	8	167144	167151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007761	CCTT	2	8	167160	167167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007761	TGAG	2	8	167201	167208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007761	GCCG	2	8	175142	175149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007761	GGCA	2	8	191380	191387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007761	GCCG	2	8	199807	199814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007761	AGGG	2	8	200144	200151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007761	CCAG	2	8	200998	201005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007761	TTTC	2	8	210421	210428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007761	CTGC	2	8	214043	214050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007761	CGTT	2	8	214063	214070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007761	CCGA	2	8	214199	214206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007761	CCGG	2	8	214316	214323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007761	TGAA	2	8	214873	214880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007761	CCGG	2	8	214940	214947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007761	CATT	2	8	215119	215126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007761	ACCC	2	8	232886	232893	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_007761	GCTC	2	8	233057	233064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007761	CGGG	2	8	236164	236171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007761	GTCT	2	8	236505	236512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007761	GGCA	2	8	239581	239588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007761	TGAA	2	8	240730	240737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007761	TCAT	2	8	246529	246536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007761	CGGT	2	8	250404	250411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007761	TCGT	2	8	250483	250490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007761	TCAT	3	12	250641	250652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007761	CCAG	2	8	250793	250800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007761	GCGG	2	8	258747	258754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007761	GAGG	2	8	263484	263491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007761	TCGC	2	8	267051	267058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007761	TCTT	2	8	273418	273425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007761	CCGG	2	8	277490	277497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007761	GATC	2	8	278587	278594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007761	ATGC	2	8	278600	278607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007761	CGAT	2	8	280150	280157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007761	CCGC	2	8	295914	295921	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_007761	GCGG	2	8	298395	298402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007761	GCGG	2	8	299885	299892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007761	GGCC	2	8	301418	301425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007761	GGCC	2	8	301436	301443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007761	CAAA	2	8	302073	302080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007761	GAAT	2	8	315221	315228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007761	AGGA	2	8	319301	319308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007761	GCGG	2	8	328672	328679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007761	GTGC	2	8	330255	330262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007761	CAAT	2	8	332882	332889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007761	TGCC	2	8	332924	332931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007761	TGCC	2	8	332938	332945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007761	GGAA	2	8	338231	338238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007761	TCGA	2	8	339563	339570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007761	GCGG	2	8	340919	340926	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007761	ACCC	2	8	346408	346415	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_007761	TCGA	2	8	346440	346447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007761	TCGA	2	8	346460	346467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007761	CGAA	2	8	346809	346816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007761	CGTC	2	8	350996	351003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007761	CCTT	2	8	351189	351196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007761	CCGG	2	8	353693	353700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007761	GCCG	2	8	353726	353733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007761	TTCG	2	8	354590	354597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007761	CCGG	2	8	359046	359053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007761	GCCG	2	8	363179	363186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007761	GCCC	2	8	369255	369262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_007761	TTTC	2	8	369881	369888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007761	GGGC	2	8	369971	369978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007761	GAAA	2	8	378341	378348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007761	CAAG	2	8	379416	379423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007761	AGGC	2	8	379425	379432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007761	CTGC	2	8	380450	380457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007761	ATCC	2	8	383191	383198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007761	GCCT	2	8	400117	400124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007761	GGCC	2	8	411542	411549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007761	CGTC	2	8	417487	417494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007761	CTTG	2	8	420251	420258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007761	CTGC	2	8	426170	426177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007761	GCGA	2	8	426292	426299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007761	CGGG	2	8	428032	428039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007761	AATT	2	8	442657	442664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007761	CCGG	2	8	444224	444231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007761	CTGC	2	8	444365	444372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007761	GCGA	2	8	448322	448329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007761	GGAA	2	8	448706	448713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007761	GTTC	2	8	448714	448721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007761	AGCA	2	8	448755	448762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007761	CGGG	2	8	452090	452097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007761	TGAA	2	8	452295	452302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007761	GGCT	2	8	457344	457351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_007761	GCCT	2	8	458938	458945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_007761	TTGC	2	8	1298618	1298625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_007761	GACA	2	8	1304391	1304398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_007761	TTGA	2	8	1314558	1314565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_007761	CGTT	2	8	1315694	1315701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_007761	GAAC	2	8	1315710	1315717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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