MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 12148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007761	GCC	2	6	198960	198965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_007761	TGA	2	6	198993	198998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007761	TTC	2	6	199018	199023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007761	T	6	6	199041	199046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007761	AGC	2	6	199088	199093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007761	A	6	6	199099	199104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007761	TGG	2	6	199768	199773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007761	GC	3	6	199777	199782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_007761	GCCG	2	8	199807	199814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_007761	A	6	6	200077	200082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007761	AGGG	2	8	200144	200151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007761	AC	3	6	200179	200184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_007761	TCG	2	6	200253	200258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007761	AT	3	6	200269	200274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007761	T	6	6	200312	200317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007761	CTT	2	6	200320	200325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007761	CCCAT	2	10	200345	200354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
518	NC_007761	AAT	2	6	200379	200384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007761	GGT	2	6	200770	200775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007761	CGG	2	6	200853	200858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007761	A	6	6	200866	200871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007761	GAA	2	6	200911	200916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007761	TGC	2	6	200932	200937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_007761	CCAG	2	8	200998	201005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_007761	G	6	6	201012	201017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007761	GGT	2	6	201023	201028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007761	GGA	2	6	201057	201062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007761	CAA	2	6	201077	201082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_007761	CGA	2	6	202106	202111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007761	TTTC	2	8	210421	210428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_007761	CTGC	2	8	214043	214050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_007761	CGTT	2	8	214063	214070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_007761	ACG	2	6	214092	214097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_007761	CCGA	2	8	214199	214206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_007761	T	6	6	214289	214294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007761	ACG	2	6	214306	214311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007761	CG	3	6	214310	214315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_007761	CCGG	2	8	214316	214323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_007761	ATC	2	6	214327	214332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_007761	GCA	2	6	214726	214731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_007761	A	7	7	214863	214869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007761	TGAA	2	8	214873	214880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007761	GAT	2	6	214917	214922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007761	CCGG	2	8	214940	214947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_007761	GT	3	6	214949	214954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007761	GTT	2	6	214997	215002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007761	CGG	2	6	215068	215073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_007761	CATT	2	8	215119	215126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_007761	GGC	2	6	215419	215424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007761	GCA	2	6	218491	218496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_007761	GA	3	6	223047	223052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007761	GCC	2	6	224127	224132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_007761	AG	3	6	224161	224166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007761	GAC	2	6	225807	225812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_007761	CGC	2	6	227241	227246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_007761	GGC	2	6	227296	227301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007761	CCA	2	6	227310	227315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_007761	CAG	2	6	227398	227403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007761	ATG	2	6	227415	227420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007761	CGC	2	6	227828	227833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_007761	CGA	2	6	232873	232878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007761	ACCC	2	8	232886	232893	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
563	NC_007761	CA	3	6	232953	232958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_007761	AG	3	6	232963	232968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007761	GTG	2	6	233037	233042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007761	GCTC	2	8	233057	233064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_007761	TCG	2	6	234678	234683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_007761	A	6	6	235799	235804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007761	GA	3	6	235848	235853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007761	CG	3	6	236086	236091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_007761	AGG	2	6	236136	236141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007761	CGGG	2	8	236164	236171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
573	NC_007761	CTA	2	6	236320	236325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_007761	TAG	2	6	236329	236334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007761	CGA	2	6	236385	236390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_007761	A	6	6	236395	236400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007761	GCA	2	6	236489	236494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007761	GTCT	2	8	236505	236512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_007761	TCG	2	6	236530	236535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007761	GCA	2	6	239531	239536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007761	C	6	6	239548	239553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
582	NC_007761	TGC	2	6	239574	239579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_007761	GGCA	2	8	239581	239588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_007761	TC	3	6	240523	240528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_007761	TC	3	6	240646	240651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_007761	GCC	2	6	240701	240706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_007761	TGAA	2	8	240730	240737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007761	TGA	2	6	240759	240764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007761	CTC	2	6	241858	241863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_007761	CG	3	6	241869	241874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_007761	GCC	2	6	241875	241880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_007761	TGCCG	2	10	241884	241893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
593	NC_007761	C	7	7	243111	243117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
594	NC_007761	GCG	2	6	246382	246387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_007761	TCAT	2	8	246529	246536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_007761	GC	3	6	246538	246543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_007761	GGC	2	6	246913	246918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_007761	ACA	2	6	246985	246990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007761	GT	3	6	246998	247003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007761	AGA	2	6	247060	247065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007761	ATT	2	6	247106	247111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007761	ACG	2	6	247122	247127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_007761	GT	3	6	247130	247135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007761	TCGTT	2	10	247165	247174	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
605	NC_007761	ATG	2	6	248308	248313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_007761	CGC	2	6	248335	248340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_007761	TTG	2	6	248350	248355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007761	TGG	2	6	248513	248518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007761	TAAAC	2	10	248525	248534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
610	NC_007761	GAA	2	6	248659	248664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007761	TG	3	6	250397	250402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007761	CGGT	2	8	250404	250411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
613	NC_007761	TGATT	2	10	250420	250429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007761	GCC	2	6	250449	250454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_007761	TCGT	2	8	250483	250490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_007761	CGG	2	6	250551	250556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_007761	TGC	2	6	250564	250569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_007761	ATG	2	6	250574	250579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_007761	TCAT	3	12	250641	250652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_007761	CCAG	2	8	250793	250800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NC_007761	GAG	2	6	250812	250817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007761	TAC	2	6	250875	250880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007761	T	6	6	250902	250907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007761	ACC	2	6	251065	251070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_007761	GTA	2	6	251100	251105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007761	TGG	2	6	251154	251159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007761	TCG	2	6	251202	251207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_007761	AG	3	6	251820	251825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007761	TC	4	8	251826	251833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_007761	GA	3	6	251844	251849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007761	TC	3	6	251879	251884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_007761	TCA	2	6	251975	251980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_007761	AGA	2	6	251995	252000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007761	TC	3	6	255538	255543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_007761	CAA	2	6	255644	255649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_007761	ACT	2	6	255753	255758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_007761	CGC	2	6	255796	255801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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639	NC_007761	CAG	2	6	255840	255845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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