MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 12148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007761	CATC	2	8	2167072	2167079	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_007761	GC	3	6	2167762	2167767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_007761	ATTTC	2	10	2167792	2167801	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6004	NC_007761	CGG	2	6	2167827	2167832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_007761	GA	3	6	2169209	2169214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_007761	TC	3	6	2171144	2171149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_007761	GA	3	6	2171161	2171166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_007761	TCC	2	6	2171187	2171192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_007761	GCC	2	6	2171222	2171227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_007761	GTG	2	6	2171278	2171283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_007761	CGC	2	6	2171325	2171330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_007761	TGT	2	6	2171364	2171369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_007761	AT	3	6	2171398	2171403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_007761	TCG	2	6	2172924	2172929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_007761	CATTC	2	10	2172982	2172991	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6016	NC_007761	TGGC	2	8	2173040	2173047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_007761	GCG	2	6	2173100	2173105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007761	CGC	2	6	2173106	2173111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_007761	ACA	2	6	2173145	2173150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_007761	ACG	2	6	2173158	2173163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_007761	TGG	2	6	2173196	2173201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_007761	AGA	2	6	2174991	2174996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_007761	AAC	3	9	2178572	2178580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_007761	T	6	6	2179747	2179752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_007761	A	7	7	2179766	2179772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_007761	T	6	6	2179800	2179805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_007761	GGA	2	6	2179834	2179839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_007761	TGCCGG	2	12	2180852	2180863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_007761	CAG	2	6	2180916	2180921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_007761	G	6	6	2184426	2184431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_007761	GCA	2	6	2184444	2184449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007761	GCC	2	6	2185267	2185272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_007761	CG	3	6	2185277	2185282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_007761	CGG	2	6	2186678	2186683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_007761	CCG	2	6	2186697	2186702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_007761	TCA	2	6	2188719	2188724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_007761	CATT	2	8	2195979	2195986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_007761	ATG	3	9	2195997	2196005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_007761	CGT	2	6	2196043	2196048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_007761	GAGC	2	8	2196061	2196068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_007761	GCT	2	6	2196070	2196075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_007761	TG	3	6	2197190	2197195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_007761	A	8	8	2199059	2199066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007761	CAA	2	6	2199109	2199114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_007761	TCG	2	6	2199135	2199140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_007761	GGC	2	6	2199279	2199284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007761	GCT	2	6	2199290	2199295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_007761	GCC	2	6	2199984	2199989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_007761	T	6	6	2200023	2200028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_007761	GGCA	2	8	2200128	2200135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_007761	AAAAG	2	10	2200174	2200183	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_007761	TCA	2	6	2200576	2200581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_007761	TCC	2	6	2200648	2200653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_007761	TCC	2	6	2202139	2202144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_007761	TC	3	6	2202556	2202561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_007761	TGT	2	6	2202571	2202576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_007761	ATG	2	6	2202602	2202607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_007761	A	6	6	2202642	2202647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_007761	GAA	2	6	2202732	2202737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_007761	TC	3	6	2202842	2202847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_007761	GTT	2	6	2202854	2202859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_007761	T	6	6	2202858	2202863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_007761	T	6	6	2202869	2202874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_007761	TGA	2	6	2202888	2202893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_007761	TC	3	6	2202901	2202906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_007761	GATG	2	8	2208727	2208734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_007761	GGAT	2	8	2208747	2208754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_007761	GCC	2	6	2208772	2208777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_007761	CGG	2	6	2208787	2208792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_007761	CGAT	2	8	2208815	2208822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_007761	CGC	2	6	2208828	2208833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_007761	GGCA	2	8	2208844	2208851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_007761	GCC	2	6	2209382	2209387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_007761	GAA	2	6	2209398	2209403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_007761	ATG	2	6	2209415	2209420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_007761	GGC	2	6	2209426	2209431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_007761	CTT	2	6	2209440	2209445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_007761	TC	3	6	2210111	2210116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_007761	CGG	2	6	2210186	2210191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_007761	CGG	2	6	2210196	2210201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6082	NC_007761	GGC	2	6	2213184	2213189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_007761	GCC	2	6	2213195	2213200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_007761	A	6	6	2213262	2213267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6086	NC_007761	GGC	2	6	2213303	2213308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_007761	AG	3	6	2213325	2213330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_007761	CTC	2	6	2213503	2213508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_007761	TGACCA	2	12	2213614	2213625	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_007761	ATC	2	6	2213640	2213645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_007761	TCCT	2	8	2213669	2213676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_007761	CCG	2	6	2213734	2213739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_007761	CGC	2	6	2214696	2214701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_007761	ACAA	2	8	2215295	2215302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_007761	GAG	2	6	2215303	2215308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_007761	CTG	2	6	2215834	2215839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_007761	GCGGG	2	10	2215862	2215871	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_007761	TCC	2	6	2219191	2219196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_007761	T	6	6	2219206	2219211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_007761	TAGT	2	8	2219232	2219239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_007761	GCG	2	6	2219240	2219245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_007761	GT	3	6	2221628	2221633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_007761	CGC	2	6	2222297	2222302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_007761	TGA	2	6	2226476	2226481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_007761	GCCGC	2	10	2226520	2226529	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6106	NC_007761	TCC	2	6	2227571	2227576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_007761	TTGC	2	8	2227579	2227586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_007761	CAGC	2	8	2228743	2228750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_007761	GAA	2	6	2228778	2228783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_007761	CATT	2	8	2228822	2228829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_007761	TCA	3	9	2228846	2228854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_007761	GGC	3	9	2228872	2228880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_007761	ATG	2	6	2228887	2228892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_007761	GGA	2	6	2228899	2228904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_007761	TCG	2	6	2228940	2228945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_007761	CCG	2	6	2229021	2229026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_007761	AGG	2	6	2229027	2229032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_007761	GTC	2	6	2229669	2229674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_007761	GC	3	6	2229759	2229764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_007761	TGA	2	6	2229768	2229773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_007761	GC	3	6	2229857	2229862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_007761	TGA	2	6	2229869	2229874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_007761	GCGA	2	8	2229898	2229905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_007761	TGC	2	6	2229920	2229925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_007761	CTG	2	6	2229937	2229942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_007761	CAGG	2	8	2229958	2229965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_007761	CG	3	6	2229977	2229982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_007761	ACG	2	6	2232153	2232158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_007761	GAC	2	6	2232188	2232193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_007761	CT	3	6	2232225	2232230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_007761	ATC	2	6	2232619	2232624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_007761	TCC	2	6	2232630	2232635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_007761	GCA	2	6	2232641	2232646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6136	NC_007761	GCC	2	6	2233242	2233247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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