MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 12148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007761	CGG	2	6	1995688	1995693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_007761	TCA	2	6	1995758	1995763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_007761	CATA	2	8	1995770	1995777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_007761	GCCGC	2	10	1995805	1995814	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5505	NC_007761	GAG	2	6	1996865	1996870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_007761	CGGC	2	8	1997609	1997616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_007761	CAT	3	9	1998298	1998306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_007761	AGC	2	6	1998330	1998335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_007761	GGAA	2	8	1999848	1999855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_007761	GCAAG	2	10	2000997	2001006	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5511	NC_007761	TATT	2	8	2001015	2001022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_007761	CTTG	2	8	2001095	2001102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_007761	AC	3	6	2001125	2001130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_007761	CGGGGA	2	12	2001152	2001163	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5515	NC_007761	A	6	6	2001170	2001175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_007761	TCC	2	6	2009292	2009297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_007761	CGCA	2	8	2009439	2009446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_007761	TGT	2	6	2012686	2012691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_007761	TCG	2	6	2012805	2012810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_007761	CA	3	6	2012839	2012844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_007761	AGG	2	6	2012890	2012895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_007761	CACC	2	8	2014759	2014766	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5523	NC_007761	GAA	2	6	2014773	2014778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_007761	T	6	6	2016102	2016107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_007761	AACG	2	8	2016128	2016135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_007761	T	6	6	2016535	2016540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_007761	TTC	2	6	2016605	2016610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_007761	AGGG	2	8	2016647	2016654	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_007761	GGGA	2	8	2017710	2017717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_007761	AC	3	6	2021745	2021750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_007761	GCC	2	6	2023210	2023215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_007761	ATC	2	6	2023267	2023272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_007761	GAT	2	6	2023798	2023803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_007761	GCTT	2	8	2024818	2024825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_007761	T	6	6	2024824	2024829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_007761	GCC	2	6	2025458	2025463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_007761	A	6	6	2027727	2027732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_007761	TCCGA	2	10	2027740	2027749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5539	NC_007761	AAT	2	6	2027784	2027789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_007761	ATTTG	2	10	2027820	2027829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_007761	CTC	2	6	2031432	2031437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_007761	CCT	3	9	2031450	2031458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_007761	CCG	2	6	2031467	2031472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_007761	CAAA	2	8	2031532	2031539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_007761	GCC	2	6	2031587	2031592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_007761	TGC	2	6	2031612	2031617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_007761	GAG	2	6	2031748	2031753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_007761	CCG	2	6	2031785	2031790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_007761	GCG	2	6	2031808	2031813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_007761	CGG	2	6	2031921	2031926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_007761	GGC	2	6	2031961	2031966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_007761	CAC	2	6	2032699	2032704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_007761	TTC	2	6	2032742	2032747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_007761	AAG	2	6	2032757	2032762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_007761	GAG	2	6	2032805	2032810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_007761	AGC	2	6	2032852	2032857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_007761	TTG	2	6	2032858	2032863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_007761	GATC	2	8	2032917	2032924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_007761	CGT	2	6	2034105	2034110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_007761	TCGG	2	8	2034148	2034155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_007761	GGCG	2	8	2034158	2034165	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_007761	AG	3	6	2034181	2034186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_007761	CCG	3	9	2037829	2037837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_007761	CGC	2	6	2037838	2037843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_007761	CGG	2	6	2038756	2038761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_007761	TGC	2	6	2038770	2038775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_007761	TTGA	2	8	2038794	2038801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_007761	AAAG	2	8	2038831	2038838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_007761	GCG	2	6	2038841	2038846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_007761	ATC	2	6	2039136	2039141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_007761	GCC	2	6	2039148	2039153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_007761	CG	3	6	2040525	2040530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_007761	CTG	2	6	2040532	2040537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_007761	TCT	2	6	2040570	2040575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_007761	GC	3	6	2040592	2040597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_007761	CG	3	6	2040632	2040637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_007761	CGG	2	6	2041574	2041579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_007761	T	6	6	2042182	2042187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_007761	GGC	2	6	2042204	2042209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_007761	CGT	2	6	2042239	2042244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_007761	CAA	2	6	2042270	2042275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_007761	GGT	2	6	2042290	2042295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_007761	GTC	2	6	2042297	2042302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_007761	CGC	2	6	2046480	2046485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_007761	CGG	2	6	2046501	2046506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_007761	TGG	2	6	2046521	2046526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_007761	TGC	2	6	2046534	2046539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_007761	AGG	2	6	2046542	2046547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_007761	CGG	2	6	2048599	2048604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_007761	TC	3	6	2049372	2049377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_007761	TGCG	2	8	2049437	2049444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5592	NC_007761	GCCT	2	8	2049526	2049533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_007761	AAT	2	6	2049655	2049660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_007761	GCT	2	6	2050910	2050915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_007761	CCGG	2	8	2050960	2050967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_007761	TGGA	2	8	2050978	2050985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_007761	CTG	2	6	2051037	2051042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_007761	A	6	6	2051085	2051090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_007761	A	6	6	2051097	2051102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_007761	CTCA	2	8	2052064	2052071	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_007761	GGTA	2	8	2052093	2052100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_007761	T	7	7	2052126	2052132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_007761	GAG	2	6	2052143	2052148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_007761	CAA	2	6	2052184	2052189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_007761	CTG	2	6	2052193	2052198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_007761	CGC	2	6	2052281	2052286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_007761	TCA	2	6	2052291	2052296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_007761	TCG	2	6	2052315	2052320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_007761	GTA	2	6	2053406	2053411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_007761	AG	3	6	2053499	2053504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_007761	TGA	2	6	2053512	2053517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_007761	CTT	2	6	2053584	2053589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_007761	T	6	6	2053696	2053701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_007761	TCT	2	6	2053716	2053721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_007761	TTG	2	6	2053748	2053753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_007761	TC	3	6	2053771	2053776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_007761	TGC	2	6	2053814	2053819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_007761	GTT	2	6	2053893	2053898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_007761	GCC	2	6	2053946	2053951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_007761	GGGC	2	8	2053991	2053998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_007761	GAA	2	6	2054027	2054032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_007761	GAG	2	6	2054195	2054200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_007761	TGCC	2	8	2055281	2055288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_007761	GGT	2	6	2055323	2055328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_007761	CAT	3	9	2055907	2055915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_007761	GT	3	6	2056874	2056879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_007761	CGG	2	6	2057066	2057071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_007761	GAA	2	6	2057107	2057112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_007761	AGCA	2	8	2057126	2057133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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