MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	AAGGC	2	10	9619	9628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007643	TTGCG	2	10	17238	17247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007643	GAAGG	2	10	17340	17349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007643	CTCCG	2	10	18417	18426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007643	TTTGG	2	10	29687	29696	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007643	GGATC	2	10	32849	32858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007643	TTGCC	2	10	45222	45231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007643	CGGCG	2	10	48692	48701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007643	GACCG	2	10	53720	53729	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007643	GGAAG	2	10	57646	57655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007643	TGCGG	2	10	57760	57769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007643	CGGAA	2	10	64924	64933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007643	GAAAG	2	10	65991	66000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007643	CGTCC	2	10	85134	85143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007643	CGGAC	2	10	89535	89544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007643	TCGGA	2	10	94317	94326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007643	TGGGG	2	10	105534	105543	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007643	CGCTT	2	10	117463	117472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007643	TAAAG	2	10	139831	139840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007643	GATGG	2	10	144244	144253	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007643	GGGGC	2	10	149854	149863	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007643	TCCCC	2	10	151321	151330	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_007643	GGTGC	2	10	163077	163086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007643	AGTTT	2	10	180373	180382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007643	TCCTC	2	10	187235	187244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007643	TCGTG	2	10	193532	193541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007643	GGGCT	2	10	193678	193687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007643	AGAGG	2	10	196493	196502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007643	ACACA	2	10	197605	197614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007643	ATCCC	2	10	197678	197687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_007643	GACGC	2	10	206114	206123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007643	GTCCC	2	10	210103	210112	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_007643	TCCGG	2	10	211058	211067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007643	GCGGG	2	10	211219	211228	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007643	CCCGC	2	10	213950	213959	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
36	NC_007643	CTAGC	2	10	225894	225903	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007643	GGATG	2	10	226127	226136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007643	ACCGC	2	10	226810	226819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_007643	GGCTT	2	10	233171	233180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007643	TCAGA	2	10	237681	237690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007643	AGCGT	2	10	248368	248377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007643	CACGC	2	10	253222	253231	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007643	CTTGC	2	10	254337	254346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007643	GGCGC	2	10	256064	256073	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007643	CCGGC	2	10	269938	269947	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007643	CGGGG	2	10	285212	285221	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007643	TCGGG	2	10	285296	285305	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007643	TTCCG	2	10	290210	290219	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007643	TGGGG	2	10	306659	306668	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007643	CGCGG	2	10	307199	307208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007643	GCGCC	2	10	327216	327225	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007643	GGTTG	2	10	341093	341102	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007643	ACCGT	2	10	341938	341947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007643	AGGGG	2	10	342649	342658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007643	CCTGG	2	10	347559	347568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007643	GGGAT	2	10	356034	356043	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007643	GGCCG	2	10	368646	368655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007643	CCACT	2	10	371441	371450	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_007643	CGAAA	2	10	377028	377037	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007643	CGAAA	2	10	396064	396073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007643	AAGCC	2	10	406927	406936	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007643	GCGCC	2	10	410531	410540	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007643	TCGTG	2	10	410981	410990	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007643	GAGGT	2	10	421912	421921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007643	CGCGT	2	10	423754	423763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007643	GAGAT	2	10	423938	423947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007643	CGCCC	2	10	426219	426228	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_007643	GCACG	2	10	427063	427072	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007643	CGGCG	2	10	427159	427168	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007643	AGCGG	2	10	430594	430603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007643	ATTCC	2	10	450063	450072	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007643	CTGGT	2	10	450757	450766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007643	GGGCG	2	10	455015	455024	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007643	CGAAG	2	10	470976	470985	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007643	CAGGG	2	10	471002	471011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007643	CGGGG	2	10	471121	471130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007643	CCCGG	2	10	476917	476926	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_007643	AAAGG	2	10	487134	487143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007643	GGTCG	2	10	491479	491488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007643	CGGGG	2	10	499575	499584	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007643	GCGCC	2	10	502165	502174	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_007643	AAGGC	2	10	509180	509189	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007643	AGAGG	2	10	518453	518462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007643	GAGAA	2	10	527111	527120	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007643	GGGAC	2	10	530536	530545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007643	GCCCC	2	10	538403	538412	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
87	NC_007643	AACAA	2	10	538953	538962	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007643	GGCGA	2	10	546367	546376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007643	GGGAA	2	10	551597	551606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007643	GCGCC	2	10	551758	551767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_007643	CCGGG	2	10	567173	567182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007643	GGCGA	2	10	593649	593658	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007643	TCGTC	2	10	617149	617158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007643	CGCGG	2	10	627248	627257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007643	CGGGG	2	10	648051	648060	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007643	ATCGG	2	10	656899	656908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007643	ACGGC	2	10	661121	661130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007643	GTCCT	2	10	672321	672330	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007643	CGGGG	2	10	687148	687157	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007643	GGTGG	2	10	689908	689917	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007643	AAAGG	2	10	698414	698423	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007643	GCTTC	2	10	702496	702505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007643	CGCGC	2	10	708267	708276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007643	AAGGA	2	10	709585	709594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007643	GCCGA	2	10	710411	710420	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007643	GACGG	2	10	719927	719936	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007643	CGGTG	2	10	724175	724184	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007643	GGAGA	2	10	730036	730045	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007643	CGGTA	2	10	742658	742667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007643	CGACG	2	10	744018	744027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007643	CAAGC	2	10	751028	751037	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_007643	CCCGG	2	10	753503	753512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_007643	AAACG	2	10	758958	758967	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007643	AGGGG	2	10	804017	804026	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007643	CCGGG	2	10	810995	811004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007643	CCGGG	2	10	835103	835112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007643	GAGGG	2	10	838404	838413	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007643	GCTTG	2	10	845578	845587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007643	GGGCG	2	10	847858	847867	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007643	GCCTT	2	10	865223	865232	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007643	GCGGA	2	10	869885	869894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007643	GCCCG	2	10	881205	881214	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007643	AAGGG	2	10	891387	891396	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007643	CTTCC	2	10	895477	895486	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_007643	AGGCG	2	10	902269	902278	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007643	TTTTA	2	10	902975	902984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007643	AAGAT	2	10	910420	910429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007643	TCGTG	2	10	912402	912411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007643	GGGCT	2	10	912548	912557	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007643	AGAGG	2	10	915360	915369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007643	ACACA	2	10	916471	916480	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007643	ATCCC	2	10	916544	916553	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_007643	ATTTG	2	10	926398	926407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007643	CGTCC	2	10	931063	931072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_007643	GCTTT	2	10	951448	951457	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007643	CGGGG	2	10	951577	951586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007643	CGGGT	2	10	953514	953523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007643	CTTTT	2	10	953597	953606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007643	CGGTT	2	10	958962	958971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007643	GGGTC	2	10	960440	960449	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007643	CGGCC	2	10	968784	968793	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_007643	TCGGA	2	10	968849	968858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007643	GCCGC	2	10	969033	969042	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_007643	AGCAC	2	10	969239	969248	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007643	AGCCG	2	10	969584	969593	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007643	GCGGG	2	10	969754	969763	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007643	TTCCC	2	10	981286	981295	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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149	NC_007643	GCGCG	2	10	1002283	1002292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_007643	GGGAT	2	10	2093309	2093318	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007643	GCCGC	2	10	2094581	2094590	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
284	NC_007643	ATACG	2	10	2110791	2110800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_007643	ACCTA	2	10	2127301	2127310	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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459	NC_007643	CGGGG	2	10	3543018	3543027	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_007643	TCCCC	2	10	3561266	3561275	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
462	NC_007643	GAATC	2	10	3570457	3570466	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
463	NC_007643	GGCAA	2	10	3611161	3611170	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
464	NC_007643	CCGAC	2	10	3617114	3617123	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
465	NC_007643	GCCGT	2	10	3622346	3622355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
466	NC_007643	CCGGC	2	10	3628969	3628978	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
467	NC_007643	GCGCC	2	10	3649475	3649484	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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473	NC_007643	GGGGA	2	10	3722826	3722835	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
474	NC_007643	CGATA	2	10	3725481	3725490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
475	NC_007643	CCTTT	2	10	3753632	3753641	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
476	NC_007643	GCGGA	2	10	3768459	3768468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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491	NC_007643	TCCCG	2	10	3853126	3853135	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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499	NC_007643	TCGGT	2	10	3903161	3903170	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_007643	CTTTT	2	10	3903239	3903248	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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