MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007643	ATG	2	6	1241892	1241897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_007643	GGT	2	6	1241910	1241915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_007643	GCCA	2	8	1241966	1241973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_007643	TC	3	6	1241980	1241985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_007643	AGG	2	6	1242039	1242044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_007643	CGT	2	6	1243107	1243112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_007643	G	6	6	1243118	1243123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_007643	GC	3	6	1243191	1243196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_007643	TCA	2	6	1243201	1243206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_007643	GCCG	2	8	1243208	1243215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_007643	CCG	2	6	1243252	1243257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_007643	CG	3	6	1244897	1244902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_007643	GATT	2	8	1244906	1244913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007643	TCG	2	6	1244935	1244940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_007643	GCC	2	6	1245758	1245763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_007643	GT	3	6	1247345	1247350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_007643	CCG	2	6	1247467	1247472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_007643	GCG	2	6	1247548	1247553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_007643	A	6	6	1248917	1248922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_007643	C	6	6	1248940	1248945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3521	NC_007643	TCGG	2	8	1248952	1248959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_007643	CTTC	2	8	1249607	1249614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_007643	TCC	2	6	1249664	1249669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_007643	CAGG	2	8	1249695	1249702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_007643	CGGG	2	8	1249728	1249735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_007643	GC	4	8	1250882	1250889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_007643	GAC	2	6	1250993	1250998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007643	GAC	2	6	1251038	1251043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_007643	GGA	2	6	1251061	1251066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_007643	GC	3	6	1251075	1251080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_007643	CGCCCG	2	12	1251094	1251105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_007643	CGC	2	6	1251115	1251120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_007643	CGC	2	6	1251139	1251144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_007643	CCTA	2	8	1251192	1251199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_007643	TCA	2	6	1251244	1251249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_007643	GA	3	6	1253531	1253536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_007643	GGC	2	6	1254565	1254570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_007643	CTTTT	2	10	1254571	1254580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3539	NC_007643	GCACC	2	10	1254586	1254595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3540	NC_007643	GGA	2	6	1254622	1254627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_007643	GGGTG	2	10	1255602	1255611	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_007643	GAT	2	6	1255667	1255672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_007643	GTT	2	6	1255745	1255750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_007643	G	6	6	1255751	1255756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_007643	ACT	2	6	1256441	1256446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_007643	GA	3	6	1256516	1256521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_007643	GCC	2	6	1260044	1260049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_007643	GCG	2	6	1260056	1260061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_007643	TCC	2	6	1260548	1260553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_007643	CAC	2	6	1260577	1260582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_007643	CCGA	2	8	1260601	1260608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_007643	G	6	6	1260755	1260760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_007643	TCT	2	6	1262839	1262844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_007643	GCG	2	6	1262852	1262857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_007643	AGG	2	6	1262936	1262941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_007643	TGC	2	6	1263078	1263083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_007643	CGA	2	6	1263087	1263092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_007643	T	6	6	1263131	1263136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_007643	G	8	8	1263433	1263440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_007643	GC	3	6	1263461	1263466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_007643	CGG	2	6	1263471	1263476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_007643	CGG	2	6	1264626	1264631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_007643	T	6	6	1265980	1265985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_007643	ACCCAC	2	12	1266019	1266030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_007643	TTC	2	6	1266047	1266052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007643	CAT	2	6	1266053	1266058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_007643	CCG	2	6	1266068	1266073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_007643	AGGG	2	8	1266111	1266118	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_007643	GCC	2	6	1267647	1267652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_007643	GCG	2	6	1267660	1267665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_007643	GGT	2	6	1267707	1267712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_007643	CGC	2	6	1268589	1268594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_007643	CG	3	6	1268625	1268630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_007643	GGT	2	6	1268649	1268654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_007643	GCG	2	6	1268664	1268669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_007643	TCC	2	6	1272259	1272264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_007643	GCG	2	6	1272278	1272283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_007643	GCG	2	6	1272298	1272303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_007643	CCA	2	6	1272315	1272320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_007643	CGT	3	9	1272331	1272339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_007643	GTC	2	6	1272361	1272366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_007643	CCG	2	6	1272402	1272407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_007643	AAAG	2	8	1272420	1272427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_007643	GCG	2	6	1272476	1272481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_007643	CGT	3	9	1272485	1272493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_007643	GGCGA	2	10	1272622	1272631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_007643	CGA	2	6	1272641	1272646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_007643	CAC	2	6	1272657	1272662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_007643	TTG	2	6	1273910	1273915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_007643	GAA	2	6	1274253	1274258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_007643	GCA	2	6	1274658	1274663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_007643	G	6	6	1274690	1274695	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007643	CTGTCC	2	12	1274696	1274707	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_007643	G	6	6	1274827	1274832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_007643	CCCG	2	8	1274855	1274862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3597	NC_007643	ATC	2	6	1276461	1276466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_007643	CGGC	2	8	1276503	1276510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_007643	GCC	2	6	1276585	1276590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_007643	CCA	2	6	1276592	1276597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_007643	CG	3	6	1276629	1276634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_007643	GGC	2	6	1276640	1276645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007643	TCT	2	6	1282720	1282725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_007643	GCC	2	6	1282747	1282752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_007643	CGGA	2	8	1282803	1282810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_007643	CT	3	6	1282820	1282825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_007643	GGC	2	6	1282838	1282843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_007643	CCCG	2	8	1282844	1282851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3609	NC_007643	GA	4	8	1282890	1282897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_007643	GC	4	8	1282905	1282912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_007643	GC	3	6	1282920	1282925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_007643	TCC	2	6	1282965	1282970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_007643	AAGG	2	8	1284308	1284315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_007643	GT	3	6	1284378	1284383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_007643	GCCG	2	8	1284403	1284410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_007643	CCG	2	6	1284423	1284428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_007643	CGG	2	6	1284951	1284956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_007643	CGGC	2	8	1284958	1284965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_007643	GCC	2	6	1284980	1284985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_007643	G	6	6	1285002	1285007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_007643	CGT	2	6	1285048	1285053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_007643	GTT	2	6	1285153	1285158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_007643	CG	3	6	1285312	1285317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_007643	GAA	2	6	1285340	1285345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_007643	GAG	2	6	1285348	1285353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_007643	GGC	2	6	1287620	1287625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_007643	ACCC	2	8	1287640	1287647	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3628	NC_007643	GCC	2	6	1287656	1287661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_007643	TTG	2	6	1287670	1287675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_007643	ATC	2	6	1287688	1287693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_007643	ACGC	2	8	1290882	1290889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3762	NC_007643	TCGA	2	8	1337419	1337426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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