MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007643	TGAACA	2	12	1855911	1855922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5002	NC_007643	T	6	6	1855942	1855947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_007643	GCG	2	6	1856001	1856006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_007643	CGG	2	6	1856013	1856018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_007643	A	6	6	1856070	1856075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_007643	CCTT	2	8	1856714	1856721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_007643	CCG	2	6	1856727	1856732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_007643	GAC	2	6	1856740	1856745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_007643	GCGCG	2	10	1858087	1858096	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5010	NC_007643	GCC	2	6	1858129	1858134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_007643	CGG	2	6	1861276	1861281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_007643	TCG	2	6	1861287	1861292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_007643	GCC	2	6	1861770	1861775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_007643	GGCG	2	8	1861779	1861786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_007643	GCC	2	6	1861815	1861820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_007643	G	7	7	1865366	1865372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_007643	CGG	2	6	1867200	1867205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_007643	TCG	2	6	1867282	1867287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_007643	GGA	2	6	1869073	1869078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_007643	GGC	2	6	1870177	1870182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_007643	CCT	2	6	1870195	1870200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_007643	CAC	2	6	1870236	1870241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_007643	CAGGG	2	10	1871170	1871179	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_007643	C	7	7	1871180	1871186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5025	NC_007643	GGC	2	6	1871197	1871202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_007643	CGC	2	6	1871210	1871215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_007643	GCC	2	6	1871246	1871251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_007643	CCGAT	2	10	1871254	1871263	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5029	NC_007643	TCG	2	6	1871271	1871276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_007643	CCT	2	6	1871278	1871283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_007643	AG	3	6	1871354	1871359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_007643	GCC	2	6	1872333	1872338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_007643	CCGGC	2	10	1872359	1872368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5034	NC_007643	GTC	2	6	1872370	1872375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_007643	GAC	2	6	1872435	1872440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_007643	GCCG	2	8	1872444	1872451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_007643	CG	3	6	1872454	1872459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_007643	CGG	2	6	1874557	1874562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_007643	ATC	2	6	1874578	1874583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5041	NC_007643	CG	3	6	1876681	1876686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_007643	CCG	2	6	1876695	1876700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_007643	GTC	2	6	1876704	1876709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_007643	GAT	2	6	1876728	1876733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_007643	CGG	2	6	1877934	1877939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5049	NC_007643	CGG	2	6	1880984	1880989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5051	NC_007643	CGG	2	6	1881003	1881008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_007643	CGC	2	6	1881069	1881074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_007643	C	6	6	1881595	1881600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5054	NC_007643	ATTTAG	2	12	1884515	1884526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_007643	T	7	7	1884639	1884645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_007643	T	6	6	1886072	1886077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_007643	CGG	2	6	1886084	1886089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5062	NC_007643	CGG	2	6	1887624	1887629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_007643	GT	3	6	1887640	1887645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5068	NC_007643	G	7	7	1890771	1890777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_007643	CCA	2	6	1907899	1907904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5093	NC_007643	C	6	6	1908103	1908108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5100	NC_007643	GGCG	2	8	1910530	1910537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_007643	ATC	2	6	1910563	1910568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_007643	GGGC	2	8	1910635	1910642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_007643	CG	3	6	1910648	1910653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_007643	GC	3	6	1910683	1910688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_007643	T	7	7	1910698	1910704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5108	NC_007643	G	7	7	1911699	1911705	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5112	NC_007643	CTT	2	6	1912584	1912589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007643	TAAG	2	8	1912724	1912731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_007643	TCCT	2	8	1912739	1912746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_007643	TAA	2	6	1912747	1912752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_007643	A	6	6	1914398	1914403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_007643	GAG	2	6	1914426	1914431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_007643	GGCA	2	8	1914497	1914504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_007643	G	6	6	1914526	1914531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_007643	CGG	5	15	1914579	1914593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_007643	GGA	2	6	1914655	1914660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007643	GCC	2	6	1914706	1914711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_007643	GCAGG	2	10	1914834	1914843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_007643	GCG	2	6	1914847	1914852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_007643	GCCC	2	8	1914943	1914950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5126	NC_007643	CGGG	2	8	1914961	1914968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_007643	GGC	2	6	1914973	1914978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_007643	T	8	8	1915790	1915797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_007643	GGCA	2	8	1915802	1915809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_007643	CCT	2	6	1915863	1915868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_007643	AGGT	2	8	1915901	1915908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_007643	GGC	2	6	1915928	1915933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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