MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 1

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007493	GCCAGC	2	12	1783	1794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007493	TCCGGG	2	12	4338	4349	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007493	CCGAGG	2	12	42263	42274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007493	GCCGCG	2	12	45527	45538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007493	TCTGCC	2	12	55346	55357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007493	CCGGAA	2	12	142262	142273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007493	GGCTTG	2	12	147526	147537	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007493	GCCCGC	2	12	189231	189242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007493	CGGCCC	2	12	196012	196023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007493	CCGGGC	2	12	199555	199566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007493	TCTGGA	2	12	215900	215911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007493	CTGCGG	2	12	216904	216915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007493	CTTGTT	2	12	247437	247448	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007493	CCGGTG	2	12	252237	252248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007493	GGCCGA	2	12	252755	252766	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007493	CCCCTG	2	12	289936	289947	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007493	TAAGGC	2	12	290388	290399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007493	CTTTTT	2	12	322305	322316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007493	GCGCTT	2	12	354666	354677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007493	TCTGGC	2	12	362577	362588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007493	ATGCGG	2	12	363672	363683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007493	CGGGTT	2	12	367743	367754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007493	GACCGT	2	12	369319	369330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007493	TTCCGC	2	12	393216	393227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007493	GGGGGC	2	12	433973	433984	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007493	GGGCGC	2	12	438074	438085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007493	GCCCTT	2	12	441275	441286	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007493	CGGTGC	2	12	459533	459544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007493	ACGATG	2	12	471610	471621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007493	CGGCCG	2	12	530368	530379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007493	CTGGCT	2	12	549074	549085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007493	CTCGAT	2	12	553756	553767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007493	GCCGGG	2	12	580671	580682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007493	GCGGTC	2	12	587021	587032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007493	GGTTCC	2	12	592296	592307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007493	GCTCCG	2	12	611930	611941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007493	GGCGCG	2	12	613599	613610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007493	GGCGCG	2	12	616337	616348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007493	GCCATG	2	12	629341	629352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007493	CTCTCC	2	12	706543	706554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007493	GGGCGC	2	12	726209	726220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007493	TTTTCG	2	12	799541	799552	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007493	CCCGCG	2	12	802091	802102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007493	TTGACG	2	12	815610	815621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007493	CGGCCC	2	12	827714	827725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007493	AGCACC	2	12	827748	827759	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007493	GCGGGG	2	12	834741	834752	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007493	CGTCCG	2	12	843818	843829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007493	GGCCGG	2	12	861276	861287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007493	CGGAGG	2	12	865018	865029	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007493	GCGCGG	2	12	885493	885504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007493	TGAGGT	2	12	897945	897956	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007493	CGAGGT	2	12	897957	897968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007493	GCAAGG	20	120	904404	904523	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007493	TTGGTG	2	12	904692	904703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007493	CGGGCG	2	12	905428	905439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007493	CCCGTT	2	12	905569	905580	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007493	TCACCC	2	12	914100	914111	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007493	TGCCGG	2	12	953854	953865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007493	ACCATT	2	12	972843	972854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007493	TTGATG	2	12	974904	974915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007493	AAGGGC	2	12	1023661	1023672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007493	ATGGCG	2	12	1141637	1141648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007493	TCACCC	2	12	1189945	1189956	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007493	AAGGGA	2	12	1204663	1204674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007493	CGGGCG	2	12	1218669	1218680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007493	TCCCGG	2	12	1224107	1224118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007493	GATGCG	2	12	1233344	1233355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007493	GCGGAG	2	12	1287893	1287904	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007493	AGGTGC	2	12	1288948	1288959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007493	GAACGG	2	12	1313962	1313973	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007493	TGCCAC	2	12	1314430	1314441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007493	CCCGGG	2	12	1320723	1320734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007493	CAGCCG	2	12	1326260	1326271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007493	GACCGC	2	12	1338702	1338713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007493	GCGGAC	2	12	1352098	1352109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007493	GCACCA	2	12	1352364	1352375	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007493	TCTCCA	2	12	1352878	1352889	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007493	CGGGCC	2	12	1386997	1387008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007493	GCGCGG	2	12	1399015	1399026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007493	CCGGCC	2	12	1399114	1399125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007493	GGTGCC	2	12	1411365	1411376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007493	CCGGCC	2	12	1435265	1435276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007493	AGGCGC	2	12	1459689	1459700	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007493	CCGGCC	2	12	1476440	1476451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007493	GGACGG	2	12	1479400	1479411	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007493	CCGGCC	2	12	1511259	1511270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007493	CCGCTC	2	12	1552363	1552374	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007493	CCTGTC	2	12	1559880	1559891	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007493	CCCTCT	2	12	1565878	1565889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007493	GCACCT	2	12	1601699	1601710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007493	GCCCGC	2	12	1660944	1660955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007493	CGGTCC	2	12	1671941	1671952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007493	CAAAAG	2	12	1678808	1678819	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007493	TGAAAT	2	12	1697885	1697896	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007493	GCGGGC	2	12	1721254	1721265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007493	GACGGC	2	12	1725576	1725587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007493	GCCCCT	2	12	1807502	1807513	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007493	GCGGGC	2	12	1848827	1848838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007493	GGCCGC	2	12	1855431	1855442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007493	CGAAGC	2	12	1877348	1877359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007493	GGCAAG	2	12	1893923	1893934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007493	GCCCCC	2	12	1913233	1913244	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
104	NC_007493	CCGAGA	2	12	1943460	1943471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007493	TCGGAA	2	12	2010389	2010400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007493	CCTGCC	2	12	2018430	2018441	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007493	GGCGCG	2	12	2028988	2028999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007493	TAGCGG	2	12	2036751	2036762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007493	CCGCCC	2	12	2078565	2078576	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_007493	CTGCCG	2	12	2083050	2083061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007493	GTGGCG	2	12	2083642	2083653	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007493	CCCTTT	2	12	2088569	2088580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007493	CGGGCG	2	12	2218255	2218266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007493	ACGAGG	2	12	2224294	2224305	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007493	GGCTTC	10	60	2228837	2228896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007493	CCCGAA	2	12	2235022	2235033	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007493	CTTCCA	2	12	2235886	2235897	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007493	CGGGGG	2	12	2279632	2279643	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007493	CCCCGC	2	12	2295835	2295846	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_007493	CGGGGC	2	12	2328896	2328907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007493	CGAGAT	2	12	2346350	2346361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007493	GGTTCA	2	12	2388543	2388554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007493	CCGGGC	2	12	2426051	2426062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007493	GCGCCC	2	12	2522104	2522115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007493	CCCGCT	2	12	2522392	2522403	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007493	CGCCCC	2	12	2531089	2531100	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_007493	GAGGCA	2	12	2537210	2537221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007493	CGCGCC	2	12	2563742	2563753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007493	CATTCC	2	12	2564322	2564333	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007493	CCTCCC	2	12	2565960	2565971	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_007493	GCCCGG	2	12	2569535	2569546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007493	GCATCT	2	12	2593522	2593533	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007493	GCCGAG	2	12	2593973	2593984	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007493	GGCCGA	2	12	2594120	2594131	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007493	CCCCCG	2	12	2594305	2594316	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
136	NC_007493	GAAGGG	2	12	2609383	2609394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007493	GCAGGA	2	12	2611599	2611610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_007493	GAACCG	2	12	2615529	2615540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007493	CCCGAG	2	12	2633222	2633233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007493	GGGCGC	2	12	2636252	2636263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007493	CCTTTC	2	12	2660648	2660659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007493	GGCGCG	2	12	2689703	2689714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007493	TTTCCG	2	12	2704873	2704884	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007493	CTCCGG	2	12	2769196	2769207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007493	AGGCCG	2	12	2832846	2832857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007493	TTGATA	2	12	2834239	2834250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007493	GCCGGG	2	12	2932961	2932972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007493	CCGAGG	2	12	2956989	2957000	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007493	AGATCG	2	12	2965198	2965209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_007493	CGGCCG	2	12	2965865	2965876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007493	GCGGCA	2	12	3082272	3082283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007493	ACGGAA	2	12	3161987	3161998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_007493	GCGGGA	2	12	3175142	3175153	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.