MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007491	ATCGA	2	10	13158	13167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007491	CGGAG	2	10	13705	13714	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007491	CTCCC	2	10	34100	34109	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_007491	TCCAG	2	10	51728	51737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007491	TTGCG	2	10	60901	60910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007491	CATGG	2	10	64761	64770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007491	CTGTC	2	10	69109	69118	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007491	TCCAG	2	10	73017	73026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007491	CAGTC	2	10	76733	76742	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007491	GCAAG	2	10	86577	86586	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007491	ACTCT	2	10	90856	90865	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007491	CACGG	2	10	95115	95124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007491	CTTGT	2	10	99755	99764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007491	TCGAA	2	10	101622	101631	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007491	CCCGT	2	10	135409	135418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007491	CTGCT	2	10	135507	135516	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007491	CGCGG	2	10	142098	142107	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007491	GCCTT	2	10	145991	146000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007491	AAGGA	2	10	157321	157330	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007491	AAACA	2	10	158429	158438	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007491	GCTTT	2	10	160941	160950	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007491	GCTCG	2	10	164756	164765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007491	AACCG	2	10	168672	168681	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007491	CTGCC	2	10	171080	171089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007491	GCGCC	2	10	174053	174062	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007491	GTCCG	2	10	178403	178412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007491	CGATG	2	10	178492	178501	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007491	CCGGA	2	10	184114	184123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007491	TGAAA	2	10	198844	198853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007491	GCGGA	2	10	205761	205770	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007491	GGCCG	2	10	211212	211221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007491	ACAGG	2	10	212087	212096	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007491	TCGAA	2	10	218287	218296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007491	ATGCG	2	10	218979	218988	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007491	ATCTG	2	10	224278	224287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007491	CAAGG	2	10	226725	226734	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007491	CGGCG	2	10	244138	244147	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007491	CTGGT	2	10	244407	244416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007491	ACCAG	2	10	246219	246228	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007491	GCGCC	2	10	251477	251486	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_007491	GAAAG	2	10	258743	258752	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007491	TGGGG	2	10	271286	271295	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007491	AGCGA	2	10	271526	271535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.