MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	TTTA	2	8	151	158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007490	GCCG	2	8	2281	2288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007490	GCCG	2	8	2557	2564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007490	GCCG	2	8	2694	2701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007490	GCCG	2	8	2969	2976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007490	CTGC	2	8	5547	5554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007490	GCCC	2	8	5838	5845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007490	GTCA	2	8	6711	6718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007490	CGTC	2	8	6875	6882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007490	TGCC	2	8	7038	7045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007490	CCGG	2	8	7123	7130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007490	GACC	2	8	7185	7192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007490	GGTG	2	8	8706	8713	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007490	AGGG	2	8	10970	10977	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007490	CTGC	2	8	11533	11540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007490	ACAA	2	8	12552	12559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007490	CATC	2	8	12842	12849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007490	CGAG	2	8	15151	15158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007490	CCGT	2	8	15272	15279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007490	TGCC	2	8	25938	25945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007490	CGAG	2	8	27134	27141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007490	CCGT	2	8	27255	27262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007490	CTCC	2	8	27989	27996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007490	GTCC	2	8	29916	29923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007490	ACGT	2	8	29971	29978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007490	GGCC	2	8	33563	33570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007490	TGAG	2	8	34277	34284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007490	TGAC	2	8	40070	40077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007490	GCTG	2	8	40140	40147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007490	AACT	2	8	40197	40204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007490	CGAA	2	8	40296	40303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007490	TCGG	2	8	40341	40348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007490	CATC	2	8	40362	40369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007490	AATC	2	8	40460	40467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007490	ACAA	2	8	46821	46828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007490	GCCG	2	8	53712	53719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007490	GGCT	2	8	54347	54354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007490	CCGC	2	8	54522	54529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_007490	GAAA	2	8	54904	54911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007490	GACG	2	8	54935	54942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007490	CCGG	2	8	56577	56584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007490	CGGC	2	8	56590	56597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007490	ATGC	2	8	61522	61529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007490	GGCG	2	8	62797	62804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007490	GCTC	2	8	62914	62921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007490	GGAC	2	8	63907	63914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007490	CGCT	2	8	66229	66236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007490	TGCG	2	8	66483	66490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007490	AGTC	2	8	66546	66553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007490	ACTG	2	8	67103	67110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007490	TCTG	2	8	67612	67619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007490	CAAT	2	8	85251	85258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007490	GATA	2	8	85498	85505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007490	CGCC	2	8	85673	85680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_007490	CGGC	2	8	86524	86531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007490	CAGC	2	8	92608	92615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007490	CGGG	2	8	92851	92858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007490	TCGT	2	8	92969	92976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007490	CTTG	2	8	93011	93018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007490	GAAG	2	8	99098	99105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007490	TCTG	2	8	100507	100514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007490	CTGT	2	8	100791	100798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.