MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	CGT	2	6	44	49	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007490	AAC	2	6	86	91	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007490	GCC	2	6	1078	1083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007490	GCC	2	6	1147	1152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007490	GCA	2	6	1168	1173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007490	GCA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007490	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007490	GCA	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007490	GCA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007490	GCA	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007490	CCG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007490	CGA	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007490	GCC	2	6	2132	2137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007490	GCA	2	6	2149	2154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007490	CGG	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007490	CTC	2	6	2259	2264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007490	TCG	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007490	CGG	2	6	2386	2391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007490	GCC	2	6	2424	2429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007490	TCG	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007490	CGG	2	6	2524	2529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007490	TCG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007490	GCG	2	6	2663	2668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007490	TCG	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007490	CGG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007490	GCC	2	6	2836	2841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007490	TCG	2	6	2920	2925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007490	CGG	2	6	2936	2941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007490	TAG	2	6	3138	3143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007490	GCC	2	6	4852	4857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007490	CTT	2	6	5217	5222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007490	GCG	2	6	5438	5443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007490	GGA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007490	CGC	2	6	5740	5745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007490	GAG	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007490	CTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007490	CCA	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007490	CTT	2	6	6228	6233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007490	ACC	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007490	AGG	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007490	CGG	2	6	6651	6656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007490	GCC	2	6	6675	6680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007490	CGA	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007490	CGG	2	6	6777	6782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007490	CCG	2	6	6789	6794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007490	CCG	2	6	6892	6897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007490	CGG	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007490	GCA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007490	GCG	2	6	7015	7020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007490	CTC	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007490	GCG	2	6	7153	7158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007490	GCC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007490	GGC	2	6	8591	8596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007490	CGG	2	6	8661	8666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007490	CCG	2	6	8727	8732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007490	GGA	2	6	11506	11511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007490	AAG	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007490	TGC	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007490	CAA	2	6	12780	12785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007490	CTT	2	6	14665	14670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007490	TGG	2	6	14843	14848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007490	CCG	2	6	14857	14862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007490	TGT	3	9	14882	14890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007490	CTG	2	6	14916	14921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007490	CTT	2	6	14924	14929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007490	GCT	2	6	14972	14977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007490	AAC	2	6	15201	15206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007490	TGA	2	6	15344	15349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007490	GGC	2	6	15478	15483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007490	CGG	2	6	15493	15498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007490	GCT	2	6	15638	15643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007490	TCT	2	6	15659	15664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007490	CAG	2	6	15726	15731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007490	ATC	2	6	15766	15771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007490	GCA	2	6	15781	15786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007490	GTC	2	6	15789	15794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007490	CAA	2	6	15854	15859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007490	GCG	2	6	15872	15877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007490	GCC	2	6	16107	16112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007490	CTT	2	6	16134	16139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007490	TTC	2	6	16217	16222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007490	TCG	2	6	16235	16240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007490	TGC	2	6	16280	16285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007490	GAA	2	6	16393	16398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007490	AGG	2	6	16506	16511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007490	CCA	3	9	18654	18662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007490	CAG	2	6	18701	18706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007490	GCG	2	6	19746	19751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007490	GAG	2	6	24124	24129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007490	ACC	2	6	24292	24297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007490	GTT	2	6	26759	26764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007490	ACC	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007490	AGG	2	6	26915	26920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007490	AAC	2	6	27184	27189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007490	GCC	2	6	27391	27396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007490	ACC	2	6	27414	27419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007490	GCC	2	6	27424	27429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007490	TCG	2	6	27520	27525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007490	AGG	2	6	27528	27533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007490	GCG	2	6	27537	27542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007490	TGC	2	6	27550	27555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007490	TCG	2	6	27565	27570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007490	GCC	2	6	27583	27588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007490	CGA	2	6	27593	27598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007490	CGA	2	6	27662	27667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007490	ACC	3	9	27673	27681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007490	GCT	2	6	27823	27828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007490	GCA	3	9	27849	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007490	CCG	2	6	27921	27926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007490	AGC	2	6	28059	28064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007490	CGG	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007490	CTG	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007490	GGA	2	6	30207	30212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007490	TCG	2	6	31189	31194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007490	CTA	2	6	31265	31270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007490	TGA	2	6	31441	31446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007490	CCG	2	6	31471	31476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007490	ACG	2	6	31490	31495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007490	AAG	2	6	31505	31510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007490	CGC	2	6	31615	31620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007490	AGG	2	6	31690	31695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007490	CGA	2	6	31696	31701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007490	TGG	2	6	31709	31714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007490	GTG	2	6	32133	32138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007490	GTG	2	6	32415	32420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007490	GCG	2	6	32445	32450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007490	GGC	2	6	32461	32466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007490	GGT	2	6	32567	32572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007490	GGT	2	6	32639	32644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007490	GGA	2	6	32780	32785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007490	CGC	2	6	32822	32827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007490	GAG	2	6	32832	32837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007490	ACC	2	6	32908	32913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007490	CGT	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007490	CTG	2	6	33114	33119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007490	GCT	2	6	33143	33148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007490	GGT	2	6	33287	33292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007490	CTG	2	6	33309	33314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007490	ACC	2	6	33348	33353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007490	TGC	2	6	33409	33414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007490	GGC	2	6	33431	33436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.