MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CG	3	6	181	186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007489	CG	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007489	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007489	TG	3	6	2285	2290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007489	GA	3	6	6120	6125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007489	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007489	CG	3	6	6304	6309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007489	GA	3	6	8563	8568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007489	CG	3	6	8593	8598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007489	CA	3	6	8638	8643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007489	AG	3	6	9037	9042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007489	GC	3	6	12155	12160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007489	CT	3	6	13669	13674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007489	GA	3	6	14172	14177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007489	CG	4	8	14984	14991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007489	CG	3	6	15670	15675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007489	CG	3	6	15680	15685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007489	GC	3	6	19074	19079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007489	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007489	GC	3	6	22978	22983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007489	CG	3	6	23000	23005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007489	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007489	AT	3	6	29567	29572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007489	CT	3	6	29683	29688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007489	TC	3	6	30311	30316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007489	GC	3	6	31288	31293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007489	GC	3	6	31351	31356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007489	TA	3	6	31580	31585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007489	TA	3	6	31593	31598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007489	CG	3	6	32736	32741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007489	GC	3	6	35485	35490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007489	CG	3	6	35789	35794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007489	CG	3	6	39174	39179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007489	CA	3	6	39409	39414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007489	AG	3	6	40085	40090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007489	GT	3	6	41680	41685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007489	GC	3	6	41827	41832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007489	GA	3	6	42428	42433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007489	GA	4	8	42720	42727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007489	GA	3	6	42739	42744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007489	AG	3	6	47270	47275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007489	GC	3	6	47754	47759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007489	GC	3	6	47872	47877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007489	GC	3	6	49008	49013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007489	GC	3	6	49537	49542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007489	CG	3	6	49701	49706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007489	GC	3	6	49998	50003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007489	CG	3	6	56377	56382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007489	GC	3	6	59663	59668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007489	GC	3	6	59801	59806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007489	CG	3	6	60497	60502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007489	CG	4	8	61045	61052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007489	GA	3	6	67124	67129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007489	CT	3	6	67242	67247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007489	GC	3	6	67590	67595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007489	AC	3	6	67703	67708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007489	GC	3	6	67771	67776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007489	GC	3	6	68080	68085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007489	GC	3	6	68600	68605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007489	CG	3	6	68992	68997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007489	AG	3	6	70094	70099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007489	AG	3	6	71292	71297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007489	CG	3	6	84485	84490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007489	AG	3	6	86456	86461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007489	GC	3	6	86960	86965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007489	GC	3	6	90929	90934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007489	GC	3	6	91363	91368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007489	CG	3	6	91676	91681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007489	AT	3	6	94559	94564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007489	GC	3	6	97073	97078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007489	CT	3	6	97764	97769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007489	GA	3	6	97774	97779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007489	CG	3	6	98409	98414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007489	GT	3	6	98655	98660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007489	TC	3	6	99034	99039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007489	AG	3	6	101237	101242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007489	CT	3	6	102213	102218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007489	CG	3	6	103457	103462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007489	CT	3	6	104401	104406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007489	TA	3	6	104528	104533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007489	AG	3	6	104564	104569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.