MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 478

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CGG	2	6	12	17	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007489	CCG	2	6	49	54	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007489	GCG	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007489	CGT	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007489	CCG	2	6	131	136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007489	CTC	2	6	207	212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007489	TGC	3	9	270	278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007489	TCC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007489	CCG	2	6	410	415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007489	GTC	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007489	GAG	2	6	690	695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007489	TCG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007489	CGT	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007489	AGC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007489	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007489	CGC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007489	GGT	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007489	GCC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007489	GCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007489	CAG	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007489	CGT	3	9	1340	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007489	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007489	GCC	2	6	1424	1429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007489	TCC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007489	GAG	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007489	GTC	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007489	GAG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007489	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007489	CCG	2	6	1760	1765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007489	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007489	CCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007489	AGG	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007489	CAG	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007489	AGC	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007489	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007489	GGC	2	6	2144	2149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007489	ATG	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007489	ACC	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007489	CCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007489	GCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007489	TAA	2	6	2337	2342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007489	ATA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007489	ATA	2	6	3013	3018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007489	CCG	2	6	6009	6014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007489	CTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007489	CGG	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007489	GCC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007489	GAA	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007489	GAT	2	6	6259	6264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007489	CGG	2	6	6327	6332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007489	GTC	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007489	GCC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007489	TCG	2	6	7726	7731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007489	GGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007489	CTT	2	6	7989	7994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007489	TCA	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007489	CAT	2	6	8138	8143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007489	GGC	2	6	8504	8509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007489	AGA	2	6	8554	8559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007489	GCA	2	6	8599	8604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007489	GGT	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007489	GAT	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007489	CGC	2	6	8774	8779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007489	GCC	2	6	9568	9573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007489	CGC	2	6	10214	10219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007489	CTC	2	6	10227	10232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007489	GTC	2	6	10234	10239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007489	GCC	2	6	10243	10248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007489	TAT	2	6	10404	10409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007489	AAC	2	6	10462	10467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007489	TCC	2	6	10469	10474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007489	AGG	2	6	10574	10579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007489	TCG	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007489	ATG	2	6	11229	11234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007489	GCC	2	6	11302	11307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007489	CGG	2	6	11328	11333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007489	GCC	2	6	11366	11371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007489	GCA	2	6	11448	11453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007489	TCC	2	6	11485	11490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007489	GCC	2	6	11499	11504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007489	AGC	2	6	13533	13538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007489	CAG	2	6	13601	13606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007489	GCC	2	6	13690	13695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007489	CGA	2	6	13699	13704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007489	CAC	2	6	14323	14328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007489	ATC	2	6	14356	14361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007489	GCT	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007489	GAA	2	6	14410	14415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007489	GCT	2	6	14433	14438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007489	CGG	2	6	14481	14486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007489	GTG	2	6	14489	14494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007489	CTG	2	6	14497	14502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007489	GCT	2	6	14517	14522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007489	GCC	2	6	14850	14855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007489	ATG	2	6	14963	14968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007489	GAT	2	6	15751	15756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007489	GGA	2	6	17846	17851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007489	GCC	2	6	18232	18237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007489	GCG	2	6	18880	18885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007489	GAG	2	6	18925	18930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007489	GAG	2	6	18966	18971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007489	CGC	2	6	18980	18985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007489	GCC	2	6	19019	19024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007489	TCC	2	6	19120	19125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007489	CGC	2	6	19172	19177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007489	GAA	2	6	19211	19216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007489	TCG	2	6	19234	19239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007489	CGT	2	6	19265	19270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007489	CGC	2	6	19278	19283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007489	AGG	2	6	19288	19293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007489	GCC	2	6	19345	19350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007489	GCC	2	6	21863	21868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007489	GCA	2	6	22992	22997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007489	GCG	2	6	23008	23013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007489	TCC	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007489	GGA	2	6	23030	23035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007489	CCG	2	6	23058	23063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007489	CGC	2	6	23109	23114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007489	ACC	2	6	23161	23166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007489	ACA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007489	GGA	2	6	25746	25751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007489	GGA	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007489	CCT	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007489	GGT	2	6	25815	25820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007489	GCC	2	6	25967	25972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007489	CTG	2	6	26001	26006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007489	AAC	2	6	28494	28499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007489	GGA	2	6	28555	28560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007489	TCG	2	6	28694	28699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007489	ACA	2	6	28805	28810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007489	GAA	2	6	28821	28826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007489	GGA	2	6	28827	28832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007489	CGG	2	6	28953	28958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007489	CCT	2	6	28987	28992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007489	GCC	2	6	29008	29013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007489	CGC	2	6	29031	29036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007489	CGC	2	6	29503	29508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007489	GCG	2	6	29699	29704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007489	AGA	2	6	30195	30200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007489	GCC	2	6	30209	30214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007489	GGC	2	6	30238	30243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007489	AGG	2	6	31268	31273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007489	GCC	2	6	31324	31329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.