MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	AGC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007486	GGA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007486	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007486	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007486	GTC	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007486	GCT	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007486	CGG	2	6	3178	3183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007486	GTG	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007486	AGA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007486	GTA	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007486	GAG	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007486	GAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007486	GAA	2	6	5444	5449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007486	CCG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007486	CGA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007486	AAC	2	6	16364	16369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007486	TTG	2	6	16995	17000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007486	CCT	2	6	17690	17695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007486	GGT	2	6	17696	17701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007486	GCC	2	6	24346	24351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007486	GGC	2	6	24362	24367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007486	TCC	2	6	24594	24599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007486	GAA	2	6	24627	24632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007486	ATG	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007486	TCG	2	6	27690	27695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007486	GCC	2	6	27855	27860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007486	GCC	2	6	27864	27869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007486	GCA	2	6	27955	27960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007486	CCG	2	6	27970	27975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007486	TCC	2	6	27993	27998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007486	GCG	2	6	28015	28020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007486	GCG	2	6	28624	28629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007486	ATC	2	6	28684	28689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007486	GAG	2	6	29312	29317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007486	TCG	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007486	CCG	2	6	30203	30208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007486	CGG	2	6	30226	30231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007486	CTG	2	6	30232	30237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007486	GGA	2	6	34360	34365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007486	GTG	2	6	39381	39386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007486	GGT	2	6	39389	39394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007486	TAG	2	6	47172	47177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007486	TCA	2	6	48758	48763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007486	GAT	2	6	48773	48778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007486	GCG	2	6	48855	48860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007486	CCG	2	6	48909	48914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007486	CCA	2	6	48940	48945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007486	CGA	2	6	49736	49741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007486	ATC	2	6	49783	49788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007486	AGC	2	6	49834	49839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007486	GTG	2	6	49840	49845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007486	CCG	2	6	49853	49858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007486	GGT	2	6	49978	49983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007486	TCC	2	6	53084	53089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007486	GCC	2	6	55634	55639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007486	CGC	2	6	55648	55653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007486	TCC	2	6	55713	55718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007486	GAC	2	6	55779	55784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007486	CGG	2	6	55947	55952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007486	CTT	2	6	55979	55984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007486	GAA	2	6	56090	56095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007486	ACG	2	6	56192	56197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007486	CGC	2	6	56398	56403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007486	GCC	2	6	56543	56548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007486	ACG	2	6	56564	56569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007486	TTC	2	6	56776	56781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007486	GGC	2	6	56850	56855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007486	CAT	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007486	CGC	2	6	57513	57518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007486	CAC	3	9	57561	57569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007486	GGC	2	6	59363	59368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007486	CGC	2	6	59387	59392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007486	TGG	2	6	59477	59482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007486	CTT	2	6	59627	59632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007486	TCG	2	6	59644	59649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007486	CTG	2	6	59656	59661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007486	CAG	2	6	59664	59669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007486	AGC	2	6	59677	59682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007486	GAA	2	6	59685	59690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007486	GGA	2	6	59693	59698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007486	TGC	2	6	59853	59858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007486	TGA	2	6	59910	59915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007486	AAT	2	6	59922	59927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007486	AGT	2	6	59989	59994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007486	AAG	2	6	62904	62909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007486	CAG	2	6	62932	62937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007486	CAC	2	6	63786	63791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007486	GAT	2	6	63874	63879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007486	GGT	2	6	63893	63898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007486	GTA	2	6	65268	65273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007486	CCG	2	6	65324	65329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007486	GTC	2	6	67360	67365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007486	GTG	2	6	68552	68557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007486	CGG	2	6	68569	68574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007486	CGT	2	6	68692	68697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007486	GTC	2	6	68725	68730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007486	CGG	2	6	70288	70293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007486	TCG	2	6	72236	72241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007486	GTG	2	6	73565	73570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007486	AGG	2	6	79346	79351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007486	TTG	2	6	79955	79960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007486	CCG	2	6	80019	80024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007486	CGT	2	6	80030	80035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007486	CGA	2	6	83252	83257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007486	CCG	2	6	83270	83275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007486	GAT	2	6	83283	83288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007486	AGG	2	6	83411	83416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007486	AAC	2	6	83457	83462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007486	CCG	2	6	83467	83472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007486	GAA	2	6	85130	85135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007486	GCA	2	6	85215	85220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007486	GAT	2	6	86305	86310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007486	ACC	2	6	86324	86329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007486	TCG	2	6	86354	86359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007486	GCA	2	6	87161	87166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007486	ACC	2	6	87172	87177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007486	CAA	2	6	87181	87186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007486	CGA	2	6	87222	87227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007486	CGC	2	6	87238	87243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007486	GCC	2	6	87383	87388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007486	CGG	2	6	88031	88036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007486	CGT	2	6	90138	90143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007486	AGG	2	6	90163	90168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007486	CGC	2	6	92721	92726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007486	GGA	2	6	92739	92744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007486	ACG	2	6	92774	92779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007486	AGC	2	6	92860	92865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007486	CCG	2	6	93890	93895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007486	CGG	2	6	93899	93904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007486	GGA	2	6	93906	93911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007486	AGC	2	6	93917	93922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007486	CTT	2	6	94462	94467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007486	GAT	2	6	95826	95831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007486	CAG	2	6	95854	95859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007486	AAC	2	6	95901	95906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007486	ACG	2	6	97438	97443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007486	GCG	2	6	97447	97452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007486	CCA	2	6	97906	97911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007486	AAG	2	6	97912	97917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007486	CTG	2	6	97948	97953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007486	TCA	2	6	97988	97993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007486	GGC	2	6	98159	98164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007486	CCT	2	6	98864	98869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007486	CCA	2	6	98874	98879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007486	GTC	2	6	98942	98947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007486	CCA	2	6	99803	99808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_007486	CAT	2	6	99936	99941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007486	CGT	2	6	99993	99998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007486	CCA	2	6	100010	100015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_007486	ACG	3	9	100132	100140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007486	GCT	2	6	100148	100153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007486	ATC	2	6	100188	100193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007486	CCG	2	6	100244	100249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_007486	CCA	2	6	100256	100261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_007486	CGA	2	6	100264	100269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_007486	CGG	2	6	100327	100332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007486	CGG	2	6	100434	100439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007486	GGC	2	6	100456	100461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007486	CCG	2	6	100547	100552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_007486	ACG	2	6	100666	100671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007486	ACT	2	6	100714	100719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_007486	AGA	2	6	101258	101263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007486	GTG	2	6	103960	103965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007486	GGA	2	6	103969	103974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.