MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 chromosome 2

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007348	GTGCCG	2	12	2740	2751	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007348	GAGGCG	2	12	2821	2832	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007348	TGGGAC	2	12	2955	2966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007348	TTGTCT	2	12	8129	8140	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007348	CGCTAT	2	12	34643	34654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007348	GATCAG	2	12	91905	91916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007348	GGGTTG	2	12	115186	115197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007348	CTGCGG	2	12	121905	121916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007348	TGCCAA	2	12	147815	147826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007348	AAATCG	2	12	162325	162336	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007348	CGCCAG	2	12	186159	186170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007348	TGTTTT	2	12	190555	190566	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007348	GGGAAC	2	12	190684	190695	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007348	CGGCAC	2	12	219126	219137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007348	TACCTG	2	12	236002	236013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007348	TTGCCG	2	12	276752	276763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007348	CTGCCG	2	12	323819	323830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007348	GCGCTC	2	12	341221	341232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007348	TGTATT	2	12	351253	351264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007348	CTGAAA	2	12	351329	351340	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007348	AACCCA	2	12	358028	358039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007348	AATCGT	2	12	403347	403358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007348	GGCGCA	2	12	432742	432753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007348	GATGGC	2	12	432780	432791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007348	CGCCGG	2	12	439412	439423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007348	CGTGCT	2	12	441832	441843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007348	GGCCAA	2	12	451354	451365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007348	CAATGC	2	12	469798	469809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007348	TATGGG	2	12	470821	470832	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007348	TGGCCA	2	12	499367	499378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007348	GCTGCC	2	12	526658	526669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007348	ACGCCG	2	12	569159	569170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007348	ATGTCG	2	12	587839	587850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007348	CCCTCG	2	12	733510	733521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007348	AGCCGC	2	12	759631	759642	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007348	GCGCAG	2	12	815994	816005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007348	CACCGG	2	12	857008	857019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007348	CAAGGA	2	12	887660	887671	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007348	TCCGGG	2	12	923608	923619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007348	TTCGGT	2	12	931705	931716	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007348	CGAAGA	2	12	939134	939145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007348	ACCAGT	2	12	952156	952167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007348	GCACCG	2	12	1009477	1009488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007348	GTTCTT	2	12	1021957	1021968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007348	GTCAGC	2	12	1045807	1045818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007348	CCGTCA	2	12	1053909	1053920	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007348	ACAAGC	2	12	1066869	1066880	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007348	CCTCGA	2	12	1075139	1075150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007348	ACCGTC	2	12	1174159	1174170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007348	CCGCCA	2	12	1184132	1184143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007348	TCCTGT	2	12	1188579	1188590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007348	CGCTGC	2	12	1269222	1269233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007348	CGCCAC	2	12	1306542	1306553	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007348	CAAGCG	2	12	1337703	1337714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007348	GTATTT	2	12	1349449	1349460	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007348	CTGGAG	2	12	1373772	1373783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007348	ATCCGG	2	12	1406029	1406040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007348	CGTCTC	2	12	1412323	1412334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007348	GGCACC	2	12	1433354	1433365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007348	CGACGC	2	12	1461835	1461846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007348	GCGCCC	2	12	1611218	1611229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007348	ACCTGA	2	12	1625389	1625400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007348	CTGGCG	2	12	1648372	1648383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007348	TTTGTC	2	12	1650179	1650190	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007348	GGCAGG	2	12	1695302	1695313	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007348	CTTTTT	2	12	1697142	1697153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007348	AGCCAT	2	12	1785799	1785810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007348	CGCCCC	2	12	1788492	1788503	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_007348	CCGGCG	2	12	1817743	1817754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007348	CCCGAC	2	12	1823321	1823332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007348	CGGCCA	2	12	1825882	1825893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007348	AGGCGG	2	12	1935255	1935266	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007348	GCCACC	2	12	2004106	2004117	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007348	TCGCTG	2	12	2048625	2048636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007348	CGAGTA	2	12	2048924	2048935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007348	CGACTA	4	24	2048936	2048959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007348	ATTCAG	2	12	2066971	2066982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007348	GCAGCC	2	12	2104049	2104060	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007348	GCATGG	2	12	2109536	2109547	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007348	ACGTAT	2	12	2110735	2110746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007348	TTCGGG	2	12	2111265	2111276	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007348	GTATCG	2	12	2111389	2111400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007348	TGGAAG	2	12	2151200	2151211	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007348	CCAGGT	2	12	2158158	2158169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007348	GAATCG	2	12	2160505	2160516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007348	ACCCGA	3	18	2165409	2165426	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007348	GGAAAT	2	12	2171444	2171455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007348	TCCGGT	2	12	2181383	2181394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007348	CTCTTT	2	12	2262440	2262451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007348	GCCAAA	2	12	2306271	2306282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007348	GCTAAC	2	12	2332449	2332460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007348	ACCGAT	2	12	2337943	2337954	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007348	CGCCTT	2	12	2423083	2423094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007348	TGCACG	2	12	2479371	2479382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007348	CTTCGA	2	12	2485583	2485594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007348	TGCCTT	2	12	2538246	2538257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007348	CAGCGC	2	12	2541014	2541025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007348	CCACGC	2	12	2616686	2616697	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007348	GGTTAT	2	12	2636672	2636683	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007348	TTTGGC	2	12	2704482	2704493	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007348	GCGATG	3	18	2715238	2715255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007348	ATTTTT	2	12	2726010	2726021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.